135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1437 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1437  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  513  1e-144  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318799  normal  0.0549134 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2539  hypothetical protein  59.4 
 
 
266 aa  270  2e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0939059  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1497  hypothetical protein  48.08 
 
 
267 aa  244  8e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0286332 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1799  hypothetical protein  48.08 
 
 
267 aa  241  8e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.551052 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6305  hypothetical protein  48.08 
 
 
267 aa  241  8e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1774  hypothetical protein  48.08 
 
 
267 aa  241  8e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.113625  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5072  putative ABC transporter, inner membrane subunit  47.51 
 
 
267 aa  240  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362537  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1311  hypothetical protein  47.71 
 
 
272 aa  238  7e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1069  hypothetical protein  47.71 
 
 
272 aa  238  7e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.443958  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2321  hypothetical protein  47.71 
 
 
272 aa  238  7e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2190  hypothetical protein  47.71 
 
 
272 aa  238  7e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2153  hypothetical protein  47.71 
 
 
272 aa  238  7e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0097  hypothetical protein  47.71 
 
 
272 aa  238  7e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1798  hypothetical protein  47.71 
 
 
272 aa  238  7e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.539315  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1713  hypothetical protein  47.13 
 
 
267 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0986  hypothetical protein  47.24 
 
 
268 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2266  hypothetical protein  48.22 
 
 
272 aa  236  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.336185  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0764  hypothetical protein  47.15 
 
 
269 aa  234  1e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0571603 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1685  hypothetical protein  46.36 
 
 
267 aa  234  1e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1863  hypothetical protein  45.21 
 
 
268 aa  231  6e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00500964  normal  0.0941942 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2323  ABC transporter, inner membrane subunit  45.59 
 
 
268 aa  230  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0698  hypothetical protein  47.22 
 
 
269 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.217447 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0748  hypothetical protein  49.8 
 
 
272 aa  225  5e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1835  hypothetical protein  44.06 
 
 
267 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0198  hypothetical protein  44.44 
 
 
268 aa  199  4e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.68555 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0076  hypothetical protein  44.83 
 
 
269 aa  197  1e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0298659  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2456  hypothetical protein  46.03 
 
 
261 aa  192  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1727  hypothetical protein  43.25 
 
 
265 aa  189  3e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2410  hypothetical protein  45.38 
 
 
265 aa  189  3e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0767  hypothetical protein  42.75 
 
 
263 aa  184  2e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1807  hypothetical protein  44.71 
 
 
265 aa  183  2e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162766  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3461  hypothetical protein  41.47 
 
 
262 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4303  hypothetical protein  41.02 
 
 
258 aa  181  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.121514 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1171  hypothetical protein  41.18 
 
 
261 aa  180  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.739375  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4241  hypothetical protein  41.8 
 
 
258 aa  179  3e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0279  hypothetical protein  41.31 
 
 
260 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3122  hypothetical protein  41.45 
 
 
268 aa  177  2e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.859294  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0534  hypothetical protein  41.41 
 
 
267 aa  175  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2239  hypothetical protein  44.44 
 
 
263 aa  174  2e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255232  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7995  hypothetical protein  44.44 
 
 
263 aa  174  2e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138428  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2007  ABC-type transport system, permease component  42.31 
 
 
266 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089276  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2104  hypothetical protein  44.98 
 
 
267 aa  170  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.399014  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3633  hypothetical protein  41.53 
 
 
265 aa  167  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0254  hypothetical protein  36.73 
 
 
251 aa  167  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.59378e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3518  hypothetical protein  38.76 
 
 
257 aa  166  3e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000832658  normal  0.16619 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2020  hypothetical protein  42.36 
 
 
263 aa  164  2e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2632  hypothetical protein  37.72 
 
 
261 aa  159  3e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0680234  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0121  hypothetical protein  42.52 
 
 
266 aa  160  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2510  hypothetical protein  34.01 
 
 
258 aa  158  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0072  hypothetical protein  44.44 
 
 
263 aa  158  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.625739 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0161  hypothetical protein  33.83 
 
 
265 aa  157  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4760  hypothetical protein  33.09 
 
 
264 aa  156  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0165  hypothetical protein  44 
 
 
266 aa  156  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.980165  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1348  hypothetical protein  37.74 
 
 
264 aa  156  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5081  hypothetical protein  33.83 
 
 
265 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5079  hypothetical protein  33.83 
 
 
265 aa  155  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5084  hypothetical protein  33.83 
 
 
265 aa  155  7e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1804  hypothetical protein  36.33 
 
 
265 aa  155  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1073  hypothetical protein  37.33 
 
 
263 aa  155  9e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.780627  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5050  hypothetical protein  33.46 
 
 
265 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5176  hypothetical protein  33.46 
 
 
265 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4653  hypothetical protein  33.46 
 
 
265 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4811  hypothetical protein  33.46 
 
 
265 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4673  hypothetical protein  33.46 
 
 
265 aa  154  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0689  hypothetical protein  34.54 
 
 
257 aa  153  3e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.393246  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04990  conserved hypothetical protein  37.07 
 
 
311 aa  149  4e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.804578  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2290  hypothetical protein  36.72 
 
 
261 aa  149  6e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.47425e-05 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1234  hypothetical protein  36.19 
 
 
261 aa  147  1e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1139  hypothetical protein  32.58 
 
 
265 aa  147  2e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.529413 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0169  ABC transporter, permease protein, putative  37.66 
 
 
263 aa  146  4e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.645871  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01854  hypothetical protein  37.82 
 
 
266 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1058  hypothetical protein  37.21 
 
 
261 aa  144  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00447  hypothetical protein  32.57 
 
 
259 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3119  conserved hypothetical protein  32.57 
 
 
259 aa  143  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00442  predicted inner membrane protein  32.57 
 
 
259 aa  143  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A09  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  35.86 
 
 
251 aa  144  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  1.12109e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3125  hypothetical protein  32.57 
 
 
259 aa  143  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101868 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0570  hypothetical protein  32.57 
 
 
259 aa  143  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0595  hypothetical protein  32.57 
 
 
259 aa  143  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0540  hypothetical protein  32.57 
 
 
259 aa  143  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0900  hypothetical protein  33.71 
 
 
258 aa  143  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_15102  predicted protein  37.86 
 
 
247 aa  143  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.763403  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0530  hypothetical protein  32.57 
 
 
259 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0426  hypothetical protein  32.57 
 
 
259 aa  142  6e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1087  hypothetical protein  34.65 
 
 
263 aa  142  6e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4666  hypothetical protein  33.07 
 
 
257 aa  142  7e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0552  hypothetical protein  33.08 
 
 
259 aa  141  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.417119  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0557  hypothetical protein  33.08 
 
 
259 aa  141  1e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.711318  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0611  hypothetical protein  33.08 
 
 
259 aa  141  1e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0567  hypothetical protein  33.08 
 
 
259 aa  141  1e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0550  hypothetical protein  33.08 
 
 
259 aa  141  1e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1097  hypothetical protein  37.39 
 
 
257 aa  140  2e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215237  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1218  hypothetical protein  31.64 
 
 
258 aa  140  2e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1627  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  35.06 
 
 
251 aa  140  3e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2942  hypothetical protein  39.65 
 
 
256 aa  138  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1309  hypothetical protein  32.94 
 
 
259 aa  136  3e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0700  hypothetical protein  35.83 
 
 
264 aa  136  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0755  hypothetical protein  32.43 
 
 
262 aa  136  5e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  3.02353e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0731  hypothetical protein  32.43 
 
 
262 aa  136  5e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  2.07096e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2859  hypothetical protein  37.45 
 
 
252 aa  132  4e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>