More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1484 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  100 
 
 
390 aa  790  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  8.45672e-07 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  55.47 
 
 
390 aa  415  1e-115  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  48.43 
 
 
373 aa  378  1e-103  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  51.44 
 
 
373 aa  376  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  51.85 
 
 
373 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  1.96511e-08  decreased coverage  1.76162e-05 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  47.51 
 
 
373 aa  369  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  47.24 
 
 
373 aa  365  1e-100  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  50.66 
 
 
370 aa  362  6e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  47.34 
 
 
389 aa  362  9e-99  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  50 
 
 
377 aa  361  1e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  46.05 
 
 
386 aa  361  1e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  46.32 
 
 
386 aa  360  3e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  45.53 
 
 
388 aa  353  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  50.78 
 
 
369 aa  352  6e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  51.98 
 
 
388 aa  350  2e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  44.96 
 
 
380 aa  350  2e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  45.48 
 
 
391 aa  348  6e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  53.72 
 
 
380 aa  345  7e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  46.09 
 
 
379 aa  343  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  45.87 
 
 
389 aa  341  2e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  43.8 
 
 
390 aa  337  2e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  45.77 
 
 
371 aa  328  7e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  44.15 
 
 
398 aa  326  4e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  43.6 
 
 
392 aa  323  2e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  41.91 
 
 
390 aa  322  6e-87  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  43.08 
 
 
391 aa  318  8e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  42.67 
 
 
391 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  42.67 
 
 
391 aa  317  3e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  42.93 
 
 
391 aa  316  4e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  42.41 
 
 
391 aa  315  8e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  42.15 
 
 
391 aa  311  2e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  41.88 
 
 
391 aa  310  3e-83  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  41.88 
 
 
391 aa  310  3e-83  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  41.88 
 
 
391 aa  309  5e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  42.86 
 
 
370 aa  304  2e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  41.53 
 
 
408 aa  302  8e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  42.29 
 
 
395 aa  301  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  46.67 
 
 
851 aa  297  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  45.78 
 
 
375 aa  295  8e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  42.33 
 
 
380 aa  294  2e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  42.29 
 
 
403 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  40.84 
 
 
403 aa  286  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  41.22 
 
 
395 aa  285  1e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  40.58 
 
 
403 aa  283  3e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  43.92 
 
 
378 aa  276  7e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  42.41 
 
 
395 aa  274  2e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  40.67 
 
 
384 aa  270  3e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  42.33 
 
 
395 aa  270  3e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  40.68 
 
 
387 aa  269  6e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  40.84 
 
 
406 aa  267  3e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  44.44 
 
 
393 aa  266  6e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  41.27 
 
 
395 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  42.52 
 
 
384 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  40.15 
 
 
379 aa  264  2e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  38.42 
 
 
402 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  38.42 
 
 
395 aa  261  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  42.6 
 
 
433 aa  262  1e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  40.83 
 
 
389 aa  260  3e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  40.05 
 
 
387 aa  259  4e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  40.84 
 
 
441 aa  259  5e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  41.87 
 
 
811 aa  258  9e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  38.06 
 
 
402 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  40.57 
 
 
389 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  40.57 
 
 
389 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  40.57 
 
 
389 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  40.57 
 
 
389 aa  258  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  40.57 
 
 
389 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  40.31 
 
 
389 aa  256  5e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  40.52 
 
 
421 aa  256  6e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  41.8 
 
 
376 aa  255  9e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  40.31 
 
 
389 aa  255  9e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23341  alanine racemase  39.21 
 
 
398 aa  254  1e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  39.84 
 
 
389 aa  254  2e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  40.36 
 
 
389 aa  254  2e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  40 
 
 
382 aa  253  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  39.16 
 
 
434 aa  253  3e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  39.84 
 
 
389 aa  253  4e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  37.27 
 
 
364 aa  251  2e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1986  alanine racemase  39.63 
 
 
375 aa  249  5e-65  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.371384  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1701  alanine racemase  41.8 
 
 
367 aa  248  9e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  37.2 
 
 
369 aa  246  4e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  39.95 
 
 
380 aa  246  5e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2145  alanine racemase  39.21 
 
 
382 aa  245  1e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2107  alanine racemase  39.21 
 
 
382 aa  245  1e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0345  alanine racemase  39.52 
 
 
376 aa  244  1e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.605258  normal  0.144303 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2896  alanine racemase  40.9 
 
 
417 aa  243  4e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.644655  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0609  alanine racemase  42.51 
 
 
381 aa  243  5e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.561464  normal  0.417929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2981  alanine racemase  43.62 
 
 
844 aa  241  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1898  alanine racemase  42.02 
 
 
849 aa  239  7e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0368912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  37.02 
 
 
411 aa  238  1e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2606  alanine racemase  41.49 
 
 
437 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.45338e-06 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  37.24 
 
 
379 aa  237  2e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16471  alanine racemase  36.98 
 
 
381 aa  238  2e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.950833  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5375  alanine racemase  41.22 
 
 
402 aa  237  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0804  alanine racemase  44.47 
 
 
365 aa  236  5e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  37.07 
 
 
375 aa  235  8e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4045  alanine racemase  40.16 
 
 
376 aa  234  2e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43554  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4267  alanine racemase  41.49 
 
 
375 aa  233  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13457  alanine racemase  40.37 
 
 
408 aa  233  6e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0132184  hitchhiker  0.000185138 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  39.39 
 
 
379 aa  231  2e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>