More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1173 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1173  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
319 aa  655    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000473476  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2635  glycosyl transferase family protein  59.42 
 
 
340 aa  395  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0539  glycosyl transferase family 2  58.15 
 
 
357 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.150486  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1303  glycosyl transferase, group 2 family protein  59.22 
 
 
353 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3075  glycosyl transferase, group 2 family protein  59.22 
 
 
353 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.34037  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2260  bactoprenol glucosyl transferase  58.9 
 
 
353 aa  388  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0656  glycosyl transferase family protein  60.59 
 
 
338 aa  388  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.453348 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2949  glycosyl transferase, group 2 family protein  59.22 
 
 
353 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0600  glycosyl transferase family 2  61.24 
 
 
337 aa  383  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.755696 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3938  ribonuclease III  58.36 
 
 
358 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.243257 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3431  glycosyl transferase family protein  58.03 
 
 
358 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411933  normal  0.446131 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2047  glycosyl transferase family protein  58.5 
 
 
359 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0225457  normal  0.0522256 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4342  glycosyl transferase family protein  57.38 
 
 
365 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.106417  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3500  ribonuclease III  57.38 
 
 
365 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102768 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4024  glycosyl transferase family protein  57.38 
 
 
365 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0272264  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1685  glycosyl transferase family protein  55.84 
 
 
360 aa  373  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.543739 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1379  glycosyl transferase family protein  55.76 
 
 
340 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.603449  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4457  glycosyl transferase family 2  55.81 
 
 
335 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5988  ribonuclease III  58.5 
 
 
347 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6284  glycosyl transferase family protein  58.5 
 
 
347 aa  362  4e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0178243  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7210  glycosyl transferase family protein  57.05 
 
 
348 aa  361  1e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.738535  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2219  glycosyl transferase family 2  54.22 
 
 
327 aa  360  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.660827  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6381  glycosyl transferase family protein  57.19 
 
 
347 aa  358  6e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.35625  normal  0.721648 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5508  glycosyl transferase family protein  57.19 
 
 
347 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.465095  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5872  glycosyl transferase family protein  57.19 
 
 
347 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.146169  normal  0.2471 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2174  glycosyl transferase family 2  52.7 
 
 
350 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4500  glycosyl transferase family 2  54.43 
 
 
330 aa  352  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.12555  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4438  glycosyl transferase family 2  54.1 
 
 
330 aa  352  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0655  bactoprenol glucosyl transferase  53.31 
 
 
310 aa  340  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0603  bactoprenol glucosyl transferase  52.98 
 
 
308 aa  340  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607961  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0415  bactoprenol glucosyl transferase  52.98 
 
 
310 aa  340  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.81511  hitchhiker  0.00033312 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0724  glycosyl transferase family protein  51.32 
 
 
347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.54019  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0724  bactoprenol glucosyl transferase  52.81 
 
 
306 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.459902 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2876  glycosyl transferase family protein  51.29 
 
 
334 aa  336  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0668  bactoprenol glucosyl transferase  52.81 
 
 
308 aa  336  2.9999999999999997e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0659  bactoprenol glucosyl transferase  53.14 
 
 
308 aa  335  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1246  glycosyl transferase family protein  51.1 
 
 
342 aa  333  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000114042  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0608  glycosyl transferase  52.16 
 
 
306 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.163631 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1307  Ribonuclease III  52.16 
 
 
306 aa  331  9e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00145921  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1452  glycosyl transferase family 2  51.28 
 
 
334 aa  328  6e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.411296  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1776  glycosyl transferase  52.33 
 
 
320 aa  326  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0125  glycosyl transferase family 2  51 
 
 
319 aa  323  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.403715  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0863  ribonuclease III  53.33 
 
 
312 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1923  glycosyl transferase family 2  49.83 
 
 
383 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5901  glycosyl transferase family 2  51.3 
 
 
339 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.389873  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4458  bactoprenol glucosyl transferase  52.32 
 
 
309 aa  312  3.9999999999999997e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4542  bactoprenol glucosyl transferase  51.99 
 
 
309 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.497355  normal  0.196237 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0373  glycosyl transferase family 2  49.5 
 
 
332 aa  310  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.249101 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5303  glycosyl transferase family protein  51.3 
 
 
339 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00285782 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4543  bactoprenol glucosyl transferase  51.66 
 
 
309 aa  309  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0135  glycosyl transferases-like  46.2 
 
 
319 aa  307  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0498044  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02791  hypothetical protein  46.23 
 
 
346 aa  300  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1650  glycosyl transferase family protein  48.17 
 
 
331 aa  299  3e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.402224  normal  0.30355 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0288  glycosyl transferase family protein  51.66 
 
 
335 aa  298  7e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01670  SfII prophage-derived bactoprenol glucosyl transferase  48.69 
 
 
348 aa  298  1e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0722504  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0642  putative glycosyl transferase  51.48 
 
 
304 aa  296  4e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6128  glycosyltransferase  48.83 
 
 
367 aa  296  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.286179  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0341  glycosyl transferase family protein  46.41 
 
 
307 aa  295  7e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.951437  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2543  hypothetical protein  46.84 
 
 
319 aa  293  3e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2398  hypothetical protein  45.89 
 
 
319 aa  291  1e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0713  glycosyl transferase  47.84 
 
 
343 aa  291  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0273832 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5968  glycosyltransferase  49.67 
 
 
373 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0337928  hitchhiker  0.00941907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1751  glycosyl transferase family 2  49.67 
 
 
373 aa  291  1e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.357367 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0132  glycosyl transferase family protein  48.17 
 
 
383 aa  283  3.0000000000000004e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0409142  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4133  glycosyl transferase family 2  43.23 
 
 
310 aa  282  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000533827 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3057  glycosyl transferase family 2  46 
 
 
339 aa  283  4.0000000000000003e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.187191  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0394  glycosyl transferase family 2  47.42 
 
 
311 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0385  glycosyl transferase family 2  47.42 
 
 
311 aa  282  5.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0149  glycosyl transferase  48.17 
 
 
337 aa  281  1e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.70371  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0561  glycosyl transferase family protein  47.12 
 
 
334 aa  281  1e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3629  glycosyl transferase family protein  45.48 
 
 
345 aa  279  4e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0599  glycosyl transferase family protein  46.41 
 
 
343 aa  279  4e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4251  glycosyl transferase family protein  46.84 
 
 
339 aa  278  7e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0532513  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1513  ribonuclease III  44.48 
 
 
330 aa  276  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.01126 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3414  ribonuclease III  44.16 
 
 
330 aa  275  7e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00714089  normal  0.108943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2662  glycosyl transferase family protein  45.9 
 
 
341 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.562323  normal  0.531483 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2359  glycosyl transferase family protein  44.88 
 
 
319 aa  274  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00260932 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1307  glycosyl transferase family 2  42.58 
 
 
321 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.235499  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3592  glycosyl transferase family 2  44.01 
 
 
341 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000663913 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2681  b-glycosyltransferase, glycosyltransferase family 2 protein  42.05 
 
 
312 aa  271  7e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1863  glycosyl transferase, group 2 family protein  45.21 
 
 
332 aa  271  8.000000000000001e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0609042  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3637  glycosyl transferase family 2  45.91 
 
 
336 aa  271  1e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5287  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.05 
 
 
323 aa  269  4e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5112  glycosyltransferase, group 2 family protein  42.05 
 
 
323 aa  269  4e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5684  group 2 family glycosyl transferase  42.05 
 
 
323 aa  269  4e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5528  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.05 
 
 
323 aa  269  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5129  glycosyltransferase, group 2 family protein  41.72 
 
 
323 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25741  glycosyl transferase family protein  43.59 
 
 
324 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1943  glycosyl transferase family 2  43.46 
 
 
322 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0950226  normal  0.190394 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3094  glycosyl transferase family protein  40.33 
 
 
324 aa  261  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000830791  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4447  glycosyl transferase family protein  43.27 
 
 
364 aa  260  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145063  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1485  polyprenyl-phosphate beta-D-glucosyltransferase  40.19 
 
 
324 aa  259  4e-68  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.376864  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0162  putative glycosyl transferase family protein  43.56 
 
 
316 aa  258  1e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0638149 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0692  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.87 
 
 
324 aa  258  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.58802  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3950  glycosyl transferase family protein  42.38 
 
 
312 aa  257  2e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0800  glycosyl transferase family protein  43.23 
 
 
366 aa  257  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.985817 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2346  glycosyl transferase family protein  41.61 
 
 
327 aa  256  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63710  putative glycosyl transferase  44.77 
 
 
324 aa  256  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.151497  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0192  putative glycosyl transferase family protein  44.93 
 
 
310 aa  255  7e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5538  putative glycosyl transferase  42.9 
 
 
324 aa  254  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.200424  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>