64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1611 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1611  phage transcriptional regulator, AlpA  100 
 
 		 74 aa  151  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0193561  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3477  phage transcriptional regulator, AlpA  53.06 
 
 		 60 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1968  phage transcriptional regulator, AlpA  48.08 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0901685  normal  0.059551 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3251  hypothetical protein  50 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0255  prophage CP4-57 regulatory  49.02 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.883107  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2725  hypothetical protein  58.54 
 
 		 48 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1256  phage transcriptional regulator, AlpA  46.3 
 
 		 64 aa  57  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1156  phage transcriptional regulator, AlpA  48.15 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3167  phage transcriptional regulator, AlpA  43.4 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.786341  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2991  hypothetical protein  43.55 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.120456  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3427  phage transcriptional regulator, AlpA  36.07 
 
 		 70 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2390  prophage CP4-57 regulatory protein (AlpA)  40 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179728  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2699  hypothetical protein  50.82 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000249583  hitchhiker  0.000191723 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1625  phage transcriptional regulator, AlpA  34.92 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.807663  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1777  phage transcriptional regulator, AlpA  42 
 
 		 73 aa  51.2  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.235945 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1424  phage transcriptional regulator, AlpA  36.84 
 
 		 61 aa  50.1  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.435044  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3119  phage transcriptional regulator, AlpA  38.89 
 
 		 58 aa  48.9  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000632591  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1227  phage transcriptional regulator, AlpA  35 
 
 		 78 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0127458  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1700  phage transcriptional regulator, AlpA  42 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.843747  normal  0.0591517 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2006  prophage regulatory protein AlpA family protein  35.71 
 
 		 72 aa  47.8  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0927823  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3429  DNA-binding protein, putative  30.51 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000259221  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3522  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 65 aa  47  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1363  AlpA family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 66 aa  46.2  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.129507  hitchhiker  0.00109178 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0999  phage transcriptional regulator, AlpA  43.86 
 
 		 57 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2246  prophage CP4-57 regulatory  40.82 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.422477 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0381  phage transcriptional regulator, AlpA  36.36 
 
 		 66 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000563179 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1496  phage transcriptional regulator, AlpA  37.74 
 
 		 64 aa  45.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1687  phage transcriptional regulator, AlpA  39.62 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0482  phage transcriptional regulator, AlpA  40.38 
 
 		 56 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2566  prophage CP4-57 regulatory  40.82 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0384  phage transcriptional regulator, AlpA  34.92 
 
 		 65 aa  45.4  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000580996 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0241  phage transcriptional regulator, AlpA  30.99 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2362  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.566785 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1562  phage transcriptional regulator, AlpA  40.82 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.544133  normal  0.10217 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3550  phage transcriptional regulator, AlpA  37.5 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1131  phage transcriptional regulator, AlpA  36 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.232619  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2153  phage transcriptional regulator, AlpA  35.71 
 
 		 81 aa  44.7  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0962  putative bacteriophage DNA-binding transcription regulator protein  30.65 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.907406 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1897  hypothetical protein  38 
 
 		 71 aa  44.3  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.088473  normal  0.90287 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1260  phage transcriptional regulator, AlpA  36 
 
 		 67 aa  44.3  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2070  hypothetical protein  48.78 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.21456  normal  0.582697 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3331  hypothetical protein  35.48 
 
 		 71 aa  43.9  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.323427  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2784  phage transcriptional regulator, AlpA  33.33 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.834885  normal  0.857348 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3994  phage transcriptional regulator, AlpA  35.48 
 
 		 78 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.168145  normal  0.273173 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0412  Phage transcriptional regulator, AlpA  36 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.338686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3709  phage transcriptional regulator, AlpA  38.78 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3697  phage transcriptional regulator, AlpA  38.78 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0664555  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17010  Prophage CP4-57 regulatory, AlpA-like protein  27.27 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6511  phage transcriptional regulator, AlpA  38.6 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1382  transcriptional regulator  29.41 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2749  phage transcriptional regulator, AlpA  36.73 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0154  phage transcriptional regulator, AlpA  31.48 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.77914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0440  Phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2907  hypothetical protein  32.14 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00184004 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2372  prophage CP4-57 regulatory  37.25 
 
 		 67 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.296006  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4755  phage transcriptional regulator, AlpA  34.43 
 
 		 60 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3413  phage transcriptional regulator, AlpA  36 
 
 		 71 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00533865 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04065  phage transcriptional regulator, AlpA  37.25 
 
 		 80 aa  41.6  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2662  Phage transcriptional regulator, AlpA  35.19 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.687834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1258  phage transcriptional regulator, AlpA  30.36 
 
 		 61 aa  40.8  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004310  phage transcriptional regulator AlpA  30 
 
 		 66 aa  40.4  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.207831  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2677  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003245  predicted transcriptional regulator  30.19 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0434  putative prophage CP4-57 regulatory protein  35.29 
 
 		 72 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0988805  normal  0.918772 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>