More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1124 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  100 
 
 		 156 aa  318  9.999999999999999e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  60.69 
 
 		 174 aa  206  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  57.54 
 
 		 180 aa  197  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  58.29 
 
 		 176 aa  196  7e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  57.06 
 
 		 160 aa  186  8e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  55.15 
 
 		 166 aa  186  2e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  70 
 
 		 180 aa  154  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  57.93 
 
 		 236 aa  154  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  57.93 
 
 		 234 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  57.93 
 
 		 234 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  57.93 
 
 		 234 aa  153  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  57.93 
 
 		 236 aa  153  1e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  50 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  50 
 
 		 159 aa  152  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  60 
 
 		 231 aa  150  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  57.04 
 
 		 238 aa  149  1e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  63.96 
 
 		 236 aa  149  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  47.2 
 
 		 172 aa  148  4e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  63.96 
 
 		 235 aa  147  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  63.96 
 
 		 236 aa  147  7e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  46.58 
 
 		 161 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  63.25 
 
 		 222 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  63.64 
 
 		 242 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  63.06 
 
 		 234 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0438  single-strand binding protein  48.1 
 
 		 157 aa  144  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.367584 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  64.42 
 
 		 200 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  53.16 
 
 		 154 aa  144  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2466  single-strand binding protein  47.85 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  64.81 
 
 		 220 aa  142  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0140  single-strand binding protein  48.72 
 
 		 164 aa  142  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  64.42 
 
 		 196 aa  142  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1129  single-stranded DNA-binding protein  51.88 
 
 		 154 aa  143  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0688352  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  52.23 
 
 		 149 aa  142  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2845  single-strand binding protein  47.85 
 
 		 156 aa  143  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.101348  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  62.04 
 
 		 160 aa  142  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  64.81 
 
 		 225 aa  142  2e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  48.45 
 
 		 158 aa  141  3e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  64.81 
 
 		 231 aa  141  3e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  62.04 
 
 		 175 aa  141  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1569  single-strand binding protein  48.72 
 
 		 164 aa  141  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.285989  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  56.72 
 
 		 188 aa  140  5e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  59.26 
 
 		 186 aa  140  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  57.5 
 
 		 165 aa  140  9e-33  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  46.15 
 
 		 161 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  47.59 
 
 		 158 aa  139  9.999999999999999e-33  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0748  single-strand binding protein  57.5 
 
 		 174 aa  139  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.810085  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  59.06 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  53.04 
 
 		 222 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  46.5 
 
 		 157 aa  137  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1280  single-strand binding protein  47.44 
 
 		 164 aa  137  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522699 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  46.79 
 
 		 151 aa  137  4.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0868  single-stranded DNA-binding protein  57.25 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.949427  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1903  single-strand binding protein  47.74 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1676  single-strand binding protein  48.12 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09200  single-stranded DNA-binding protein  57.25 
 
 		 165 aa  136  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0140345  normal  0.797582 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  47.59 
 
 		 171 aa  135  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  59.43 
 
 		 163 aa  135  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  63.92 
 
 		 180 aa  135  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  59.43 
 
 		 167 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1884  single-strand binding protein  49.39 
 
 		 164 aa  134  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0898564  normal  0.541017 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1745  single-strand binding protein  62.38 
 
 		 185 aa  134  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0536308  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  62.89 
 
 		 182 aa  134  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  62.89 
 
 		 182 aa  134  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  63.92 
 
 		 178 aa  134  6.0000000000000005e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  62.89 
 
 		 182 aa  134  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  45.09 
 
 		 178 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  45.09 
 
 		 178 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  45.09 
 
 		 178 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2038  single-strand binding protein  54.47 
 
 		 161 aa  133  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.663692  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  45.09 
 
 		 178 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  45.09 
 
 		 178 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  45.09 
 
 		 178 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  45.09 
 
 		 178 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  45.09 
 
 		 178 aa  133  7.000000000000001e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  44.77 
 
 		 177 aa  133  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  48.21 
 
 		 166 aa  132  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0930  single-strand binding protein  61.39 
 
 		 233 aa  132  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  47.31 
 
 		 168 aa  132  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0451  single-strand binding protein  47.93 
 
 		 162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0123838 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0108  single-strand DNA-binding protein  46.39 
 
 		 175 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.127981 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  57.8 
 
 		 155 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06540  single-stranded DNA-binding protein  46.89 
 
 		 167 aa  132  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0610132  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  48.19 
 
 		 163 aa  131  3e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  61.86 
 
 		 178 aa  131  3e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  53.77 
 
 		 147 aa  130  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  58.49 
 
 		 230 aa  130  5e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  60.82 
 
 		 180 aa  130  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  60.75 
 
 		 172 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  56.25 
 
 		 182 aa  130  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  46.39 
 
 		 181 aa  129  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  43.53 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  55.66 
 
 		 184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  52.83 
 
 		 146 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1062  single-stranded DNA-binding protein family  55.56 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.407571  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1606  single stranded DNA-binding protein  45.51 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.597102  normal  0.594419 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  40.85 
 
 		 152 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4185  single-strand binding protein  45.88 
 
 		 170 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0620  single-stranded DNA-binding protein  46.63 
 
 		 182 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.210142  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  59.79 
 
 		 176 aa  128  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1102  single-stranded DNA-binding protein family  55.56 
 
 		 168 aa  128  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.853815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>