More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1144 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1144  aspartate aminotransferase  100 
 
 		 381 aa  788    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.859107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1584  aspartate aminotransferase  60.11 
 
 		 379 aa  481  1e-134  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.697592  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0443  aspartate aminotransferase  57.89 
 
 		 384 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0958  aspartate aminotransferase  59.84 
 
 		 381 aa  467  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2192  aspartate aminotransferase  55.76 
 
 		 385 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4053  aspartate aminotransferase  55.05 
 
 		 383 aa  438  9.999999999999999e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1546  aspartate aminotransferase  55.17 
 
 		 398 aa  422  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.623747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0680  aspartate aminotransferase  54.08 
 
 		 387 aa  398  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3276  aminotransferase  44.91 
 
 		 394 aa  319  3.9999999999999996e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0836  hypothetical protein  45.05 
 
 		 390 aa  311  1e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00149421 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0881  hypothetical protein  44.41 
 
 		 385 aa  303  4.0000000000000003e-81  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2043  hypothetical protein  44.85 
 
 		 388 aa  297  2e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0970  aminotransferase, classes I and II  44.27 
 
 		 390 aa  294  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103563  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4803  hypothetical protein  43.93 
 
 		 390 aa  294  2e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0396768  hitchhiker  0.00689521 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0664  hypothetical protein  41.13 
 
 		 386 aa  288  2e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5438  hypothetical protein  44.41 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1626  aminotransferase, class I and II  43.58 
 
 		 383 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1089  hypothetical protein  46.31 
 
 		 400 aa  282  5.000000000000001e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.806795  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1859  aminotransferase, class I and II  44.65 
 
 		 383 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1818  aminotransferase, class I and II  42.4 
 
 		 378 aa  278  8e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.11769 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62480  hypothetical protein  44.77 
 
 		 390 aa  279  8e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2980  aminotransferase  43.58 
 
 		 383 aa  276  3e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.289509  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0742  hypothetical protein  45.05 
 
 		 390 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107858  hitchhiker  0.00000000116369 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3584  hypothetical protein  42.97 
 
 		 393 aa  277  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.510103 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2938  aminotransferase  40.26 
 
 		 396 aa  274  2.0000000000000002e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2229  aminotransferase  41.3 
 
 		 394 aa  273  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.346154  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0768  aminotransferase  42.41 
 
 		 389 aa  272  9e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00291764  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2053  aminotransferase, class I/class II  42.22 
 
 		 400 aa  271  1e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4060  aminotransferase A  41.46 
 
 		 387 aa  270  4e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2805  aminotransferase class I and II  40.46 
 
 		 393 aa  270  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42630  hypothetical protein  42.82 
 
 		 391 aa  270  4e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.385949  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4010  aminotransferase class I and II  38.64 
 
 		 388 aa  269  5e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0894361  normal  0.978493 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0739  aminotransferase class I and II  40.37 
 
 		 400 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.207853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2696  aminotransferase  40.78 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.192367  normal  0.916147 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2674  aminotransferase  43.05 
 
 		 393 aa  267  2e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2719  aminotransferase  40.1 
 
 		 392 aa  268  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3750  aminotransferase A  41.46 
 
 		 387 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04129  hypothetical protein  42.37 
 
 		 394 aa  266  2.9999999999999995e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2717  aminotransferase  37.9 
 
 		 387 aa  266  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00629468 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3837  aminotransferase A  40.9 
 
 		 387 aa  266  4e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.995763  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2888  aminotransferase  40.3 
 
 		 398 aa  266  4e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.790701  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4133  aminotransferase A  41.18 
 
 		 385 aa  266  4e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.562408  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3480  hypothetical protein  42.3 
 
 		 394 aa  266  5e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.470485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4690  hypothetical protein  44.62 
 
 		 390 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000279841 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3728  aminotransferase class I and II  40.49 
 
 		 387 aa  265  8e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00181067 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3766  aminotransferase A  41.18 
 
 		 387 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4027  aminotransferase A  41.18 
 
 		 387 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4556  hypothetical protein  44.44 
 
 		 390 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331626  hitchhiker  0.00000115439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2582  aminotransferase class I and II  39.95 
 
 		 393 aa  265  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0401  aminotransferase class I and II  40.53 
 
 		 395 aa  265  1e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0552062  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4692  hypothetical protein  44.44 
 
 		 390 aa  263  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1124  aminotransferase A  40.62 
 
 		 387 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2710  aminotransferase A  40.34 
 
 		 387 aa  262  6.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0183593  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3918  aminotransferase A  40.9 
 
 		 387 aa  262  8e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4225  aminotransferase A  40.9 
 
 		 387 aa  262  8e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4115  aminotransferase A  40.9 
 
 		 387 aa  262  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0616  aminotransferase  40.87 
 
 		 397 aa  261  1e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.736327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3104  aminotransferase  41.54 
 
 		 398 aa  261  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0767  aminotransferase  40.16 
 
 		 393 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  37.53 
 
 		 375 aa  260  2e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1677  aminotransferase class I and II  40.7 
 
 		 392 aa  260  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.206654  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1153  aminotransferase  38.46 
 
 		 398 aa  260  3e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2920  aminotransferase  40.2 
 
 		 398 aa  260  3e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.493105  normal  0.42279 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0710  aminotransferase  40.77 
 
 		 394 aa  259  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  34.28 
 
 		 395 aa  259  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2671  aminotransferase  38.4 
 
 		 397 aa  259  4e-68  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0890  aminotransferase  41.22 
 
 		 398 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0865  aminotransferase  38.52 
 
 		 381 aa  259  6e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.424405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2183  aminotransferase, class I and II  37.43 
 
 		 395 aa  259  7e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.328944  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1189  aminotransferase class I and II  36.24 
 
 		 376 aa  259  7e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00616768  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3951  aminotransferase class I and II  38.93 
 
 		 387 aa  259  8e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.13883  normal  0.350416 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2465  aminotransferase  38.6 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0299601  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2259  aminotransferase  38.86 
 
 		 394 aa  258  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1168  aminotransferase class I and II  41.01 
 
 		 391 aa  257  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.010344  normal  0.842384 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0659  aminotransferase  41.15 
 
 		 394 aa  257  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.165576 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3658  aminotransferase class I and II  38.67 
 
 		 387 aa  257  2e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.76219  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0388  aminotransferase class I and II  36.2 
 
 		 392 aa  257  2e-67  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2769  aminotransferase  39.9 
 
 		 394 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.593168 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1528  aminotransferase  41.15 
 
 		 397 aa  256  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.545419  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0236  aminotransferase, class I and II  38.38 
 
 		 388 aa  256  3e-67  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4903  aminotransferase class I and II  39.57 
 
 		 392 aa  256  5e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.234248  hitchhiker  0.00232672 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0815  aminotransferase  41.71 
 
 		 398 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1124  aspartate aminotransferase  38.19 
 
 		 398 aa  255  8e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1955  aminotransferase  39.08 
 
 		 392 aa  255  9e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0276062 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2537  aminotransferase  39.01 
 
 		 381 aa  255  9e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.7413  normal  0.0409069 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0703  aminotransferase  40.73 
 
 		 394 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0931  aminotransferase A  38.7 
 
 		 382 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  37.7 
 
 		 390 aa  254  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5428  aminotransferase class I and II  39.47 
 
 		 387 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.89261 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0824  aminotransferase  41.67 
 
 		 398 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4055  aminotransferase  41.67 
 
 		 414 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2443  aminotransferase  41.15 
 
 		 398 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.693278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1903  aminotransferase, class I and II  36.84 
 
 		 396 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1342  aspartate aminotransferase  37.64 
 
 		 398 aa  252  6e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3474  aminotransferase class I and II  40.78 
 
 		 393 aa  252  7e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.151006 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0185  aminotransferase, class I and II  37.64 
 
 		 388 aa  252  9.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000603276  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1414  aminotransferase class I and II  36.64 
 
 		 407 aa  251  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.445663  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3240  aminotransferase, class I and II  39.23 
 
 		 388 aa  251  1e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64695  normal  0.434806 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0475  aminotransferase  41.41 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0954  aminotransferase  41.41 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>