More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1185 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1185  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  100 
 
 		 696 aa  1414    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1592  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.68 
 
 		 703 aa  249  1e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2486  histidine kinase  26.38 
 
 		 716 aa  238  3e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3139  histidine kinase  25.55 
 
 		 724 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3744  sensor histidine kinase  24.19 
 
 		 718 aa  214  4.9999999999999996e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.297445 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1184  histidine kinase  24.34 
 
 		 730 aa  195  2e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0470361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2222  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  22.81 
 
 		 655 aa  165  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0084  histidine kinase  33.79 
 
 		 653 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.218046 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  18.9 
 
 		 544 aa  116  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 		 498 aa  102  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2862  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.18 
 
 		 390 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3869  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.49 
 
 		 611 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.793663  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2577  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.73 
 
 		 390 aa  99.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00911748  normal  0.381184 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3726  histidine kinase  26.03 
 
 		 654 aa  99.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2883  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.18 
 
 		 389 aa  98.6  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.703794  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1811  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.22 
 
 		 384 aa  98.2  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659611 
 
 
-
 
NC_004310  BR1118  nitrogen regulation protein NtrB  30.09 
 
 		 367 aa  98.2  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1444  nitrogen regulation protein ntrB  29.09 
 
 		 391 aa  97.8  6e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.907164 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  25.23 
 
 		 298 aa  97.8  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4069  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.73 
 
 		 395 aa  97.8  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.089551  normal  0.329257 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2589  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.73 
 
 		 390 aa  97.4  8e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206184  normal  0.0145748 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1076  nitrogen regulation protein NtrB  30.09 
 
 		 380 aa  97.4  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00900677  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3785  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.49 
 
 		 611 aa  97.1  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.862005  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2071  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.13 
 
 		 374 aa  96.7  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0183678  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1618  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.68 
 
 		 384 aa  95.9  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0197  histidine kinase  28.63 
 
 		 436 aa  95.1  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0398  nitrogen regulation protein NR(II)  29.36 
 
 		 371 aa  95.1  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.737334  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 970 aa  95.1  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3078  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.72 
 
 		 369 aa  95.1  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.44 
 
 		 351 aa  94.4  6e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.35 
 
 		 869 aa  94.4  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1404  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.31 
 
 		 361 aa  94  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236023 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0915  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.84 
 
 		 362 aa  94  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.115848  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3261  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.57 
 
 		 355 aa  94  9e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  26.73 
 
 		 363 aa  93.6  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0049  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.49 
 
 		 365 aa  93.6  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3046  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.57 
 
 		 377 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.823281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2334  histidine kinase  29.96 
 
 		 587 aa  93.6  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000483532  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0733  histidine kinase  29.41 
 
 		 1347 aa  93.2  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  29.05 
 
 		 673 aa  93.6  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2819  PAS sensor protein  28.57 
 
 		 377 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.295885  normal  0.569504 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2806  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.31 
 
 		 361 aa  93.6  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2937  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.57 
 
 		 381 aa  93.6  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0320992  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  28.29 
 
 		 304 aa  92.8  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1970  sensory box histidine kinase  30.41 
 
 		 415 aa  92.4  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.645732  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3728  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.57 
 
 		 613 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0478  histidine kinase  27.37 
 
 		 555 aa  92.4  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 781 aa  92.8  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276593  decreased coverage  0.00464659 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0104  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.44 
 
 		 367 aa  92.8  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5929  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.84 
 
 		 367 aa  92  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23107  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4022  sensor protein ZraS  28.23 
 
 		 458 aa  92  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.425845  normal  0.0216302 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  28.71 
 
 		 458 aa  91.7  4e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03880  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ZraR  29.38 
 
 		 458 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0731183  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  28.51 
 
 		 458 aa  91.7  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 		 595 aa  91.7  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0320  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 576 aa  91.3  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6538  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.96 
 
 		 367 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  28.71 
 
 		 458 aa  91.3  5e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0245  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.82 
 
 		 365 aa  91.3  5e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1952  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.74 
 
 		 752 aa  90.9  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5000  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.21 
 
 		 358 aa  91.3  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0414  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.03 
 
 		 581 aa  90.9  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1619  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31 
 
 		 377 aa  90.5  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2038  histidine kinase  28.38 
 
 		 552 aa  90.5  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0696  histidine kinase  27.57 
 
 		 248 aa  90.5  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0073771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.9 
 
 		 869 aa  90.5  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.02 
 
 		 492 aa  90.5  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3455  putative signal transduction protein  23.23 
 
 		 274 aa  90.5  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0941  sensor histidine kinase, putative  26.79 
 
 		 248 aa  90.1  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 		 862 aa  90.1  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1089  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.31 
 
 		 380 aa  89.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0089  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 705 aa  90.1  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0206322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 672 aa  90.5  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5473  sensor protein ZraS  28.71 
 
 		 458 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.548998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4452  sensor protein ZraS  28.71 
 
 		 458 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.260374  hitchhiker  0.000970682 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1511  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.21 
 
 		 575 aa  89.4  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.55 
 
 		 365 aa  89.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 		 652 aa  89  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2169  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.27 
 
 		 380 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.942916 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1855  GAF sensor hybrid histidine kinase  26.84 
 
 		 1285 aa  89.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0879  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 903 aa  89.4  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0488  histidine kinase  30.77 
 
 		 250 aa  89.4  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0246  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.91 
 
 		 373 aa  89  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.1011 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0969  histidine kinase  28.7 
 
 		 801 aa  89  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000115814  hitchhiker  0.0000040144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4258  histidine kinase  27.62 
 
 		 506 aa  89  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4376  histidine kinase  28.84 
 
 		 667 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314442  normal  0.0171304 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3990  histidine kinase  28.07 
 
 		 465 aa  88.6  4e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3364  histidine kinase  28.91 
 
 		 249 aa  88.6  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1518  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.64 
 
 		 391 aa  88.6  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0435216 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4160  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.34 
 
 		 516 aa  88.2  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  23.39 
 
 		 299 aa  87.8  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2134  two component sensor kinase  27.4 
 
 		 381 aa  88.2  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.211649  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0188  putative signal transduction protein  26.9 
 
 		 274 aa  87.8  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3601  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 399 aa  88.2  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2268  histidine kinase  27.19 
 
 		 571 aa  87.8  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.467853  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2542  nitrogen regulation protein NR(II)  26.15 
 
 		 364 aa  87.8  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2033  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.46 
 
 		 381 aa  87.8  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.825681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.21 
 
 		 747 aa  87.8  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1814  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 381 aa  87.4  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.21 
 
 		 747 aa  87.4  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>