More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1453 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1453  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 366 aa  755    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000488747  normal  0.299769 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3928  methyltransferase type 11  47.14 
 
 		 363 aa  290  3e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.959556 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  40.4 
 
 		 344 aa  276  5e-73  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1328  Methyltransferase type 12  41.06 
 
 		 365 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.352621 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3378  methyltransferase type 11  42.13 
 
 		 355 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3440  methyltransferase type 11  42.13 
 
 		 355 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0151153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3389  methyltransferase type 11  42.13 
 
 		 355 aa  263  4e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2608  Methyltransferase type 12  44.69 
 
 		 380 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000476854  hitchhiker  0.00248794 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2462  hypothetical protein  40.28 
 
 		 356 aa  253  5.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2768  methyltransferase type 11  42.03 
 
 		 360 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.447224  normal  0.663756 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1645  Methyltransferase type 12  42.94 
 
 		 365 aa  249  5e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2319  hypothetical protein  40 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2327  Methyltransferase type 11  42.5 
 
 		 367 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.28435 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1793  Methyltransferase type 11  41.81 
 
 		 360 aa  243  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000694862 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12286  transcriptional regulator  41.57 
 
 		 353 aa  242  9e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2044  methyltransferase type 12  42.49 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.204275  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1502  methyltransferase type 11  41.32 
 
 		 360 aa  239  4e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576413  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3765  methyltransferase type 12  42.37 
 
 		 376 aa  237  2e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.578435  normal  0.774005 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3711  methyltransferase type 12  40.72 
 
 		 360 aa  232  7.000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5751  Methyltransferase type 11  40.73 
 
 		 356 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229157  normal  0.171597 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2574  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 363 aa  224  3e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3193  Methyltransferase type 12  33.42 
 
 		 351 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0507607  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3092  Methyltransferase type 12  33.15 
 
 		 351 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.684965  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2993  methyltransferase type 12  33.15 
 
 		 351 aa  146  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0698289  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1706  methyltransferase type 12  30.6 
 
 		 353 aa  140  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.266061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1290  Methyltransferase type 12  34.48 
 
 		 341 aa  139  7.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.830154  normal  0.108647 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6246  Methyltransferase type 12  32.54 
 
 		 349 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.106567  normal  0.283014 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0596  Methyltransferase type 12  33.53 
 
 		 357 aa  137  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.579149 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6880  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 353 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541401  normal  0.545312 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43981  predicted protein  32.16 
 
 		 418 aa  135  9e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.321285  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1632  hypothetical protein  28.65 
 
 		 357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  31.55 
 
 		 351 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1551  methyltransferase type 12  31.16 
 
 		 350 aa  133  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.100961 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3870  methyltransferase type 12  32.37 
 
 		 357 aa  133  5e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.623103 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18860  hypothetical protein  28.65 
 
 		 357 aa  133  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.478854  normal  0.0386506 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1171  hypothetical protein  28.18 
 
 		 351 aa  132  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1034  Methyltransferase type 12  31.85 
 
 		 360 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2696  Methyltransferase type 12  31.14 
 
 		 358 aa  125  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.362393 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5910  Methyltransferase type 12  29.59 
 
 		 353 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.512688 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2188  Methyltransferase type 12  31.95 
 
 		 343 aa  125  1e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1828  Methyltransferase type 11  29.71 
 
 		 351 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.225649  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4241  Methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 360 aa  121  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0990  methyltransferase type 12  28.73 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0550  Methyltransferase type 11  32.16 
 
 		 356 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  29.36 
 
 		 348 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5022  methyltransferase type 11  28.3 
 
 		 353 aa  116  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.371366  normal  0.128681 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  29.67 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  30.19 
 
 		 348 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0108  Methyltransferase type 11  30.35 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.082076  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2927  hypothetical protein  31.07 
 
 		 348 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0580788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2765  methyltransferase type 12  31.07 
 
 		 348 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.306767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2836  methyltransferase type 11  32.45 
 
 		 362 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.251768  normal  0.501241 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2079  hypothetical protein  27.67 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1600  methyltransferase type 12  29.39 
 
 		 359 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0623  methyltransferase type 12  28.9 
 
 		 357 aa  102  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5517  methyltransferase type 11  31.18 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00770643  normal  0.912188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6570  methyltransferase type 12  27.2 
 
 		 416 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.68 
 
 		 402 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.280031  unclonable  0.0000000000741696 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 402 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1508  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 226 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  33.77 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  30.64 
 
 		 314 aa  62  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2812  methyltransferase type 12  29.86 
 
 		 535 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2369  Methyltransferase type 12  42.67 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0631765 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2040  Methyltransferase type 12  31.25 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2066  Methyltransferase type 12  31.25 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1462  methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 285 aa  59.7  0.00000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.032097 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3811  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 440 aa  59.3  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1781  methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 285 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.33334  hitchhiker  0.000337573 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  31.61 
 
 		 267 aa  59.3  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0607  methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 285 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.21069  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  35.78 
 
 		 295 aa  57  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1686  hypothetical protein  32.73 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.280854  hitchhiker  0.00385522 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3996  putative methyltransferase  37.1 
 
 		 289 aa  57  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0084  methyltransferase type 11  25.71 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.559166  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  35.43 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1114  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.61 
 
 		 223 aa  55.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000119347 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2390  methyltransferase type 11  29.81 
 
 		 439 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.95709 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  33.63 
 
 		 209 aa  55.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1083  hypothetical protein  29.55 
 
 		 254 aa  55.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0046  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.13 
 
 		 447 aa  55.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.404725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 		 263 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2807  methyltransferase, putative  29.53 
 
 		 267 aa  54.3  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.432539  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0242  hypothetical protein  29.82 
 
 		 363 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0241  hypothetical protein  29.82 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1668  methyltransferase type 12  28.47 
 
 		 535 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  31.37 
 
 		 263 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0758  methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 261 aa  53.5  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00805232  hitchhiker  0.00000000000141502 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44851  predicted protein  32.04 
 
 		 249 aa  53.5  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6585  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  31.37 
 
 		 366 aa  53.1  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  29 
 
 		 262 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1267  MCP methyltransferase, CheR-type  30.28 
 
 		 274 aa  52.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 		 243 aa  52  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0064  hypothetical protein  29.51 
 
 		 268 aa  52.4  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0768546 
 
 
-
 
NC_002950  PG0960  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  26.92 
 
 		 244 aa  51.6  0.00002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.141483 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 		 234 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1899  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 266 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00441  hypothetical protein  25.71 
 
 		 653 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>