More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1167 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1167  type II and III secretion system protein  100 
 
 		 455 aa  916    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0398766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1493  type II and III secretion system protein  42.67 
 
 		 482 aa  339  7e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2360  type II/III secretion system protein  46.06 
 
 		 482 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2741  type II and III secretion system protein  40.41 
 
 		 493 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1112  type II and III secretion system protein  39.96 
 
 		 484 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.48513  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2371  flp pilus assembly protein, secretin CpaC  38.89 
 
 		 483 aa  273  3e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.463831  normal  0.668719 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2013  type II and III secretion system protein  41.38 
 
 		 478 aa  268  2e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1519  type II and III secretion system protein  41.33 
 
 		 504 aa  254  3e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2549  type II and III secretion system protein  37.35 
 
 		 514 aa  251  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.124732  normal  0.115348 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002644  type II/IV secretion system secretin RcpA/CpaC associated with Flp pilus assembly  37.76 
 
 		 487 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1747  Flp pilus assembly protein CpaC  38.86 
 
 		 507 aa  249  5e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2360  type II and III secretion system protein  36.05 
 
 		 574 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0591  type II and III secretion system protein  36.88 
 
 		 663 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.341845  normal  0.0532026 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3007  type II and III secretion system protein  35.92 
 
 		 477 aa  236  9e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0647  type II and III secretion system protein  37.06 
 
 		 620 aa  235  1.0000000000000001e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377481  normal  0.471986 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3968  type II and III secretion system protein  33.26 
 
 		 490 aa  233  5e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.198511  normal  0.42418 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2644  type II and III secretion system protein:transport-associated  34.54 
 
 		 633 aa  232  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.2628  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1129  type II and III secretion system protein  35.52 
 
 		 474 aa  231  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0793  type II and III secretion system protein  36.71 
 
 		 571 aa  229  8e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00997149  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1909  Outer membrane general secretion pathway protein, secretin  35.21 
 
 		 461 aa  228  1e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7201  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  35.24 
 
 		 652 aa  229  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.360081  normal  0.571499 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1312  phospholipid-binding domain-containing protein  35.93 
 
 		 690 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2268  type II and III secretion system protein  35.36 
 
 		 679 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144495  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2960  type II/III secretion system protein  35.93 
 
 		 690 aa  226  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0557  type II and III secretion system protein  34.98 
 
 		 461 aa  226  7e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0305  type II and III secretion system protein  34.27 
 
 		 461 aa  226  8e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6784  type II and III secretion system protein  35.08 
 
 		 642 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0225639  normal  0.0762258 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5498  type II and III secretion system protein  35.08 
 
 		 642 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0729153  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6372  type II and III secretion system protein  35.08 
 
 		 646 aa  226  8e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.118292  normal  0.881452 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5321  type II and III secretion system protein  35.15 
 
 		 700 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293093  hitchhiker  0.00147308 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5996  type II and III secretion system protein  35.32 
 
 		 656 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3085  type II/III secretion system protein  35.6 
 
 		 690 aa  225  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2057  type II and III secretion system protein  37.9 
 
 		 460 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.127382  normal  0.0564414 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6292  type II and III secretion system protein  35 
 
 		 657 aa  223  4e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.260655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1516  type II and III secretion system protein  34.97 
 
 		 517 aa  223  4.9999999999999996e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3421  type II and III secretion system protein  37.9 
 
 		 460 aa  223  6e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.195466  normal  0.703201 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3928  type II and III secretion system protein  37.75 
 
 		 460 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.13282  normal  0.228642 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4614  type II and III secretion system protein  34.68 
 
 		 595 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.228192 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2915  type II and III secretion system protein  35.9 
 
 		 484 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2827  type II and III secretion system protein  35.9 
 
 		 487 aa  221  1.9999999999999999e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.863407  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0997  type II and III secretion system protein  35.12 
 
 		 466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0263659  normal  0.897862 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2346  type II and III secretion system protein  35.14 
 
 		 497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.397877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5132  type II and III secretion system protein  35.86 
 
 		 466 aa  219  8.999999999999998e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.179001 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0233  type II and III secretion system protein  35.05 
 
 		 491 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2459  type II/III secretion system protein  35.92 
 
 		 492 aa  217  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.478191  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1873  type II/III secretion system protein  35.92 
 
 		 482 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2040  RhcC2  35.92 
 
 		 482 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.199191  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1885  type II/III secretion system protein  35.92 
 
 		 482 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181819  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0336  type II secretion system protein  35.92 
 
 		 482 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0825  RhcC2  35.92 
 
 		 482 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.667822  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1680  type II/III secretion system protein  35.92 
 
 		 482 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.427555  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2542  type II/III secretion system protein  37.4 
 
 		 441 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1642  type II and III secretion system protein  34.95 
 
 		 453 aa  212  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00375821  normal  0.501633 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0548  type II and III secretion system protein  34.63 
 
 		 603 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1048  type II/III secretion system protein  37.6 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.827787  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1290  type II/III secretion system protein  37.6 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1789  type II/III secretion system protein  37.6 
 
 		 432 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1941  type II/III secretion system protein  37.6 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0187984  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1768  type II/III secretion system protein  37.6 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.477043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1778  type II/III secretion system protein  37.6 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0117  type II/III secretion system protein  37.6 
 
 		 441 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.821295  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1519  putative pilus assembly protein cpaC  32.93 
 
 		 496 aa  211  3e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.527914  normal  0.565497 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3654  pilus assembly protein  34.9 
 
 		 473 aa  210  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1732  type II and III secretion system protein  34.18 
 
 		 443 aa  209  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793195  hitchhiker  0.00000430206 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0391  type II and III secretion system protein  32.96 
 
 		 486 aa  207  3e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796113  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7031  putative pilus assembly protein cpaC  32.88 
 
 		 497 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.157408  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5409  type II and III secretion system protein  34.42 
 
 		 469 aa  206  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.28985  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0070  type II and III secretion system protein  32.75 
 
 		 461 aa  206  6e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.838423 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4445  type II and III secretion system protein  34.47 
 
 		 457 aa  206  7e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0655  outer membrane channel protein  34.1 
 
 		 634 aa  206  1e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.885837  normal  0.521037 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1658  type II and III secretion system protein  34.77 
 
 		 483 aa  204  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1443  type II and III secretion system protein  33.16 
 
 		 461 aa  203  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549017 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2703  type II and III secretion system protein  31.4 
 
 		 499 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.523249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1784  type II and III secretion system protein  30.15 
 
 		 479 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0597646  normal  0.339139 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2798  putative outer membrane channel signal peptide protein, CpaC like  36.36 
 
 		 454 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.395631 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2384  type II and III secretion system protein  31.38 
 
 		 501 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0712341  normal  0.0685536 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4661  Flp pilus assembly protein secretin CpaC  35.8 
 
 		 443 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000794738  hitchhiker  0.00340482 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4868  type II and III secretion system protein  35.47 
 
 		 526 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0614  type II and III secretion system protein  34.93 
 
 		 464 aa  201  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3520  type II and III secretion system protein  30.35 
 
 		 480 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.637726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1403  type II and III secretion system protein  34.53 
 
 		 444 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2072  type II and III secretion system protein  32.94 
 
 		 492 aa  199  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00565214  normal  0.624153 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1653  type II and III secretion system protein  35.86 
 
 		 468 aa  199  7e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.745375 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1497  type II and III secretion system protein  34.57 
 
 		 443 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0318341  hitchhiker  0.0000037114 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1521  type II and III secretion system protein  34.57 
 
 		 443 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00384422  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1041  type II and III secretion system protein  34.57 
 
 		 443 aa  199  9e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00604679  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4200  type II and III secretion system protein  30.44 
 
 		 480 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.599667  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2827  type II and III secretion system protein  32.02 
 
 		 494 aa  197  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.59291  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1079  type II and III secretion system protein  33.42 
 
 		 539 aa  197  4.0000000000000005e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103165  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0301  type II and III secretion system protein  30.86 
 
 		 493 aa  196  6e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3487  type II and III secretion system protein  34.76 
 
 		 473 aa  193  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0401415 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4871  putative type II secretion system protein  43.41 
 
 		 408 aa  193  7e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0665602  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5683  putative pilus assembly protein cpaC  31.15 
 
 		 489 aa  192  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.182381 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0659  type II secretion system protein  30.02 
 
 		 461 aa  192  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.876667  normal  0.112113 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2042  type II and III secretion system protein  32.91 
 
 		 474 aa  191  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.160512  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1129  type II and III secretion system protein  35.86 
 
 		 493 aa  191  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0311226  normal  0.350222 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0419  type II and III secretion system protein  31.11 
 
 		 491 aa  190  4e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2162  type II and III secretion system protein  35.37 
 
 		 428 aa  190  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.080237 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2480  type II and III secretion system protein  29.16 
 
 		 502 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.906186 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2408  type II and III secretion system protein  28.73 
 
 		 502 aa  189  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>