257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1296 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1296  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 395 aa  783    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00381796  normal  0.151885 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  53.85 
 
 		 380 aa  396  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1948  permease, putative  54.78 
 
 		 397 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00215493  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  52.86 
 
 		 379 aa  374  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1804  permease YjgP/YjgQ family protein  50 
 
 		 392 aa  310  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  34.07 
 
 		 389 aa  212  9e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  32.27 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  34.13 
 
 		 391 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  30.75 
 
 		 418 aa  192  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  30.85 
 
 		 391 aa  192  1e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  31.68 
 
 		 391 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  32.06 
 
 		 399 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0189  permease YjgP/YjgQ family protein  30.97 
 
 		 423 aa  164  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.437061  normal  0.771409 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  32.89 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  30.48 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  26.2 
 
 		 392 aa  123  5e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  25.66 
 
 		 365 aa  108  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0512  hypothetical protein  26.23 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  24.73 
 
 		 434 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  27.25 
 
 		 370 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  25.19 
 
 		 792 aa  97.4  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  23.45 
 
 		 388 aa  93.6  6e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  22.64 
 
 		 403 aa  90.9  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  22.39 
 
 		 391 aa  90.1  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14500  hypothetical protein  27.42 
 
 		 372 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0135  permease YjgP/YjgQ family protein  24.8 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000106292 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2169  permease YjgP/YjgQ family protein  24.8 
 
 		 393 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.330163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2122  permease YjgP/YjgQ family protein  24.8 
 
 		 393 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  26.43 
 
 		 371 aa  87.4  4e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0138  permease YjgP/YjgQ family protein  24.53 
 
 		 395 aa  87  5e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  22.61 
 
 		 1153 aa  87  5e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  26.16 
 
 		 371 aa  86.7  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  25.96 
 
 		 371 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0824  permease YjgP/YjgQ family protein  21.81 
 
 		 444 aa  86.3  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00713526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  26.74 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  27 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  23.18 
 
 		 360 aa  83.6  0.000000000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  23.66 
 
 		 359 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  25.23 
 
 		 374 aa  80.9  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1030  permease YjgP/YjgQ family protein  24.03 
 
 		 1061 aa  80.1  0.00000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  25.7 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1283  hypothetical protein  27.15 
 
 		 372 aa  79.7  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  26.73 
 
 		 370 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  22.38 
 
 		 442 aa  79  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  25.4 
 
 		 398 aa  79  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1417  permease YjgP/YjgQ family protein  22.4 
 
 		 384 aa  78.2  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  24.67 
 
 		 356 aa  79  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1543  permease YjgP/YjgQ family protein  24.25 
 
 		 1096 aa  78.2  0.0000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00918394  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1090  permease YjgP/YjgQ family protein  23.76 
 
 		 1061 aa  78.2  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0453768  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  23.12 
 
 		 391 aa  77.8  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1272  hypothetical protein  25.33 
 
 		 375 aa  77  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  24.59 
 
 		 388 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2508  permease YjgP/YjgQ family protein  24.67 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.756055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  24.04 
 
 		 392 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  24.74 
 
 		 360 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  25.06 
 
 		 369 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  24.54 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  23.63 
 
 		 369 aa  74.3  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1901  permease YjgP/YjgQ family protein  22.59 
 
 		 441 aa  74.3  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2917  permease YjgP/YjgQ  25.58 
 
 		 386 aa  74.3  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  22.74 
 
 		 442 aa  74.3  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1092  permease YjgP/YjgQ  25.4 
 
 		 375 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2734  permease YjgP/YjgQ family protein  21.29 
 
 		 364 aa  73.9  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.121109  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  22.85 
 
 		 360 aa  73.2  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0872  permease YjgP/YjgQ  26.84 
 
 		 370 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000506114  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0990  permease YjgP/YjgQ  26.54 
 
 		 373 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.171814  normal  0.796458 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  23.95 
 
 		 370 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  22.85 
 
 		 360 aa  72  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  23.95 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  26.54 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  30.46 
 
 		 478 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  23.95 
 
 		 370 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 1040 aa  71.6  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1788  permease  19.75 
 
 		 483 aa  71.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0970629 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1232  permease  26.33 
 
 		 384 aa  70.5  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  28.64 
 
 		 501 aa  70.9  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  24.21 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0309  permease YjgP/YjgQ family protein  21.62 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  25.42 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  23.15 
 
 		 370 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  23.2 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  21.21 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2512  permease YjgP/YjgQ family protein  21.72 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  23.63 
 
 		 443 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  24.68 
 
 		 361 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  24.16 
 
 		 370 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  24.8 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  22.13 
 
 		 359 aa  67.4  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  27.54 
 
 		 388 aa  67  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1482  putative permease  24.53 
 
 		 400 aa  66.6  0.0000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0253141  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01575  permease YjgP/YjgQ  25.07 
 
 		 366 aa  67  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.154727  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  20.91 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1910  permease YjgP/YjgQ  26.5 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3561  permease YjgP/YjgQ  26.69 
 
 		 368 aa  66.2  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000903673  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  24.75 
 
 		 388 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  24.6 
 
 		 373 aa  65.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0241  permease YjgP/YjgQ family protein  25.2 
 
 		 481 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0581  hypothetical protein  24.33 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.201151  normal  0.566997 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>