More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1405 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1405  thymidylate kinase  100 
 
 		 215 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.201868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2338  thymidylate kinase  67.46 
 
 		 212 aa  292  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1092  dTMP kinase  66.83 
 
 		 224 aa  281  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.642023  normal  0.243133 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0085  thymidylate kinase  63.46 
 
 		 211 aa  280  8.000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0023  dTMP kinase  66.02 
 
 		 215 aa  276  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0182529 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1165  dTMP kinase  55.26 
 
 		 214 aa  207  8e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  50.48 
 
 		 213 aa  207  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  49.28 
 
 		 212 aa  207  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  52.91 
 
 		 213 aa  201  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  46.48 
 
 		 211 aa  198  6e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  48.8 
 
 		 217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3204  thymidylate kinase  50.96 
 
 		 225 aa  184  9e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00156948  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1059  thymidylate kinase  50.48 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.34393e-16 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  50.79 
 
 		 216 aa  182  3e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4544  thymidylate kinase  43.93 
 
 		 671 aa  181  7e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2501  thymidylate kinase  47.8 
 
 		 205 aa  181  8.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0093  thymidylate kinase  45.16 
 
 		 215 aa  181  9.000000000000001e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.564378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2783  thymidylate kinase  43.46 
 
 		 686 aa  180  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.855806  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  46.41 
 
 		 219 aa  181  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20380  dTMP kinase  48.26 
 
 		 207 aa  180  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0400  dTMP kinase  44.44 
 
 		 204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1292  thymidylate kinase  44.76 
 
 		 234 aa  178  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.199663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  43.13 
 
 		 207 aa  177  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3467  thymidylate kinase  43.72 
 
 		 686 aa  176  2e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1029  dTMP kinase  45.41 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0128  dTMP kinase  51.89 
 
 		 217 aa  174  7e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.630862  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  45.85 
 
 		 210 aa  174  7e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  43.9 
 
 		 209 aa  172  1.9999999999999998e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9221  dTMP kinase  43.72 
 
 		 688 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6278  dTMP kinase  44.55 
 
 		 226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.266186 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  46.73 
 
 		 222 aa  171  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  46.41 
 
 		 210 aa  171  6.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1460  dTMP kinase  44.39 
 
 		 223 aa  169  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  44.88 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0927  dTMP kinase  41.46 
 
 		 199 aa  169  3e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0241028  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  46.01 
 
 		 211 aa  169  3e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  47.89 
 
 		 210 aa  169  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2461  thymidylate kinase  49.01 
 
 		 202 aa  169  4e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0156  thymidylate kinase  40.1 
 
 		 206 aa  169  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  47.89 
 
 		 210 aa  167  8e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0992  dTMP kinase  40.35 
 
 		 234 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.241763  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4562  dTMP kinase  42.79 
 
 		 244 aa  166  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4191  dTMP kinase  42.33 
 
 		 244 aa  166  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.97771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3327  dTMP kinase  40.67 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0489  dTMP kinase  42.79 
 
 		 662 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.042381  hitchhiker  0.00739513 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0026  thymidylate kinase  41.12 
 
 		 210 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  44.88 
 
 		 207 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1805  thymidylate kinase  42.51 
 
 		 226 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.28668  hitchhiker  0.0078703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1993  thymidylate kinase  43 
 
 		 236 aa  164  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00307533 
 
 
-
 
NC_004310  BR0992  thymidylate kinase  42.44 
 
 		 211 aa  163  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  41.79 
 
 		 207 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1564  thymidylate kinase  43.17 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.446858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16190  thymidylate kinase  42.45 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000139363 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0696  dTMP kinase  40.49 
 
 		 197 aa  162  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0844  thymidylate kinase  45.54 
 
 		 707 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  46.32 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  46.32 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1971  thymidylate kinase  44.88 
 
 		 688 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.270362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  41.67 
 
 		 233 aa  161  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  43.4 
 
 		 212 aa  161  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  43.19 
 
 		 210 aa  160  9e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1508  dTMP kinase  42.79 
 
 		 240 aa  160  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8399  thymidylate kinase  43.33 
 
 		 901 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0386  thymidylate kinase  43.07 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.203543  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0960  thymidylate kinase  41.46 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.265378  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2077  thymidylate kinase  41.38 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1236  dTMP kinase  43.65 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.97692 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1581  thymidylate kinase  43.63 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2155  thymidylate kinase  44.08 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.367243  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0024  thymidylate kinase  40.2 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0040  dTMP kinase  41.29 
 
 		 210 aa  159  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6923  thymidylate kinase  44.19 
 
 		 225 aa  158  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  43.63 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  40.28 
 
 		 212 aa  158  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  43.27 
 
 		 230 aa  157  8e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  46.32 
 
 		 210 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1310  thymidylate kinase  42.86 
 
 		 214 aa  157  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0312  thymidylate kinase  43.87 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0036  dTMP kinase  41.86 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0551  thymidylate kinase  43.88 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2202  dTMP kinase  43.88 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0588786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4023  thymidylate kinase  42.65 
 
 		 705 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2679  thymidylate kinase  42.92 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.18582  normal  0.346659 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0053  dTMP kinase  40.21 
 
 		 203 aa  155  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.115625  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0372  thymidylate kinase  40.19 
 
 		 217 aa  155  4e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000036403 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  43 
 
 		 208 aa  154  8e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4404  dTMP kinase  41.67 
 
 		 703 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0440173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4325  dTMP kinase  44.23 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.187582 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  41.36 
 
 		 213 aa  154  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2699  thymidylate kinase  43 
 
 		 208 aa  153  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.741794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  40.69 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1272  dTMP kinase  40.91 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.175586 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1145  thymidylate kinase  41.94 
 
 		 244 aa  153  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.446337  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  44.21 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1717  dTMP kinase  44.71 
 
 		 197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0025  thymidylate kinase  37.8 
 
 		 208 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  45.15 
 
 		 203 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  40.98 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1464  thymidylate kinase  44.92 
 
 		 230 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1092  thymidylate kinase  40.48 
 
 		 219 aa  152  2.9999999999999998e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.733791  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>