More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1180 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1180  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
333 aa  681    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3609  glycosyl transferase family protein  50.33 
 
 
319 aa  328  9e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.361968 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02590  Glycosyl transferase, family 2  50 
 
 
328 aa  323  2e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105398  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2124  glycosyl transferase family protein  51.14 
 
 
340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3710  glycosyl transferase family 2  51.14 
 
 
345 aa  312  3.9999999999999997e-84  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0328231  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2557  glycosyl transferase family 2  50.32 
 
 
321 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  49.52 
 
 
352 aa  291  1e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001053  glycosyltransferase  45.78 
 
 
333 aa  290  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2554  glycosyl transferase family 2  46.58 
 
 
385 aa  284  2.0000000000000002e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0014  glycosyl transferase family protein  45.83 
 
 
357 aa  272  5.000000000000001e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00192438  hitchhiker  0.0000617059 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1795  glycosyl transferase family 2  46.03 
 
 
357 aa  270  4e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00120607  normal  0.517558 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1957  glycosyl transferase family protein  42.68 
 
 
327 aa  266  4e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.890096  normal  0.0695773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4518  glycosyl transferase family protein  45.19 
 
 
346 aa  264  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000506598  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2360  glycosyl transferase family 2  45.28 
 
 
354 aa  262  6.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.571738  normal  0.010101 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3369  glycosyl transferase family protein  45.31 
 
 
349 aa  253  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000732835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  34.11 
 
 
253 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2614  glycosyl transferase family 2  36.73 
 
 
253 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000501358  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1891  glycosyl transferase family 2  28.75 
 
 
307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0644224  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  31.75 
 
 
353 aa  104  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  34 
 
 
228 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  35.52 
 
 
228 aa  103  5e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 
228 aa  102  8e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  24.91 
 
 
321 aa  99.4  8e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  29.65 
 
 
340 aa  99.4  8e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  31.03 
 
 
749 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  32.99 
 
 
229 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
271 aa  98.2  2e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  33.5 
 
 
229 aa  98.2  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  28.36 
 
 
340 aa  96.3  7e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  29.27 
 
 
232 aa  95.1  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  30.96 
 
 
448 aa  92.8  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3268  glycosyl transferase family protein  27.33 
 
 
301 aa  92.8  8e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.230129  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0213  glycosyltransferase  31.28 
 
 
245 aa  92.4  9e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  29.05 
 
 
243 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0997  glycosyl transferase family 2  31.93 
 
 
226 aa  92  1e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  33.96 
 
 
340 aa  92.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1440  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  28.52 
 
 
238 aa  91.3  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000177815  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12000  glycosyl transferase  31.07 
 
 
243 aa  90.1  5e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.2509  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5400  glycosyl transferase family 2  32.52 
 
 
242 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5439  glycosyl transferase family protein  26.21 
 
 
318 aa  87.8  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409954  normal  0.431845 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1189  glycosyltransferase, group 2 family protein  27.09 
 
 
310 aa  87.8  2e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  29.31 
 
 
355 aa  87.4  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8133  glycosyl transferase, family 2  32.98 
 
 
260 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  32.18 
 
 
230 aa  87  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1421  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.12 
 
 
243 aa  86.7  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000839573  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 
230 aa  86.7  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4836  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 
244 aa  85.9  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000403923  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2355  glycosyl transferase family 2  28.32 
 
 
250 aa  85.9  9e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000348766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3866  glycosyl transferase family 2  30.61 
 
 
324 aa  85.9  9e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0214545  decreased coverage  0.00118676 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2187  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.1 
 
 
246 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.117888  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  31.9 
 
 
242 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2240  glycosyl transferase family 2  34.05 
 
 
226 aa  84.7  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  30.05 
 
 
344 aa  84.3  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0487  glycosyl transferase family 2  27.59 
 
 
284 aa  84  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1077  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 
298 aa  83.6  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.273313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  31.29 
 
 
242 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1930  glycosyl transferase family 2  31.82 
 
 
246 aa  83.2  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462816 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2422  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.47 
 
 
244 aa  83.2  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000393147  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2065  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  35.62 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0342924 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2523  fused dolichol-phosphate mannosyltransferase/uncharacterized protein  30.32 
 
 
305 aa  82.8  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.49497  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2932  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  32.21 
 
 
264 aa  82.8  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000763611  hitchhiker  0.000488065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7628  glycosyl transferase family 2  31.05 
 
 
306 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.325444  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  29.34 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  29.41 
 
 
287 aa  82.4  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2074  glycosyl transferase family 2  30.82 
 
 
327 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21780  glycosyl transferase  31.55 
 
 
261 aa  81.3  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.229815  normal  0.622988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5318  glycosyl transferase family 2  29.27 
 
 
246 aa  80.9  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583889  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  31.71 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0843  glycosyl transferase family 2  26.89 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  29.06 
 
 
237 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5816  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.29 
 
 
247 aa  80.5  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.395639  normal  0.643607 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1807  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.58 
 
 
248 aa  80.1  0.00000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8176  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  29.19 
 
 
809 aa  79.7  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1245  glycosyl transferase family 2  28.02 
 
 
324 aa  79.3  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000219954  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1850  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.34 
 
 
258 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.492055  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8187  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 
233 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0825  glycosyl transferase family 2  23.93 
 
 
351 aa  79  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531655  normal  0.237079 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0730  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 
364 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.578304  normal  0.224353 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2117  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 
304 aa  79  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.322002  normal  0.308153 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08960  glycosyl transferase  29.91 
 
 
245 aa  78.6  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.206591 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
293 aa  79  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1259  glycosyl transferase family protein  27.59 
 
 
303 aa  79  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0974  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  28.14 
 
 
233 aa  78.2  0.0000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.85219  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  30.3 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1737  glycosyl transferase family protein  24.6 
 
 
312 aa  77.8  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2271  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.22 
 
 
305 aa  78.6  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405527  hitchhiker  0.00229126 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1211  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.24 
 
 
257 aa  77.8  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.13175  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5607  glycosyl transferase family 2  29.45 
 
 
242 aa  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0054  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  26.4 
 
 
528 aa  77  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00397279  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5883  glycosyl transferase family protein  28.05 
 
 
314 aa  77  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.692507 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0483  hypothetical protein  26.54 
 
 
247 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3402  glycosyl transferase family 2  31.71 
 
 
263 aa  77  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.181539  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  31 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0422  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  31.79 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.264242 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  32.67 
 
 
230 aa  76.6  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  24.38 
 
 
401 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1109  glycosyltransferase  26.03 
 
 
531 aa  75.1  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.405384  normal  0.415248 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3067  glycosyl transferase family protein  27.1 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.936306  normal  0.593332 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2200  Dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  30.77 
 
 
252 aa  75.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.562364  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>