More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1361 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  69.37 
 
 
595 aa  738  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  61.13 
 
 
520 aa  635  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  58.77 
 
 
518 aa  639  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  60.84 
 
 
520 aa  651  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  62.48 
 
 
520 aa  668  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  59.96 
 
 
542 aa  638  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  64.5 
 
 
526 aa  689  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
516 aa  1079  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  1.66548e-10  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1792  extracellular solute-binding protein family 5  66.73 
 
 
514 aa  743  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0136295  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  59.38 
 
 
517 aa  632  1e-180  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  59.19 
 
 
519 aa  622  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  59.38 
 
 
517 aa  620  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  53.19 
 
 
514 aa  566  1e-160  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  37.53 
 
 
526 aa  330  3e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  36.61 
 
 
527 aa  329  7e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  37.92 
 
 
528 aa  328  2e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1300  extracellular solute-binding protein  37.99 
 
 
526 aa  325  1e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3143  extracellular solute-binding protein  36.58 
 
 
524 aa  317  4e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0573017  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0877  4-phytase  37.86 
 
 
460 aa  313  5e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  36.78 
 
 
531 aa  305  2e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4474  extracellular solute-binding protein  36.63 
 
 
538 aa  302  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  34.44 
 
 
532 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  33.86 
 
 
528 aa  295  2e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2822  extracellular solute-binding protein  34.58 
 
 
517 aa  293  6e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.687608  normal  0.0566169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  33.66 
 
 
528 aa  292  8e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1815  extracellular solute-binding protein  36.23 
 
 
532 aa  291  2e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  35.43 
 
 
527 aa  290  6e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2819  extracellular solute-binding protein  35.81 
 
 
529 aa  287  2e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000112764  normal  0.172306 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  35.76 
 
 
526 aa  285  1e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  34.01 
 
 
528 aa  283  5e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  35.1 
 
 
544 aa  280  3e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0688  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 
523 aa  271  2e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110035  normal  0.066295 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0666  extracellular solute-binding protein family 5  31.64 
 
 
523 aa  270  4e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.404568  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  31.98 
 
 
528 aa  268  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  34.36 
 
 
520 aa  267  3e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  33.74 
 
 
526 aa  266  5e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  33.74 
 
 
526 aa  266  7e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  35.05 
 
 
530 aa  266  9e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  31.68 
 
 
509 aa  261  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1097  putative binding-dependent transport protein (periplasmic)  31.58 
 
 
528 aa  257  4e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  32.28 
 
 
556 aa  255  1e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  31.38 
 
 
535 aa  254  3e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  32.16 
 
 
528 aa  249  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  31.3 
 
 
530 aa  248  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  30.14 
 
 
535 aa  246  5e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  33.27 
 
 
516 aa  244  2e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  32.01 
 
 
514 aa  243  5e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  29.86 
 
 
533 aa  241  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  32.51 
 
 
516 aa  239  9e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  28.62 
 
 
533 aa  237  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  30.43 
 
 
512 aa  233  5e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0422  extracellular solute-binding protein  31.5 
 
 
527 aa  232  1e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147362  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5796  extracellular solute-binding protein  33 
 
 
526 aa  231  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00815808  hitchhiker  0.00391201 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0423  extracellular solute-binding protein  31.18 
 
 
527 aa  226  7e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204725  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  31.13 
 
 
531 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  31.24 
 
 
521 aa  224  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  29.96 
 
 
531 aa  222  1e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  31.43 
 
 
521 aa  222  1e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  27.06 
 
 
537 aa  220  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  30.86 
 
 
538 aa  219  9e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  30.7 
 
 
526 aa  216  1e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  32.05 
 
 
534 aa  213  7e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  31.63 
 
 
535 aa  210  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  31.98 
 
 
505 aa  210  4e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4690  extracellular solute-binding protein family 5  27.5 
 
 
524 aa  207  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  30.5 
 
 
522 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  28.93 
 
 
527 aa  206  7e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  29.66 
 
 
532 aa  206  9e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  30.2 
 
 
532 aa  206  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  31.2 
 
 
525 aa  206  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  29.83 
 
 
549 aa  205  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1240  extracellular solute-binding protein  28.95 
 
 
544 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.602045  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  29.23 
 
 
528 aa  201  3e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  30.13 
 
 
520 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  27.36 
 
 
515 aa  189  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  28.49 
 
 
521 aa  187  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  28.1 
 
 
521 aa  186  1e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  28.1 
 
 
521 aa  186  1e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.1 
 
 
521 aa  186  1e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  28.1 
 
 
521 aa  186  1e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 
528 aa  183  8e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  31.3 
 
 
528 aa  181  3e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  3.82125e-05  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  27.2 
 
 
495 aa  180  6e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  28.15 
 
 
502 aa  178  2e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  29.57 
 
 
534 aa  178  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  28.24 
 
 
497 aa  178  2e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  28.51 
 
 
532 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  1.84044e-11  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0184  extracellular solute-binding protein family 5  27.71 
 
 
518 aa  177  3e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 
534 aa  177  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  28.04 
 
 
500 aa  177  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  29.12 
 
 
509 aa  174  3e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  30.57 
 
 
524 aa  173  7e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4285  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 
530 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.261799  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  27.94 
 
 
530 aa  171  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2474  extracellular solute-binding protein  25.79 
 
 
525 aa  171  3e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4098  extracellular solute-binding protein family 5  27.69 
 
 
535 aa  169  8e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.711695  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0184  extracellular solute-binding protein  27.75 
 
 
535 aa  169  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.507506 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  27.87 
 
 
526 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4075  dipeptide ABC transporter, periplasmic dipeptide-binding protein  28.26 
 
 
535 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4056  periplasmic dipeptide transport protein  28.26 
 
 
535 aa  168  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>