42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1434 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1434  domain of unknown function DUF1745  100 
 
 		 402 aa  813    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318192  normal  0.236861 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1892  hypothetical protein  48.37 
 
 		 382 aa  310  2e-83  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.056146  normal  0.181862 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1561  hypothetical protein  38.1 
 
 		 394 aa  294  2e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0408772  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1054  hypothetical protein  37.16 
 
 		 405 aa  253  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003465  hypothetical protein  36.36 
 
 		 393 aa  252  7e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02305  hypothetical protein  37.02 
 
 		 395 aa  250  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02432  hypothetical protein  41.64 
 
 		 391 aa  249  5e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2542  hypothetical protein  41.4 
 
 		 395 aa  243  5e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05570  hypothetical protein  28.77 
 
 		 387 aa  107  5e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1269  hypothetical protein  26.39 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0824  hypothetical protein  24.17 
 
 		 379 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0690  hypothetical protein  24.19 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000847515 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1909  domain of unknown function DUF1745  23.96 
 
 		 408 aa  65.1  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2079  domain of unknown function DUF1745  25.71 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00286991  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1241  hypothetical protein  25.96 
 
 		 381 aa  61.2  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.430619 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2151  hypothetical protein  29.06 
 
 		 383 aa  60.8  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.509879 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2864  domain of unknown function DUF1745  23.92 
 
 		 396 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.965957  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2954  hypothetical protein  26.18 
 
 		 395 aa  58.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0696  transcriptional regulator, TrmB  27.91 
 
 		 512 aa  57.4  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0911  hypothetical protein  23.21 
 
 		 400 aa  57  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.36206  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2153  hypothetical protein  24.41 
 
 		 400 aa  57  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2119  hypothetical protein  21.26 
 
 		 402 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1352  domain of unknown function DUF1745  21.87 
 
 		 396 aa  54.7  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.3322200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0550  hypothetical protein  26.95 
 
 		 467 aa  54.3  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0288  hypothetical protein  25.75 
 
 		 467 aa  53.5  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2107  domain of unknown function DUF1745  23.65 
 
 		 401 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.206498 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4131  domain of unknown function DUF1745  22.27 
 
 		 396 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1369  hypothetical protein  25.75 
 
 		 468 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2052  domain of unknown function DUF1745  26.61 
 
 		 379 aa  50.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2993  hypothetical protein  25.42 
 
 		 368 aa  50.1  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2665  domain of unknown function DUF1745  22.01 
 
 		 427 aa  49.7  0.00009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.955158 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3322  domain of unknown function DUF1745  23.18 
 
 		 373 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1899  hypothetical protein  20.85 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.598311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3873  hypothetical protein  25.13 
 
 		 380 aa  47.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4045  hypothetical protein  24.11 
 
 		 378 aa  47  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4141  hypothetical protein  21.54 
 
 		 365 aa  47  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0615  hypothetical protein  22.92 
 
 		 468 aa  46.6  0.0009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.948448  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2474  hypothetical protein  23.08 
 
 		 447 aa  45.8  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2305  domain of unknown function DUF1745  23.62 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0128  hypothetical protein  21.94 
 
 		 379 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.193314  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2724  domain of unknown function DUF1745  30.43 
 
 		 374 aa  43.9  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43445  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0466  domain of unknown function DUF1745  23.99 
 
 		 385 aa  43.9  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>