More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1247 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1247  Redoxin domain protein  100 
 
 		 173 aa  350  7e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00450523  normal  0.919673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2340  redoxin domain-containing protein  60.84 
 
 		 171 aa  209  1e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0726108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2313  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  61.49 
 
 		 171 aa  201  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.262276  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1832  redoxin domain-containing protein  57.23 
 
 		 172 aa  189  2e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.286285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2467  Redoxin domain protein  53.25 
 
 		 171 aa  185  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.000000376738  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0183  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  54.17 
 
 		 171 aa  183  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000056289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2959  Redoxin domain protein  54.76 
 
 		 171 aa  181  3e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2901  redoxin domain-containing protein  54.76 
 
 		 169 aa  179  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000419182  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0867  Redoxin domain protein  51.57 
 
 		 170 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.434649 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0352  thiol peroxidase  53.57 
 
 		 171 aa  177  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1011  Redoxin domain protein  55.19 
 
 		 167 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4470  redoxin domain-containing protein  52.17 
 
 		 166 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0487  thiol peroxidase  52.17 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.309589 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1081  Redoxin domain protein  48.78 
 
 		 171 aa  171  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4748  thiol peroxidase  51.55 
 
 		 166 aa  170  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4373  thiol peroxidase  51.55 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0729  Redoxin domain protein  53.59 
 
 		 166 aa  169  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0010  redoxin domain-containing protein  46.91 
 
 		 168 aa  167  9e-41  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0754546  hitchhiker  0.00424359 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1769  thiol peroxidase  50.62 
 
 		 164 aa  167  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1804  thiol peroxidase  50.62 
 
 		 164 aa  167  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3312  redoxin domain-containing protein  52.94 
 
 		 166 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2710  Redoxin domain protein  52.94 
 
 		 166 aa  164  4e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1277  thiol peroxidase  46.91 
 
 		 164 aa  164  6.9999999999999995e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.189969  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5269  Redoxin domain protein  49.4 
 
 		 232 aa  163  1.0000000000000001e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4010  Redoxin domain protein  50.33 
 
 		 167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000420392  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4103  Redoxin domain protein  50.33 
 
 		 167 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4775  thiol peroxidase  50.98 
 
 		 166 aa  160  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4537  thiol peroxidase  50.98 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.451168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4383  thiol peroxidase  50.98 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4890  thiol peroxidase  50.98 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4757  thiol peroxidase  50.98 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4774  thiol peroxidase  50.98 
 
 		 166 aa  159  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1306  Redoxin domain protein  46.67 
 
 		 170 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2802  redoxin domain-containing protein  46.11 
 
 		 197 aa  151  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0473  Redoxin domain protein  44.72 
 
 		 164 aa  150  7e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2534  Redoxin domain protein  47.06 
 
 		 167 aa  150  7e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3579  anti-oxidant AhpCTSA family protein  45.45 
 
 		 228 aa  149  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2464  anti-oxidant AhpCTSA family protein  44.38 
 
 		 191 aa  150  1e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00897143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0524  Redoxin domain protein  45.27 
 
 		 171 aa  143  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00000965772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2147  Redoxin domain protein  49.35 
 
 		 165 aa  143  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1783  thiol peroxidase (scavengase P20)  43.98 
 
 		 181 aa  141  5e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2676  redoxin domain-containing protein  42.24 
 
 		 197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.055079  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3341  anti-oxidant AhpCTSA family protein  40.99 
 
 		 197 aa  137  7e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1349  Redoxin domain protein  41.32 
 
 		 197 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0251869  hitchhiker  0.0000000000448162 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3014  redoxin domain-containing protein  41.32 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000289393  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3029  redoxin domain-containing protein  41.32 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000167246  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0035  Redoxin domain protein  45 
 
 		 168 aa  137  1e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3172  redoxin domain-containing protein  41.32 
 
 		 197 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000900168  hitchhiker  0.000325363 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1204  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  40.99 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00223089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1275  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  40.99 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000737792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1205  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  40.99 
 
 		 197 aa  136  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0888601  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1131  thiol peroxidase  41.36 
 
 		 164 aa  135  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1360  antioxidant Tpx  40.12 
 
 		 204 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000292969  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0408  redoxin domain-containing protein  42.77 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.989776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1036  redoxin domain-containing protein  43.4 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2971  thiol peroxidase  46.67 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.535001  normal  0.296496 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1822  Redoxin domain protein  38.55 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1778  thiol peroxidase  41.36 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0452  Redoxin domain protein  39.02 
 
 		 166 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418969  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0865  redoxin domain-containing protein  43.29 
 
 		 167 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0949069 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0879  Redoxin domain protein  44.24 
 
 		 167 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.980796  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0875  Redoxin domain protein  44.24 
 
 		 167 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0828  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  43.64 
 
 		 187 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1620  thiol peroxidase  41.36 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000227815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0630  thiol peroxidase  39.51 
 
 		 169 aa  122  3e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0146681  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0997  thiol peroxidase  40.37 
 
 		 164 aa  122  3e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.985452  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0833  thiol peroxidase  42.59 
 
 		 173 aa  120  7e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.734828  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3798  redoxin domain-containing protein  41.25 
 
 		 165 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.247869  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2579  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  41.36 
 
 		 166 aa  119  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0691363  normal  0.0286465 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0783  thiol peroxidase  44.3 
 
 		 174 aa  118  3e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3430  Redoxin domain protein  39.63 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0751416  normal  0.0131471 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3035  thiol peroxidase  43.29 
 
 		 166 aa  117  7e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1193  redoxin domain-containing protein  41.4 
 
 		 165 aa  117  7e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2625  thiol peroxidase  43.29 
 
 		 166 aa  117  9e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963895  normal  0.840008 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0211  Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  40.49 
 
 		 165 aa  116  9.999999999999999e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.29757  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0132  thiol peroxidase  38.04 
 
 		 167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0830  thiol peroxidase  41.88 
 
 		 166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0642  thiol peroxidase (scavengase P20)  37.35 
 
 		 175 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0950  thiol peroxidase  41.36 
 
 		 166 aa  116  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0554  Redoxin domain protein  39.88 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.454975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2140  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  39.02 
 
 		 166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000663162  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0730  thiol peroxidase  42.59 
 
 		 187 aa  114  6e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.543369 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0528  thiol peroxidase (atypical 2-Cys peroxiredoxin)  38.41 
 
 		 166 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1130  Redoxin domain protein  36.36 
 
 		 169 aa  114  7.999999999999999e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000023732  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3068  thiol peroxidase  41.46 
 
 		 166 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0870  thiol peroxidase  41.94 
 
 		 175 aa  111  5e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0445504  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0841  redoxin domain-containing protein  38.41 
 
 		 199 aa  111  5e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.227128  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0800  thiol peroxidase  41.94 
 
 		 175 aa  111  5e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.341037  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06240  thiol peroxidase  38.27 
 
 		 166 aa  111  6e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0091  Redoxin domain protein  41.98 
 
 		 166 aa  110  7.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1795  thiol peroxidase  39.63 
 
 		 167 aa  110  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1903  thiol peroxidase  39.63 
 
 		 167 aa  110  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2633  redoxin domain-containing protein  37.8 
 
 		 166 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2790  thiol peroxidase  40.24 
 
 		 166 aa  110  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.071312  normal  0.970816 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0624  thiol peroxidase  41.88 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000437492  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2752  thiol peroxidase  39.38 
 
 		 166 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.376703  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1232  thiol peroxidase  41.29 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1133  Redoxin domain protein  40.85 
 
 		 197 aa  108  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0528381  normal  0.881075 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1717  Redoxin domain protein  38.27 
 
 		 175 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1888  thiol peroxidase  39.38 
 
 		 166 aa  108  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.210029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>