49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1187 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1187  protein of unknown function DUF107  100 
 
 
151 aa  298  2e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  35.25 
 
 
147 aa  68.6  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0052  protein of unknown function DUF107  27.21 
 
 
158 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1056  protein of unknown function DUF107  30.3 
 
 
153 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  33.57 
 
 
151 aa  53.5  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3005  protein of unknown function DUF107  32.84 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1803  nodulation efficiency protein NfeD  28.48 
 
 
437 aa  50.8  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  28.03 
 
 
142 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  28.03 
 
 
142 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0461  protein of unknown function DUF107  28.87 
 
 
145 aa  50.4  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  29.73 
 
 
152 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0648  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity, NfeD-like  28.37 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.24585  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  31.16 
 
 
149 aa  48.9  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  31.21 
 
 
145 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  29.08 
 
 
143 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  29.08 
 
 
145 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  32.06 
 
 
154 aa  47.8  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  29.08 
 
 
145 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  27.48 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0463  hypothetical protein  32.62 
 
 
157 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000652394  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3388  hypothetical protein  28.1 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000297052  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4130  hypothetical protein  29.13 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3503  hypothetical protein  29.75 
 
 
156 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000560855  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0449  hypothetical protein  29.75 
 
 
156 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00108597  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3678  hypothetical protein  29.13 
 
 
156 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000205665  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  29.08 
 
 
144 aa  43.9  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4507  hypothetical protein  29.71 
 
 
153 aa  43.9  0.0009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0857402  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  27.08 
 
 
147 aa  43.5  0.0009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  26.53 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  30 
 
 
143 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  23.81 
 
 
142 aa  43.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0545  hypothetical protein  27.56 
 
 
156 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000254909  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1731  hypothetical protein  36.21 
 
 
421 aa  42.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06891  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  26.97 
 
 
147 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  25.85 
 
 
140 aa  42.4  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3474  nodulation efficiency protein NfeD  33.93 
 
 
442 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0121141 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3401  hypothetical protein  28.99 
 
 
153 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0465  protein of unknown function DUF107  28.57 
 
 
147 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0479  protein of unknown function DUF107  28.57 
 
 
147 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1704  nucleolar GTP-binding 1  28.67 
 
 
154 aa  40.8  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0462  hypothetical protein  27.66 
 
 
159 aa  40.8  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3850  hypothetical protein  28.1 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149984  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>