More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1585 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1585  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 
437 aa  895    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.637887  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0588  WD40 domain protein beta Propeller  48.2 
 
 
439 aa  437  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000301748  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3632  tolB protein, putative  49.3 
 
 
441 aa  411  1e-113  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000231281  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0278  WD40 domain-containing protein  44.06 
 
 
463 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000605867  unclonable  0.0000100324 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2360  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  46.99 
 
 
446 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.28939 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0858  WD40 domain protein beta Propeller  44.74 
 
 
439 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000315652  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  34.06 
 
 
438 aa  234  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  30.09 
 
 
443 aa  212  9e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  30.71 
 
 
457 aa  189  9e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0614  TolB protein, putative  30.41 
 
 
449 aa  187  4e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00377452  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  28.9 
 
 
440 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  34.23 
 
 
440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.23 
 
 
444 aa  179  7e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  28.64 
 
 
427 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  28.7 
 
 
427 aa  168  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  29.44 
 
 
435 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0750  WD40 domain protein beta Propeller  27.78 
 
 
441 aa  162  8.000000000000001e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257042  normal  0.0548288 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  25.97 
 
 
442 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  26.67 
 
 
432 aa  160  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  29.25 
 
 
428 aa  160  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  28.07 
 
 
429 aa  158  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal 
 
 
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  25.92 
 
 
444 aa  156  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  27 
 
 
443 aa  155  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  28.78 
 
 
446 aa  154  4e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  29.02 
 
 
432 aa  152  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.12 
 
 
430 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  27.01 
 
 
440 aa  151  2e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  28.85 
 
 
415 aa  151  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  28.11 
 
 
441 aa  151  3e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2050  translocation protein TolB  26.68 
 
 
429 aa  150  4e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  27.78 
 
 
421 aa  150  4e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2714  translocation protein TolB  27.59 
 
 
441 aa  150  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0459045  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.16 
 
 
407 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.62 
 
 
407 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  30.13 
 
 
421 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  26.83 
 
 
436 aa  146  8.000000000000001e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  24.89 
 
 
432 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  27.74 
 
 
438 aa  145  2e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  27.04 
 
 
426 aa  144  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  27 
 
 
425 aa  143  6e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  31.48 
 
 
445 aa  143  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  25.48 
 
 
450 aa  142  9e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3241  translocation protein TolB  26.98 
 
 
430 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.786429  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3119  translocation protein TolB  25.63 
 
 
439 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3203  translocation protein TolB  26.98 
 
 
430 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95129  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3256  translocation protein TolB  27.02 
 
 
463 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1373  translocation protein TolB  27.02 
 
 
463 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2081  translocation protein TolB  26.98 
 
 
433 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1949  translocation protein TolB  26.98 
 
 
433 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0827  translocation protein TolB  27.02 
 
 
463 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2661  translocation protein TolB  26.98 
 
 
431 aa  141  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.622452  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  25.7 
 
 
430 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  25.28 
 
 
428 aa  136  9e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  28.77 
 
 
435 aa  135  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01564  translocation protein TolB  26.15 
 
 
439 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188797  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  28.75 
 
 
434 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  30.07 
 
 
437 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  28.43 
 
 
434 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  29.79 
 
 
434 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  28.43 
 
 
434 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  28.71 
 
 
432 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  25.7 
 
 
431 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  29.45 
 
 
451 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  30.03 
 
 
434 aa  133  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  27.22 
 
 
440 aa  132  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  28.48 
 
 
424 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2748  translocation protein TolB  27.6 
 
 
442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  25 
 
 
431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  25 
 
 
430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  25.64 
 
 
430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  27.73 
 
 
442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2531  translocation protein TolB  27.89 
 
 
442 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000171266  normal  0.044306 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  25.96 
 
 
408 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2731  translocation protein TolB  27.3 
 
 
442 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00144802  decreased coverage  0.0000043993 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2217  translocation protein TolB  26.23 
 
 
436 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  27.22 
 
 
437 aa  132  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2368  translocation protein TolB  28.05 
 
 
442 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000751795  normal  0.188875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2440  translocation protein TolB  28.05 
 
 
442 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000137237  normal  0.263362 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  28.72 
 
 
441 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  27.38 
 
 
441 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  25.93 
 
 
431 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1785  translocation protein TolB  28.4 
 
 
442 aa  130  6e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000978843  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  29.57 
 
 
432 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1742  translocation protein TolB  28.4 
 
 
442 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000714613  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2538  translocation protein TolB  28.19 
 
 
442 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000186682  hitchhiker  0.0000162747 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  27.69 
 
 
446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1746  translocation protein TolB  28.4 
 
 
442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000149314  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  25.23 
 
 
431 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  28.31 
 
 
442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1607  translocation protein TolB  28.29 
 
 
442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000108344  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  26.23 
 
 
442 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  27.81 
 
 
451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  25.3 
 
 
403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.39 
 
 
422 aa  127  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  25.39 
 
 
422 aa  127  5e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4053  translocation protein TolB  27.07 
 
 
437 aa  125  1e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  24.77 
 
 
431 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  26.5 
 
 
442 aa  124  2e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  26.35 
 
 
440 aa  125  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0800  translocation protein TolB  24.53 
 
 
431 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665253  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>