More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1462 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1462  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 384 aa  771    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.36043  normal  0.122675 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  38.54 
 
 		 403 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2702  geranylgeranyl reductase  40.13 
 
 		 401 aa  192  7e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2189  geranylgeranyl reductase  38.21 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  33.88 
 
 		 389 aa  160  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  32.17 
 
 		 382 aa  152  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  33.89 
 
 		 385 aa  150  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  33.23 
 
 		 379 aa  139  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  30.75 
 
 		 376 aa  134  1.9999999999999998e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  31.44 
 
 		 378 aa  132  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  33.53 
 
 		 384 aa  130  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  28.25 
 
 		 387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  31.99 
 
 		 398 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  29.39 
 
 		 398 aa  120  3e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  32.45 
 
 		 375 aa  119  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  28.78 
 
 		 368 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  27.68 
 
 		 370 aa  117  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  32.41 
 
 		 362 aa  114  3e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  33.66 
 
 		 384 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  32 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  30.55 
 
 		 374 aa  107  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  34.11 
 
 		 434 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  29.59 
 
 		 373 aa  104  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  26.41 
 
 		 376 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  32.83 
 
 		 418 aa  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  29.03 
 
 		 373 aa  102  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  30.62 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  27.32 
 
 		 391 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  31.14 
 
 		 457 aa  101  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  30.99 
 
 		 431 aa  100  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  33.13 
 
 		 424 aa  99.8  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  31.25 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  33.02 
 
 		 400 aa  98.2  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  29.01 
 
 		 393 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  25.51 
 
 		 377 aa  98.2  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  30.36 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  28.7 
 
 		 393 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  31.88 
 
 		 423 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  24.78 
 
 		 377 aa  97.1  5e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  28.91 
 
 		 362 aa  96.3  8e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  27.38 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  31.82 
 
 		 445 aa  95.1  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  30.21 
 
 		 434 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0162  geranylgeranyl reductase  33.88 
 
 		 392 aa  93.6  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.0738774 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  32.05 
 
 		 423 aa  93.6  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  25.21 
 
 		 376 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  33.14 
 
 		 423 aa  92.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  29.94 
 
 		 435 aa  92  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  28.36 
 
 		 379 aa  91.3  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  25.21 
 
 		 376 aa  90.5  4e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  30.97 
 
 		 360 aa  90.1  5e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  29.58 
 
 		 374 aa  90.5  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  25.29 
 
 		 390 aa  89.7  7e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1739  geranylgeranyl reductase  30.21 
 
 		 358 aa  89.4  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.539865  normal  0.0147858 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  24.92 
 
 		 377 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  28.83 
 
 		 425 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  30.36 
 
 		 419 aa  87.4  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  28.62 
 
 		 358 aa  87.4  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  27.38 
 
 		 398 aa  86.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  25.8 
 
 		 390 aa  86.7  7e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  32.65 
 
 		 430 aa  86.7  7e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  33.23 
 
 		 440 aa  86.3  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  27.4 
 
 		 376 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  24.06 
 
 		 390 aa  85.5  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  25.48 
 
 		 391 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  29.85 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3185  monooxygenase FAD-binding protein  25.87 
 
 		 375 aa  85.1  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.388588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  28.66 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2391  geranylgeranyl reductase  32.16 
 
 		 375 aa  84.3  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  28.35 
 
 		 380 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  30.62 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  32.49 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  31.15 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  28.26 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  26.71 
 
 		 452 aa  80.9  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  31.97 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  32.14 
 
 		 341 aa  80.1  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  32.11 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  26.35 
 
 		 408 aa  79.7  0.00000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  29.08 
 
 		 431 aa  79  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  28.32 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5035  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.378834 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  28.8 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  28.36 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  28.36 
 
 		 394 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  27.85 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  28.98 
 
 		 421 aa  77.8  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  27.85 
 
 		 393 aa  77.8  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  22.78 
 
 		 348 aa  77.4  0.0000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  28.12 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.62 
 
 		 468 aa  77  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  28.8 
 
 		 380 aa  76.6  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  26.92 
 
 		 382 aa  76.3  0.0000000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  27.52 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  29.86 
 
 		 424 aa  75.1  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  28.62 
 
 		 409 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6424  geranylgeranyl reductase  32.08 
 
 		 403 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  26.14 
 
 		 406 aa  75.1  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>