90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1154 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1154  AAA ATPase  100 
 
 		 480 aa  998    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2006  AAA+ class ATPase  53.13 
 
 		 468 aa  550  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000216786  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2692  AAA ATPase  53.23 
 
 		 469 aa  539  9.999999999999999e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2350  ATPase  41.98 
 
 		 478 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.368284  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1748  AAA ATPase  46.51 
 
 		 432 aa  401  9.999999999999999e-111  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386005  normal  0.990458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2121  AAA ATPase  46.99 
 
 		 432 aa  395  1e-109  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2506  AAA ATPase  43.39 
 
 		 453 aa  388  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.016721  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3240  ATPase central domain-containing protein  43.16 
 
 		 459 aa  384  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1877  ATPase central domain-containing protein  43.62 
 
 		 458 aa  381  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2981  AAA ATPase central domain protein  43.98 
 
 		 456 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.169475  hitchhiker  0.00563801 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2547  ATPase  43.57 
 
 		 441 aa  357  2.9999999999999997e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0262176  normal  0.057986 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1859  AAA ATPase  41.28 
 
 		 519 aa  348  9e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4235  AAA ATPase  38.16 
 
 		 536 aa  340  2.9999999999999998e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2642  ATPase  41.39 
 
 		 472 aa  333  3e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1899  ATPase  40.71 
 
 		 436 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.525661  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0548  ATPase  40.71 
 
 		 436 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3352  AAA ATPase  40.09 
 
 		 578 aa  328  1.0000000000000001e-88  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.166606  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0791  ATPase  38.76 
 
 		 452 aa  323  4e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422248  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0649  ATPase  42.19 
 
 		 470 aa  322  7e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.959728  normal  0.181264 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2355  hypothetical protein  38.42 
 
 		 435 aa  318  2e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.896698  normal  0.762473 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0296  ATPase with chaperone activity-like protein  39.76 
 
 		 436 aa  318  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4393  hypothetical protein  39.18 
 
 		 434 aa  317  3e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2674  AAA ATPase  38.69 
 
 		 538 aa  315  9e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.545684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1120  hypothetical protein  39.95 
 
 		 435 aa  313  3.9999999999999997e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.520177 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2742  AAA ATPase  37.96 
 
 		 538 aa  312  6.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1575  AAA ATPase  37.47 
 
 		 538 aa  311  1e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0988  hypothetical protein  37.44 
 
 		 441 aa  309  8e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0101247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2011  AAA ATPase  36.84 
 
 		 440 aa  296  4e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.302676  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0593  ATPase with chaperone activity  36.63 
 
 		 499 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal  0.0676959 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7203  ATPase  37.29 
 
 		 466 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.539522  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5500  ATPase  35.84 
 
 		 466 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.146372  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6786  ATPase  35.84 
 
 		 466 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.162122 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6374  ATPase  35.84 
 
 		 466 aa  276  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.858113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5994  AAA ATPase  35.68 
 
 		 466 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.41679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6290  AAA ATPase  35.68 
 
 		 466 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00474888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1628  ATPase with chaperone activity  37.63 
 
 		 427 aa  272  1e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.606792 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2266  ATPase with chaperone activity, putative  35.59 
 
 		 460 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2373  hypothetical protein  35.49 
 
 		 438 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.548259  normal  0.836855 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3083  hypothetical protein  34.14 
 
 		 460 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2958  hypothetical protein  34.14 
 
 		 460 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.399029  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1310  hypothetical protein  34.14 
 
 		 460 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002642  predicted ATPase with chaperone activity associated with Flp pilus assembly  33.02 
 
 		 437 aa  230  5e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  50 
 
 		 566 aa  63.2  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2279  general secretion pathway protein E  38.38 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000949561  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1037  general secretion pathway protein E  33.33 
 
 		 385 aa  57.8  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  45.76 
 
 		 571 aa  56.2  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.44 
 
 		 568 aa  55.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  46.03 
 
 		 568 aa  53.5  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4012  General secretory system II protein E domain protein  28.16 
 
 		 345 aa  53.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  3.66345e-31 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3928  General secretory system II protein E domain protein  45.76 
 
 		 345 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00083498  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.74 
 
 		 568 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.74 
 
 		 568 aa  52.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2157  fibronectin, type III domain-containing protein  37.5 
 
 		 1141 aa  52  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.445714  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0314  general secretion pathway protein E  38.24 
 
 		 367 aa  51.2  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  43.86 
 
 		 589 aa  51.2  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0162  General secretory system II protein E domain protein  38.24 
 
 		 387 aa  50.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.049981 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2823  MSHA biogenesis protein MshE  31.19 
 
 		 575 aa  49.3  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  31.37 
 
 		 558 aa  49.7  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  37.5 
 
 		 561 aa  49.3  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  40.74 
 
 		 561 aa  49.3  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002371  MSHA biogenesis protein MshE  38.03 
 
 		 574 aa  49.3  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.46391  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.44 
 
 		 568 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0180  General secretory system II protein E domain protein  36.76 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  37.1 
 
 		 594 aa  48.5  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0111  general secretory system II, protein E-like  40.32 
 
 		 370 aa  48.5  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00145913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  31.78 
 
 		 561 aa  48.5  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  39.68 
 
 		 568 aa  48.5  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.68 
 
 		 568 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  40.68 
 
 		 568 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.68 
 
 		 568 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.55 
 
 		 568 aa  48.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  37.97 
 
 		 577 aa  48.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  30.84 
 
 		 637 aa  47.4  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.68 
 
 		 568 aa  47  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1307  Allergen V5/Tpx-1 family protein  49.02 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000813036  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  38.6 
 
 		 582 aa  46.2  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  43.64 
 
 		 568 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  30.49 
 
 		 570 aa  45.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  44.23 
 
 		 553 aa  45.1  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03695  hypothetical protein  35.21 
 
 		 574 aa  45.1  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.43 
 
 		 571 aa  45.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  35.09 
 
 		 574 aa  44.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  38.18 
 
 		 553 aa  44.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  40.35 
 
 		 570 aa  44.7  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  36.84 
 
 		 587 aa  44.3  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  43.86 
 
 		 559 aa  44.3  0.005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3079  Mg chelatase, subunit ChlI  32.53 
 
 		 509 aa  43.9  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  38.6 
 
 		 585 aa  43.9  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  42.11 
 
 		 891 aa  43.1  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  40.35 
 
 		 586 aa  43.1  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>