243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1464 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1464  cytochrome c assembly protein  100 
 
 
275 aa  544  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.251359  normal  0.117747 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1749  cytochrome c assembly protein  54.81 
 
 
275 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0297  cytochrome c assembly protein  50.18 
 
 
275 aa  290  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.184276 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2024  cytochrome c assembly protein, putative  52.87 
 
 
274 aa  284  9e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.209197  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1617  cytochrome c assembly protein  45.04 
 
 
276 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.935625  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0960  cytochrome c assembly protein  39 
 
 
275 aa  162  7e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3065  cytochrome c biogenesis protein  39.08 
 
 
278 aa  161  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000253378  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1589  cytochrome c assembly protein  36.57 
 
 
240 aa  146  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0361  cytochrome c assembly protein  33.58 
 
 
271 aa  145  5e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000960033  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3232  cytochrome c assembly protein  33.84 
 
 
271 aa  142  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00268584  normal  0.260264 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3237  cytochrome c assembly protein  34.7 
 
 
279 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.30961  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.95 
 
 
271 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0600631  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0406  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.95 
 
 
271 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3283  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  33.98 
 
 
271 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2514  cytochrome c assembly protein  32.71 
 
 
284 aa  126  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000017273  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0547  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.97 
 
 
282 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2756  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  33.33 
 
 
283 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00415775  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2228  ABC-type transport system, permease component  33.2 
 
 
285 aa  123  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.062571  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2200  cytochrome c assembly protein  32.44 
 
 
276 aa  122  8e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.418476 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3841  cytochrome c assembly protein  32.1 
 
 
282 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000353743  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0504  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.27 
 
 
271 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000138241  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2587  cytochrome c assembly protein  30.25 
 
 
284 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.192397  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0614  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  33.83 
 
 
283 aa  116  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3519  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.34 
 
 
282 aa  117  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00186818 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3357  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.1 
 
 
284 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000743711  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1120  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.32 
 
 
283 aa  114  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.226676  normal  0.779146 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2900  cytochrome c assembly protein  34.83 
 
 
284 aa  113  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000276179  normal  0.563922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3453  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.1 
 
 
282 aa  112  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0684308  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0703  cytochrome c assembly protein  30.11 
 
 
283 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0695  cytochrome c assembly protein  32.22 
 
 
283 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00968755  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1894  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.68 
 
 
272 aa  104  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.29708  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1103  cytochrome c assembly protein  34.01 
 
 
278 aa  100  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0208072  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3378  cytochrome c assembly protein  28.57 
 
 
268 aa  99.4  6e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00167911  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0049  cytochrome c assembly protein  30.32 
 
 
391 aa  99  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00321304  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2995  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.66 
 
 
328 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02970  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.27 
 
 
333 aa  91.3  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2701  CcsB  31.85 
 
 
329 aa  89.7  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.223788  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2297  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.17 
 
 
341 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2348  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.17 
 
 
341 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224264  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0523  cytochrome c assembly protein  25.9 
 
 
276 aa  87  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2565  cytochrome c assembly protein  29.85 
 
 
270 aa  87  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.989453  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1361  cytochrome c assembly protein  30.16 
 
 
284 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1458  cytochrome c assembly protein  30.16 
 
 
284 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2494  cytochrome c assembly protein  30.16 
 
 
284 aa  86.3  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.79151  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1519  cytochrome c assembly protein  31.72 
 
 
255 aa  86.3  5e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6712  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  26.94 
 
 
321 aa  85.5  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24320  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  29.18 
 
 
297 aa  85.5  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.909816 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1373  cytochrome c assembly protein  31.11 
 
 
283 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0756163  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0254  cytochrome c assembly protein  26.79 
 
 
378 aa  85.1  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.409306  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0575  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like protein  30.81 
 
 
320 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08251  putative heme transporter  30.71 
 
 
309 aa  84  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.379611  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2168  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.2 
 
 
405 aa  83.6  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0048  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.59 
 
 
350 aa  83.2  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0773  putative heme transporter  32.56 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.694231  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0511  cytochrome c assembly protein  28.62 
 
 
275 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000900002  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08271  putative heme transporter  33.72 
 
 
309 aa  82.8  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.958198  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0511  ABC-type transport system involved in cytochrome c biogenesis permease component-like  27.5 
 
 
325 aa  82.4  0.000000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4463  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.85 
 
 
349 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0272  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.67 
 
 
323 aa  81.3  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.480455  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08031  putative heme transporter  29.84 
 
 
315 aa  81.6  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.966125 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0171  putative heme transporter  29.18 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1161  cytochrome c assembly protein  26.69 
 
 
275 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.14813  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2890  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  25.1 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0734214  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0429  cytochrome c assembly protein  25.6 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.000000000000010559  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0749  cytochrome c assembly protein  34.86 
 
 
472 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5011  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.39 
 
 
330 aa  80.5  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0513  cytochrome c assembly protein  41.67 
 
 
351 aa  80.1  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16811  putative heme transporter  30.17 
 
 
318 aa  79.7  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.89752 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1049  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  31.82 
 
 
310 aa  79.7  0.00000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000143982  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4570  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.74 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2711  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.52 
 
 
395 aa  79.3  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0072374  unclonable  0.0000000000373166 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3113  cytochrome c-type biogenesis protein ResC  32.52 
 
 
352 aa  79.3  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0633  cytochrome c assembly protein  37.29 
 
 
351 aa  79  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.008383 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1231  heme transporter  26.99 
 
 
304 aa  79  0.00000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.892503  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0929  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  25.4 
 
 
346 aa  79  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3558  cytochrome c assembly protein  24.54 
 
 
286 aa  79  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3537  cytochrome c assembly protein  25.86 
 
 
275 aa  79  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0113  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  23.42 
 
 
373 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000313165  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09971  putative heme transporter  38.68 
 
 
311 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.671585  normal  0.218138 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0692  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.88 
 
 
330 aa  78.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0232519  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07230  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  24.54 
 
 
340 aa  77.8  0.0000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0404  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  26.77 
 
 
1024 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4428  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  28.31 
 
 
339 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0038  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  32.47 
 
 
390 aa  76.6  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.854137 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1039  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  27.27 
 
 
361 aa  76.6  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10540  cytochrome C-type biogenesis protein ccsA  27.27 
 
 
324 aa  76.6  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000241853  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2851  cytochrome c assembly protein  33.55 
 
 
395 aa  76.3  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2951  cytochrome c assembly protein  28.21 
 
 
1074 aa  76.3  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.693523  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1335  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  25.47 
 
 
1017 aa  75.9  0.0000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.927141  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0705  CcmF/CcyK/CcsA family cytochrome c biogenesis protein  24.62 
 
 
276 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80358  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5339  cytochrome c assembly protein  27.78 
 
 
326 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5672  cytochrome c assembly protein  27.78 
 
 
326 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.593468 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3702  cytochrome c assembly protein  27.78 
 
 
326 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08181  putative heme transporter  30.81 
 
 
312 aa  75.5  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2985  putative transmembrane cytochrome C-type biogenesis transmembrane protein  31.28 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0049  cytochrome c assembly protein  27.01 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4574  cytochrome c assembly protein  32.28 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0401  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  36.84 
 
 
397 aa  74.7  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3263  cytochrome c-type biogenesis protein CcsB  30.73 
 
 
395 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147783  normal  0.312102 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0869  cytochrome c assembly protein  25.57 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.0057057  normal  0.189022 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>