More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1421 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 
220 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  64.89 
 
 
224 aa  287  7e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  62.27 
 
 
220 aa  276  1e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  60.18 
 
 
218 aa  270  1e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3094  riboflavin synthase subunit alpha  56.09 
 
 
230 aa  254  5e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112712 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1620  riboflavin synthase subunit alpha  56.5 
 
 
224 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  47.73 
 
 
220 aa  201  9e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  46.61 
 
 
220 aa  192  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  48.24 
 
 
200 aa  187  1e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  45.91 
 
 
215 aa  185  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  45 
 
 
213 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  43.89 
 
 
216 aa  181  1e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  42.73 
 
 
213 aa  179  4e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  40.45 
 
 
214 aa  178  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  44.56 
 
 
210 aa  176  2e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  39.82 
 
 
220 aa  176  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  40.45 
 
 
214 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  39.55 
 
 
217 aa  176  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 
216 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  39.55 
 
 
217 aa  175  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  42.73 
 
 
221 aa  174  7e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  42.27 
 
 
216 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  42.34 
 
 
219 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  46.97 
 
 
196 aa  173  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  45.77 
 
 
202 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  47.42 
 
 
197 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  42.53 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 
218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0835  riboflavin synthase subunit alpha  41.52 
 
 
219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  41.26 
 
 
223 aa  171  7.999999999999999e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  44.13 
 
 
223 aa  171  7.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  42.73 
 
 
216 aa  171  7.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  41.36 
 
 
218 aa  171  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  44.78 
 
 
218 aa  170  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  38.46 
 
 
217 aa  170  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  44.78 
 
 
218 aa  170  1e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  38.01 
 
 
217 aa  170  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  41.36 
 
 
226 aa  169  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  40.72 
 
 
220 aa  167  9e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  39.37 
 
 
219 aa  167  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  40.99 
 
 
221 aa  167  1e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  38.46 
 
 
218 aa  167  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  46.94 
 
 
200 aa  167  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 
215 aa  167  1e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  39.82 
 
 
221 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  40.27 
 
 
218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  43.64 
 
 
215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  41.18 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  39.82 
 
 
221 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  41.36 
 
 
215 aa  166  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  39.82 
 
 
221 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  39.82 
 
 
221 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  40.72 
 
 
218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  43.18 
 
 
214 aa  165  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  37.67 
 
 
217 aa  164  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  39.82 
 
 
218 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  39.82 
 
 
218 aa  164  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  36.2 
 
 
220 aa  164  8e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  44.39 
 
 
215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  39.82 
 
 
219 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  40.91 
 
 
211 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  39.37 
 
 
218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  39.06 
 
 
232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  43.24 
 
 
227 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  38.46 
 
 
217 aa  163  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0952  riboflavin synthase subunit alpha  41.44 
 
 
218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  39.82 
 
 
218 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  39.82 
 
 
218 aa  162  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  39.82 
 
 
218 aa  162  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  39.37 
 
 
218 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0200  riboflavin synthase subunit alpha  43.14 
 
 
203 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.659601 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 
214 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  41.63 
 
 
221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  39.01 
 
 
223 aa  161  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  39.37 
 
 
220 aa  161  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  43.08 
 
 
216 aa  161  7e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  40.18 
 
 
223 aa  161  7e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  37.95 
 
 
221 aa  161  9e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  38.57 
 
 
223 aa  160  1e-38  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  39.09 
 
 
218 aa  160  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  44.1 
 
 
196 aa  160  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  44.85 
 
 
216 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  38.46 
 
 
220 aa  160  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2131  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 
201 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0831  riboflavin synthase subunit alpha  38.84 
 
 
218 aa  159  3e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  41.82 
 
 
217 aa  159  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  37.73 
 
 
217 aa  159  3e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  39.82 
 
 
219 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  38.3 
 
 
239 aa  159  4e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  39.37 
 
 
219 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  42.86 
 
 
201 aa  159  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  37.56 
 
 
221 aa  158  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  45.69 
 
 
201 aa  158  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  40.45 
 
 
216 aa  158  6e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  43.78 
 
 
207 aa  158  8e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  44.56 
 
 
215 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  44.5 
 
 
204 aa  157  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  45.36 
 
 
220 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  43.56 
 
 
205 aa  156  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  36.36 
 
 
214 aa  156  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>