More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1260 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0822  GTP-binding protein TypA  69.02 
 
 		 612 aa  896    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.447819 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0864  GTP-binding protein TypA  70.33 
 
 		 619 aa  917    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  51.49 
 
 		 614 aa  645    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1976  GTP-binding protein TypA  52.73 
 
 		 615 aa  637    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.796307  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1761  small GTP-binding protein  64.83 
 
 		 634 aa  811    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  51.91 
 
 		 606 aa  641    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1533  GTP-binding protein TypA  68.95 
 
 		 614 aa  867    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.445026  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0462  GTP-binding protein TypA  67.77 
 
 		 608 aa  850    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1987  small GTP-binding TypA  52.73 
 
 		 615 aa  637    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.69102  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  50.9 
 
 		 616 aa  637    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2431  GTP-binding protein TypA  54.8 
 
 		 608 aa  667    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.318705  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  55.28 
 
 		 605 aa  675    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1260  GTP-binding protein TypA  100 
 
 		 613 aa  1248    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.826692  normal  0.0575842 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0678  GTP-binding protein TypA  56.27 
 
 		 594 aa  671    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0381513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1891  GTP-binding protein TypA  52.73 
 
 		 615 aa  637    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  51.82 
 
 		 610 aa  639    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  51.65 
 
 		 610 aa  637    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1107  GTP-binding protein TypA  52.58 
 
 		 617 aa  636    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00406487  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  56.66 
 
 		 594 aa  669    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  52.26 
 
 		 605 aa  647    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1010  GTP-binding protein TypA  68.44 
 
 		 613 aa  861    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  56.31 
 
 		 608 aa  711    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1853  GTP-binding protein TypA  51.97 
 
 		 616 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.353708  normal  0.518718 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3865  GTP-binding protein TypA  51.9 
 
 		 620 aa  634  1e-180  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  52.87 
 
 		 608 aa  629  1e-179  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2766  GTP-binding protein TypA  52.74 
 
 		 617 aa  630  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.254596 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  52.21 
 
 		 592 aa  630  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0864  GTP-binding protein TypA  52.44 
 
 		 613 aa  630  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.662767 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  49.75 
 
 		 603 aa  628  1e-178  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  52.33 
 
 		 608 aa  627  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3837  GTP-binding protein TypA  51.69 
 
 		 630 aa  627  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0712464  normal  0.953349 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  51.69 
 
 		 602 aa  627  1e-178  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3484  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 608 aa  626  1e-178  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000244002  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19530  GTP-binding protein TypA/BipA  51.42 
 
 		 629 aa  625  1e-178  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.2515  normal  0.0383098 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45830  small GTP-binding protein TypA  51.17 
 
 		 606 aa  624  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  50.33 
 
 		 610 aa  622  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2456  GTP-binding protein TypA  50.73 
 
 		 650 aa  619  1e-176  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4138  GTP-binding protein TypA  51.17 
 
 		 606 aa  620  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.781613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0751  GTP-binding protein TypA  50.96 
 
 		 630 aa  621  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  51.26 
 
 		 605 aa  621  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0692  GTP-binding protein TypA  49.07 
 
 		 604 aa  619  1e-176  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7974  GTP-binding protein TypA  50.89 
 
 		 617 aa  621  1e-176  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427033  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01592  BipA protein  51.85 
 
 		 610 aa  616  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3113  GTP-binding protein TypA  51.16 
 
 		 620 aa  617  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218846  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 603 aa  617  1e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  51.01 
 
 		 598 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  51.35 
 
 		 605 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0347  GTP-binding protein TypA  50.99 
 
 		 606 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  51.35 
 
 		 632 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  50.42 
 
 		 605 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  51.35 
 
 		 599 aa  611  1e-173  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0361  GTP-binding protein TypA  51.57 
 
 		 606 aa  611  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4815  GTP-binding protein TypA  51.57 
 
 		 606 aa  608  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  51.27 
 
 		 593 aa  610  1e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1430  GTP-binding protein TypA  51.56 
 
 		 609 aa  610  1e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000885386  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001903  GTP-binding protein TypA/BipA  50.58 
 
 		 609 aa  608  9.999999999999999e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00233609  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0318  GTP-binding protein TypA  53.04 
 
 		 595 aa  607  9.999999999999999e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 610 aa  606  9.999999999999999e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3132  GTP-binding protein TypA  50.41 
 
 		 641 aa  607  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  50.5 
 
 		 610 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2006  GTP-binding protein TypA  50.57 
 
 		 620 aa  607  9.999999999999999e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.766438 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1235  GTP-binding protein TypA  51.34 
 
 		 606 aa  605  9.999999999999999e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.684296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1306  GTP-binding protein TypA  52.33 
 
 		 607 aa  607  9.999999999999999e-173  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  52.52 
 
 		 602 aa  607  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5096  GTP-binding protein TypA  50.41 
 
 		 606 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3360  GTP-binding protein TypA  51.07 
 
 		 622 aa  604  1.0000000000000001e-171  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.957899  hitchhiker  0.00356234 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  51.77 
 
 		 605 aa  602  1.0000000000000001e-171  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  52.18 
 
 		 608 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0448  EF-Tu; elongation factor Tu  51.59 
 
 		 606 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1424  GTP-binding protein TypA  50.41 
 
 		 610 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  50.17 
 
 		 598 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0420  GTP-binding protein TypA  50.41 
 
 		 606 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.710155 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1224  GTP-binding protein TypA  50.51 
 
 		 605 aa  602  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00590  GTPase  49.75 
 
 		 609 aa  602  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  52.18 
 
 		 608 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2316  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 609 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  50.17 
 
 		 601 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2101  GTP-binding protein TypA  51.59 
 
 		 606 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.42621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4316  GTP-binding protein TypA  50 
 
 		 624 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.279225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4918  GTP-binding protein TypA  50.08 
 
 		 606 aa  601  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5044  GTP-binding protein TypA  50.25 
 
 		 606 aa  601  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1307  GTP-binding protein TypA  51.59 
 
 		 610 aa  601  1e-170  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.992713  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  49.83 
 
 		 613 aa  600  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  52.18 
 
 		 608 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  50.92 
 
 		 608 aa  601  1e-170  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  50.92 
 
 		 608 aa  601  1e-170  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  52.18 
 
 		 608 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1516  GTP-binding protein TypA  48.25 
 
 		 602 aa  599  1e-170  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  49.83 
 
 		 601 aa  598  1e-170  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  50.34 
 
 		 602 aa  600  1e-170  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  50.17 
 
 		 603 aa  600  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  52.02 
 
 		 608 aa  601  1e-170  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0693  GTP-binding protein TypA  50.66 
 
 		 614 aa  598  1e-170  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.420987  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2369  GTP-binding protein TypA  50.92 
 
 		 606 aa  599  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.543086 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  48.74 
 
 		 600 aa  599  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  52.18 
 
 		 608 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  49.83 
 
 		 601 aa  600  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1133  GTP-binding protein TypA  50.63 
 
 		 630 aa  600  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0323603 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  50.08 
 
 		 603 aa  599  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3483  GTP-binding virulence regulator protein BipA  50.25 
 
 		 607 aa  598  1e-170  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.325344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>