More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1204 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1204  nitroreductase  100 
 
 		 174 aa  360  7.0000000000000005e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.460953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2975  nitroreductase  53.85 
 
 		 169 aa  207  5e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.522963 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1212  nitroreductase  54.44 
 
 		 176 aa  204  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.411819  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0809  nitroreductase  57.4 
 
 		 169 aa  204  5e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.177891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1379  NADPH-flavin oxidoreductase  53.49 
 
 		 174 aa  203  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  54.6 
 
 		 166 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  55.21 
 
 		 166 aa  198  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2262  nitroreductase  49.11 
 
 		 169 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000575294  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1158  nitroreductase  46.75 
 
 		 169 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000244648  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3299  NADPH-flavin oxidoreductase  46.75 
 
 		 169 aa  180  1e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.47744  normal  0.537095 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0617  nitroreductase  47.93 
 
 		 169 aa  178  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.146729  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1328  nitroreductase  51.18 
 
 		 170 aa  174  7e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000802581 
 
 
-
 
NC_002936  DET0645  nitroreductase family protein  46.75 
 
 		 171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0679  nitroreductase family protein  46.75 
 
 		 171 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_585  nitroreductase  46.75 
 
 		 169 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.179153  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1120  nitroreductase  47.62 
 
 		 173 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.960146  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0575  nitroreductase  45.96 
 
 		 163 aa  167  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1353  nitroreductase family protein  51.48 
 
 		 169 aa  167  5e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360113  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1563  nitroreductase  44.64 
 
 		 173 aa  167  9e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1114  nitroreductase  45.18 
 
 		 173 aa  165  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0837  nitroreductase  44.58 
 
 		 173 aa  162  2.0000000000000002e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.638671  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0846  nitroreductase  42.77 
 
 		 169 aa  154  8e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.245537  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1141  nitroreductase  38.1 
 
 		 171 aa  144  6e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.426198  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0440  nitroreductase  36.97 
 
 		 201 aa  141  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.407872  normal  0.661672 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3226  nitroreductase  38.29 
 
 		 187 aa  138  3e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.236693  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0271  nitroreductase  39.64 
 
 		 171 aa  138  4.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000757805  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  38.55 
 
 		 166 aa  134  5e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1294  nitroreductase  38.41 
 
 		 167 aa  130  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0670007  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1605  NADPH-flavin oxidoreductase  37.65 
 
 		 169 aa  130  1.0000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1862  nitroreductase  34.12 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  38.42 
 
 		 176 aa  122  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05880  nitroreductase  39.39 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  38.98 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1344  nitroreductase  38.55 
 
 		 178 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  38.42 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2835  nitroreductase  38.01 
 
 		 186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000042093  hitchhiker  0.00000000000000316815 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  39.39 
 
 		 192 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0115  nitroreductase  38.96 
 
 		 274 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00205311  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  39.87 
 
 		 167 aa  111  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1652  nitroreductase  39.63 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.177323  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  36 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1241  nitroreductase  38.51 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0123  nitroreductase  35.08 
 
 		 184 aa  108  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  40.51 
 
 		 167 aa  107  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2105  nitroreductase  36.2 
 
 		 176 aa  107  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.892838  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1846  nitroreductase  33.14 
 
 		 172 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000122819 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1997  nitroreductase  33.9 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0291646  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2373  nitroreductase  35.03 
 
 		 172 aa  105  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00327904  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1207  nitroreductase  33.92 
 
 		 165 aa  104  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0777981  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0229  nitroreductase  34.16 
 
 		 169 aa  104  7e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00298374  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0649  nitroreductase  32.92 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.535499  normal  0.149872 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1625  nitroreductase  31.46 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0106837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3515  nitroreductase  33.51 
 
 		 186 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00093713  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3049  nitroreductase  36.25 
 
 		 170 aa  100  9e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1183  nitroreductase  31.82 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000761176  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  32.02 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0739  nitroreductase  34.42 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.033186  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  34.71 
 
 		 177 aa  99.4  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  35.62 
 
 		 170 aa  98.6  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  32.18 
 
 		 176 aa  97.4  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  34.18 
 
 		 180 aa  97.1  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  32.57 
 
 		 178 aa  97.1  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0217  nitroreductase family protein  33.33 
 
 		 188 aa  96.7  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0893  nitroreductase  33.15 
 
 		 187 aa  96.3  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0202115  hitchhiker  0.00000963559 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1448  hypothetical protein  36.36 
 
 		 176 aa  95.9  3e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  37.5 
 
 		 174 aa  95.9  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1624  nitroreductase  29.48 
 
 		 176 aa  95.1  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.101829  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  29.76 
 
 		 204 aa  92  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0706  nitroreductase  34.51 
 
 		 168 aa  92  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.272775 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0470  nitroreductase  30.06 
 
 		 171 aa  90.9  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0538  nitroreductase  36.54 
 
 		 173 aa  90.5  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.508641  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3002  nitroreductase  28.81 
 
 		 195 aa  90.5  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.454313  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0908  nitroreductase  33.33 
 
 		 168 aa  89  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0579  nitroreductase  29.71 
 
 		 173 aa  89  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2855  nitroreductase  33.15 
 
 		 191 aa  88.6  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.151785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4232  nitroreductase  33.52 
 
 		 214 aa  88.6  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  37.27 
 
 		 172 aa  88.6  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0344  nitroreductase  31.13 
 
 		 166 aa  87  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  37.84 
 
 		 173 aa  87  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1903  nitroreductase  31.89 
 
 		 185 aa  87  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1518  nitroreductase  30.92 
 
 		 170 aa  86.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1720  nitroreductase  31.98 
 
 		 196 aa  85.9  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  28.41 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1211  nitroreductase  28.42 
 
 		 189 aa  85.5  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0485  nitroreductase  29.47 
 
 		 189 aa  85.5  4e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.199032  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1568  nitroreductase  31.95 
 
 		 191 aa  84.7  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0787  nitroreductase family protein  39.75 
 
 		 177 aa  84.3  8e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0290068  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1356  nitroreductase  30.93 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2738  nitroreductase  32.54 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1423  nitroreductase  29.47 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.11534  normal  0.755598 
 
 
-
 
NC_002950  PG0310  nitroreductase family protein  34.84 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.889708 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3266  nitroreductase family protein  32.94 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.73269  normal  0.216449 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13220  nitroreductase  31.54 
 
 		 278 aa  83.2  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  31.36 
 
 		 174 aa  83.2  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0144  nitroreductase  33.73 
 
 		 184 aa  82.4  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2465  nitroreductase  34.03 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.3868  normal  0.0443653 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  32 
 
 		 175 aa  80.9  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0694  nitroreductase  30 
 
 		 183 aa  80.9  0.000000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.402157  unclonable  1.19991e-19 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5045  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  28 
 
 		 584 aa  80.1  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87863  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1011  nitroreductase  32.28 
 
 		 329 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>