More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1372 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1372  quinolinate synthetase  100 
 
 
346 aa  712    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.32551  normal  0.474505 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0687  quinolinate synthetase  58.58 
 
 
337 aa  390  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1352  quinolinate synthetase  52.63 
 
 
358 aa  358  6e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.186437  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1830  quinolinate synthetase  51.45 
 
 
346 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0525  quinolinate synthetase  52.03 
 
 
349 aa  352  7e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.472845 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0807  quinolinate synthetase  50.72 
 
 
348 aa  347  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0241  quinolinate synthetase  42.54 
 
 
426 aa  280  2e-74  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0291672  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2560  quinolinate synthetase  44.94 
 
 
441 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.267986  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4325  quinolinate synthetase  43.64 
 
 
368 aa  276  3e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4660  quinolinate synthetase  43.64 
 
 
368 aa  276  3e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00639812  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4162  quinolinate synthetase  43.35 
 
 
368 aa  275  7e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4561  quinolinate synthetase  43.35 
 
 
368 aa  275  7e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4508  quinolinate synthetase  43.35 
 
 
368 aa  275  7e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0362709 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2297  quinolinate synthetase  44.41 
 
 
433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000588657 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4173  quinolinate synthetase  43.06 
 
 
368 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0057  quinolinate synthetase  45.77 
 
 
360 aa  272  7e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0058  quinolinate synthetase  45.77 
 
 
365 aa  272  7e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000714365  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4513  quinolinate synthetase  42.49 
 
 
368 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4546  quinolinate synthetase  42.77 
 
 
368 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0260713  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2776  quinolinate synthetase  45.61 
 
 
425 aa  271  1e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.12125 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3557  quinolinate synthetase  44.41 
 
 
430 aa  271  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00755021  normal  0.140147 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0689  quinolinate synthetase  42.77 
 
 
368 aa  269  7e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.416009  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1284  quinolinate synthetase complex subunit A  45.93 
 
 
386 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.778177  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1289  quinolinate synthetase  43.3 
 
 
375 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0340709  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0303  quinolinate synthetase  42.44 
 
 
365 aa  267  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.527359  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4148  quinolinate synthetase complex, A subunit  44.97 
 
 
388 aa  265  7e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0298748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3149  quinolinate synthetase  44.85 
 
 
394 aa  265  7e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.322606  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2529  quinolinate synthetase  44.57 
 
 
367 aa  265  8e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3143  quinolinate synthetase  42.24 
 
 
368 aa  264  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15680  quinolinate synthetase  43.27 
 
 
442 aa  264  2e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.373722  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4274  quinolinate synthetase  42.57 
 
 
368 aa  263  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0106233  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03750  quinolinate synthetase  42.54 
 
 
435 aa  261  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.01  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4317  quinolinate synthetase  41.48 
 
 
370 aa  261  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.381105  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3306  quinolinate synthetase  45.27 
 
 
400 aa  260  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.448369 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0350  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.34 
 
 
421 aa  259  6e-68  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.54036  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0917  quinolinate synthetase  42.07 
 
 
360 aa  256  3e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000424051  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1579  quinolinate synthetase  42.18 
 
 
372 aa  256  3e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.8831  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1661  quinolinate synthetase  45.02 
 
 
397 aa  256  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.495114  normal  0.0794019 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2086  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.59 
 
 
412 aa  256  4e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0193365  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0919  quinolinate synthetase  42.4 
 
 
367 aa  255  7e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2664  quinolinate synthetase complex, A subunit  42.77 
 
 
384 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.240142  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1796  quinolinate synthetase  44.14 
 
 
395 aa  253  4.0000000000000004e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574289 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1497  quinolinate synthetase  41.28 
 
 
373 aa  252  7e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.611574  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3083  quinolinate synthetase complex, A subunit  43.9 
 
 
388 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0542584  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2922  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.29 
 
 
377 aa  251  1e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1626  quinolinate synthetase  44.19 
 
 
365 aa  250  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3766  quinolinate synthetase  39.26 
 
 
365 aa  249  7e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0837533 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0530  quinolinate synthetase complex, A subunit  40.29 
 
 
377 aa  248  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1458  quinolinate synthetase  43.75 
 
 
383 aa  247  2e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.570432  normal  0.648645 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0376  quinolinate synthetase  41.56 
 
 
389 aa  246  3e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3538  quinolinate synthetase  44.14 
 
 
399 aa  247  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.306663  hitchhiker  0.000931017 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2253  quinolinate synthetase complex, A subunit  41.57 
 
 
356 aa  245  9e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564626 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0605  quinolinate synthetase  39.88 
 
 
366 aa  245  9e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3645  quinolinate synthetase  40.4 
 
 
366 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15580  quinolinate synthetase A  43.24 
 
 
400 aa  243  3e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546828  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2381  quinolinate synthetase  39.37 
 
 
379 aa  236  4e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3122  quinolinate synthetase  44.44 
 
 
407 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.174663  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0667  quinolinate synthetase  35.94 
 
 
332 aa  217  2e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0757  quinolinate synthetase  34.96 
 
 
337 aa  209  5e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0012496  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0238  quinolinate synthetase complex, A subunit  34.2 
 
 
330 aa  188  1e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0754  quinolinate synthetase complex, A subunit  34.91 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1590  quinolinate synthetase  36.13 
 
 
302 aa  172  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0424  quinolinate synthetase complex, A subunit  35.65 
 
 
324 aa  171  2e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0685168  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1474  quinolinate synthetase complex, subunit A  35.67 
 
 
302 aa  169  8e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000128992  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00620  quinolinate synthetase complex, A subunit  32.95 
 
 
301 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3573  quinolinate synthetase  35.57 
 
 
304 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0163  quinolinate synthetase  33.73 
 
 
307 aa  166  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.274251  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0001  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.88 
 
 
306 aa  166  8e-40  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1338  quinolinate synthetase  36.09 
 
 
302 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.270834  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0021  quinolinate synthetase  36.07 
 
 
304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0447928  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2356  quinolinate synthetase A  33.04 
 
 
304 aa  163  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000244014  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1874  quinolinate synthetase complex, A subunit  34.42 
 
 
307 aa  162  6e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2119  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.02 
 
 
302 aa  162  7e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.825722  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1456  quinolinate synthetase  34.45 
 
 
310 aa  162  1e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.129815 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0105  quinolinate synthetase  34.04 
 
 
322 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1800  quinolinate synthetase  35.08 
 
 
311 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0121  quinolinate synthetase complex, A subunit  34.47 
 
 
303 aa  160  3e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.65603  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1548  quinolinate synthetase complex, A subunit  33.23 
 
 
317 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3588  quinolinate synthetase  34.67 
 
 
304 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0199  quinolinate synthetase  35.42 
 
 
304 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000196344  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3519  quinolinate synthetase  34.67 
 
 
304 aa  157  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000125089  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1212  quinolinate synthetase complex, A subunit  32.12 
 
 
303 aa  156  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.416438  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3544  quinolinate synthetase  35.29 
 
 
304 aa  156  4e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876339  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2413  quinolinate synthetase complex, A subunit  34.49 
 
 
308 aa  156  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.292138  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1044  quinolinate synthetase  32.47 
 
 
310 aa  155  9e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0487926  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0861  quinolinate synthetase  31.44 
 
 
447 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0832  quinolinate synthetase  31.14 
 
 
447 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0168  quinolinate synthetase complex, A subunit  36.26 
 
 
333 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.243178  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0092  quinolinate synthetase  33.53 
 
 
304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.871893  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0104  quinolinate synthetase  32.94 
 
 
303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1600  quinolinate synthetase complex, A subunit  33.54 
 
 
304 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1727  quinolinate synthetase  33.14 
 
 
306 aa  153  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000308382  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0379  quinolinate synthetase complex, A subunit  35.2 
 
 
298 aa  153  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.447962  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0678  quinolinate synthetase  30.15 
 
 
304 aa  152  8e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.657173  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5221  quinolinate synthetase complex, A subunit  33.54 
 
 
338 aa  152  1e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590266  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0467  quinolinate synthetase  33.13 
 
 
329 aa  151  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0943  quinolinate synthetase  31.25 
 
 
308 aa  151  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00785381  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1247  quinolinate synthetase  33.43 
 
 
370 aa  151  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0714  quinolinate synthetase  32.53 
 
 
322 aa  152  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.889108  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07311  quinolinate synthetase  28.99 
 
 
304 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.708071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>