More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1118 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1320  Isoleucyl-tRNA synthetase  47.39 
 
 
926 aa  933  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4559  isoleucyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 
943 aa  824  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.349463  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0024  isoleucyl-tRNA synthetase  46.12 
 
 
938 aa  861  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0199251  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1468  isoleucyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 
920 aa  915  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3629  isoleucyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
938 aa  858  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.124102  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3588  isoleucyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
938 aa  815  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1408  isoleucyl-tRNA synthetase  48.35 
 
 
930 aa  907  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0026312  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4057  isoleucyl-tRNA synthetase  41.1 
 
 
969 aa  672  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446405  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0649  isoleucyl-tRNA synthetase  45.41 
 
 
943 aa  826  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.159001 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1886  isoleucyl-tRNA synthetase  47.87 
 
 
932 aa  908  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0954369  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3722  isoleucyl-tRNA synthetase  46.1 
 
 
921 aa  889  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.119148  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2325  isoleucyl-tRNA synthetase  40.87 
 
 
991 aa  694  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.48374  normal  0.697637 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0790  isoleucyl-tRNA synthetase  44.74 
 
 
938 aa  815  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102283  normal  0.791214 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0508  isoleucyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
936 aa  866  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0783  isoleucyl-tRNA synthetase  42.41 
 
 
945 aa  770  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.510866  hitchhiker  0.000115828 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1626  isoleucyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 
919 aa  925  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.235357  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5384  isoleucyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 
951 aa  734  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.515225 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1798  isoleucyl-tRNA synthetase  40.55 
 
 
988 aa  680  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.107946 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1291  isoleucyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 
940 aa  848  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00326353  normal  0.133319 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05535  isoleucyl-tRNA synthetase  41.86 
 
 
926 aa  739  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0158577  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2726  isoleucyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 
959 aa  761  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3159  isoleucyl-tRNA synthetase  42.6 
 
 
945 aa  766  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.500412  normal  0.0175338 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0030  isoleucyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
938 aa  858  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000755713  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0189  isoleucyl-tRNA synthetase  41.75 
 
 
909 aa  737  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.480596  normal  0.804628 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1144  isoleucyl-tRNA synthetase  44.17 
 
 
942 aa  808  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.946837  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0574  isoleucyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 
945 aa  765  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0184538 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1006  isoleucyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 
1001 aa  687  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1521  isoleucyl-tRNA synthetase  42.9 
 
 
943 aa  776  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0718917  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2693  isoleucyl-tRNA synthetase  43.78 
 
 
946 aa  757  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116372  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2430  isoleucyl-tRNA synthetase  42.06 
 
 
945 aa  758  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.751972  hitchhiker  3.14899e-08 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1458  isoleucyl-tRNA synthetase  42 
 
 
953 aa  766  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.551267 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1236  isoleucyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 
998 aa  752  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.994716 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1578  isoleucyl-tRNA synthetase  43.01 
 
 
943 aa  773  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2220  isoleucyl-tRNA synthetase  40.6 
 
 
989 aa  679  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.568466  normal  0.0664047 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2537  isoleucyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 
945 aa  763  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.976839  hitchhiker  1.44474e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1156  isoleucyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 
940 aa  824  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.102476  normal  0.307874 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02611  isoleucyl-tRNA synthetase  43.25 
 
 
969 aa  757  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.771851  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1933  isoleucyl-tRNA synthetase  40.5 
 
 
991 aa  697  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.183113  hitchhiker  5.04744e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1121  isoleucyl-tRNA synthetase  44.61 
 
 
940 aa  823  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.698223  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5200  isoleucyl-tRNA synthetase  45.72 
 
 
943 aa  828  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4230  isoleucyl-tRNA synthetase  43.58 
 
 
940 aa  815  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0354153  hitchhiker  5.63381e-05 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0412  isoleucyl-tRNA synthetase  40.06 
 
 
969 aa  663  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.861569 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1277  isoleucyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 
917 aa  808  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0461  isoleucyl-tRNA synthetase  47.57 
 
 
908 aa  913  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1892  isoleucyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 
946 aa  823  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0598  isoleucyl-tRNA synthetase  41.99 
 
 
960 aa  773  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  5.96981e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0644  isoleucyl-tRNA synthetase  44.98 
 
 
943 aa  822  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.151941 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3784  isoleucyl-tRNA synthetase  41.74 
 
 
953 aa  690  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617125  normal  0.119179 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0181  isoleucyl-tRNA synthetase  40.35 
 
 
972 aa  668  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0782034  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1252  isoleucyl-tRNA synthetase  43.66 
 
 
917 aa  808  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.131241  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1422  isoleucyl-tRNA synthetase  47.92 
 
 
919 aa  914  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1716  isoleucyl-tRNA synthetase  40.81 
 
 
999 aa  705  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.100136  normal  0.21686 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0633  isoleucyl-tRNA synthetase  41.48 
 
 
942 aa  681  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.807163  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4313  isoleucyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 
924 aa  1037  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.375273  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3032  isoleucyl-tRNA synthetase  40.61 
 
 
970 aa  674  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.622037  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2544  isoleucyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 
921 aa  883  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1191  isoleucyl-tRNA synthetase  52.5 
 
 
929 aa  1019  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.723642  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1083  isoleucyl-tRNA synthetase  45.01 
 
 
940 aa  853  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.234482  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0698  isoleucyl-tRNA synthetase  44.27 
 
 
938 aa  808  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.105082  normal  0.0586161 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1194  isoleucyl-tRNA synthetase  45.11 
 
 
940 aa  847  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000135641  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0026  isoleucyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
938 aa  859  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.76203e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0028  isoleucyl-tRNA synthetase  45.91 
 
 
938 aa  857  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00012642  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00980  isoleucyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 
942 aa  832  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1672  isoleucyl-tRNA synthetase  45.54 
 
 
936 aa  868  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.232615  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2207  isoleucyl-tRNA synthetase  40.32 
 
 
1012 aa  657  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.307981 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0287  isoleucyl-tRNA synthetase  42.83 
 
 
965 aa  734  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.547871 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1425  isoleucyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 
913 aa  904  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0977  isoleucyl-tRNA synthetase  41.19 
 
 
919 aa  686  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0906  isoleucyl-tRNA synthetase  39.65 
 
 
921 aa  691  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3460  isoleucyl-tRNA synthetase  44.49 
 
 
938 aa  814  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0011793  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0662  isoleucyl-tRNA synthetase  39.62 
 
 
917 aa  652  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.756036  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0013  isoleucyl-tRNA synthetase  46.93 
 
 
947 aa  890  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0214  isoleucyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 
949 aa  840  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  7.86038e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2280  isoleucyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
993 aa  694  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.601181  normal  0.314996 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5054  isoleucyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 
960 aa  799  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3396  isoleucyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 
959 aa  781  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.375781 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3757  isoleucyl-tRNA synthetase  53.15 
 
 
925 aa  1039  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3653  isoleucyl-tRNA synthetase  44.81 
 
 
937 aa  830  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.914419  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0548  isoleucyl-tRNA synthetase  45.31 
 
 
941 aa  840  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00029  hypothetical protein  45.91 
 
 
938 aa  856  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00165877  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0587  isoleucyl-tRNA synthetase  44.51 
 
 
940 aa  824  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0143363  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2337  isoleucyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
959 aa  761  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0519  isoleucyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 
963 aa  684  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.23114  normal  0.394026 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1039  isoleucyl-tRNA synthetase  47.28 
 
 
923 aa  910  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0185965  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1268  isoleucyl-tRNA synthetase  42 
 
 
949 aa  728  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0676836  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11780  isoleucyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
943 aa  801  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.125013  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1161  isoleucyl-tRNA synthetase  39.75 
 
 
921 aa  648  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1349  isoleucyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 
920 aa  890  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2735  isoleucyl-tRNA synthetase  42.38 
 
 
951 aa  743  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.338283  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5819  isoleucyl-tRNA synthetase  40.14 
 
 
987 aa  664  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3216  isoleucyl-tRNA synthetase  47.19 
 
 
937 aa  881  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10880  isoleucyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 
952 aa  824  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.400648  unclonable  6.89376e-09 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06340  isoleucyl-tRNA synthetase  46.72 
 
 
948 aa  874  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.951905  normal  0.158712 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1889  isoleucyl-tRNA synthetase  43.55 
 
 
923 aa  809  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2556  isoleucyl-tRNA synthetase  46.55 
 
 
948 aa  827  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00989063 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0985  isoleucyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 
927 aa  900  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3938  isoleucyl-tRNA synthetase  45.26 
 
 
926 aa  832  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1094  isoleucyl-tRNA synthetase  44.3 
 
 
928 aa  839  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0483  isoleucyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 
918 aa  678  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004419  isoleucyl-tRNA synthetase  44.37 
 
 
942 aa  832  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>