More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1097 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1097  replicative DNA helicase  100 
 
 		 481 aa  990    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.513997  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1827  replicative DNA helicase  64.83 
 
 		 481 aa  646    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.981728  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1409  primary replicative DNA helicase  63.36 
 
 		 456 aa  622  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000016213  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2027  replicative DNA helicase  64.65 
 
 		 451 aa  598  1e-170  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1353  replicative DNA helicase  62.3 
 
 		 450 aa  572  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2021  replicative DNA helicase  57.42 
 
 		 508 aa  546  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00119519  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0998  replicative DNA helicase  52.91 
 
 		 456 aa  482  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2568  primary replicative DNA helicase  52.78 
 
 		 456 aa  481  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00282826  normal  0.174192 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1995  replicative DNA helicase  53.1 
 
 		 456 aa  471  1e-132  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0928  replicative DNA helicase  52.48 
 
 		 449 aa  472  1e-132  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000728284  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0134  primary replicative DNA helicase  51.8 
 
 		 444 aa  466  9.999999999999999e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.132489  normal  0.322197 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1409  replicative DNA helicase  51.59 
 
 		 449 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000202868 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2801  replicative DNA helicase  51.14 
 
 		 449 aa  463  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.235348  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3184  replicative DNA helicase  48.21 
 
 		 445 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.998408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3301  replicative DNA helicase  50.68 
 
 		 440 aa  457  1e-127  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.21798  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2256  primary replicative DNA helicase  50.8 
 
 		 445 aa  454  1.0000000000000001e-126  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000224677  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3273  replicative DNA helicase  48.78 
 
 		 456 aa  451  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4349  replicative DNA helicase  48.29 
 
 		 441 aa  449  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0748508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2387  replicative DNA helicase  47.82 
 
 		 442 aa  448  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0927  replicative DNA helicase  51.8 
 
 		 465 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1931  replicative DNA helicase  52.05 
 
 		 461 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0534  replicative DNA helicase  49.33 
 
 		 458 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0082  replicative DNA helicase  49.54 
 
 		 446 aa  442  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0258  primary replicative DNA helicase  50.69 
 
 		 460 aa  442  1e-123  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.256093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04796  replicative DNA helicase  50.45 
 
 		 476 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.744907  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2637  replicative DNA helicase  50.45 
 
 		 476 aa  440  9.999999999999999e-123  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415006 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1735  replicative DNA helicase  48.49 
 
 		 461 aa  437  1e-121  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0740032  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1794  replicative DNA helicase  50.68 
 
 		 471 aa  432  1e-120  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.549463  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1867  replicative DNA helicase  50.68 
 
 		 471 aa  432  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.745764  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0882  replicative DNA helicase  48.96 
 
 		 447 aa  432  1e-120  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00111559  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1947  replicative DNA helicase  51.58 
 
 		 470 aa  429  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2924  replicative DNA helicase  48.05 
 
 		 459 aa  422  1e-117  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.124062  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3540  replicative DNA helicase  48.17 
 
 		 454 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3411  replicative DNA helicase  47.48 
 
 		 454 aa  424  1e-117  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0223  DnaB helicase  49.09 
 
 		 472 aa  419  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2910  primary replicative DNA helicase  47 
 
 		 448 aa  421  1e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2211  replicative DNA helicase  46.61 
 
 		 442 aa  420  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0803  replicative DNA helicase  47.56 
 
 		 460 aa  417  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0774  replicative DNA helicase  47.56 
 
 		 460 aa  415  9.999999999999999e-116  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2002  replicative DNA helicase  50.11 
 
 		 463 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0006  replicative DNA helicase  45.47 
 
 		 471 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3553  replicative DNA helicase  45.27 
 
 		 454 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.520185 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0382  replicative DNA helicase  48.87 
 
 		 465 aa  414  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00608518  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4008  replicative DNA helicase  44.81 
 
 		 453 aa  413  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000502825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5340  replicative DNA helicase  45.37 
 
 		 449 aa  413  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000100588  hitchhiker  0.000000000805673 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4929  replicative DNA helicase  45.52 
 
 		 444 aa  414  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000797839  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1975  replicative DNA helicase  50.11 
 
 		 463 aa  412  1e-114  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.131049  normal  0.119575 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0940  replicative DNA helicase  46.6 
 
 		 472 aa  414  1e-114  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.68616  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5595  replicative DNA helicase  44.59 
 
 		 453 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4110  primary replicative DNA helicase  44.27 
 
 		 460 aa  412  1e-114  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5261  replicative DNA helicase  45.07 
 
 		 453 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000442873  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2382  replicative DNA helicase  46.61 
 
 		 472 aa  412  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9348  replicative DNA helicase  45.33 
 
 		 451 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.500437 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1822  replicative DNA helicase  46.61 
 
 		 469 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0791999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5656  replicative DNA helicase  44.84 
 
 		 453 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000115662  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5578  replicative DNA helicase  44.84 
 
 		 453 aa  411  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6689500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5321  replicative DNA helicase  44.84 
 
 		 453 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0278999  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5149  replicative DNA helicase  44.84 
 
 		 453 aa  411  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000056604  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5165  replicative DNA helicase  44.84 
 
 		 453 aa  411  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000098375  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2101  primary replicative DNA helicase  50.11 
 
 		 463 aa  412  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3665  replicative DNA helicase  48.99 
 
 		 470 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000253139  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5717  replicative DNA helicase  44.84 
 
 		 453 aa  411  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000293177  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1330  primary replicative DNA helicase  47.64 
 
 		 462 aa  411  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.455664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3883  replicative DNA helicase  44.14 
 
 		 461 aa  411  1e-113  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000215257 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1186  replicative DNA helicase  49.21 
 
 		 462 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.104196  normal  0.0632375 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0852  primary replicative DNA helicase  46.61 
 
 		 443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1247  replicative DNA helicase  49.21 
 
 		 462 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.250408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1358  replicative DNA helicase  45.66 
 
 		 453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.059229  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3095  replicative DNA helicase  46.94 
 
 		 446 aa  404  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0322768  normal  0.184151 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23150  primary replicative DNA helicase  44.06 
 
 		 462 aa  403  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.749598  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0019  primary replicative DNA helicase  44.95 
 
 		 449 aa  404  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000143574  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2543  primary replicative DNA helicase  48.51 
 
 		 468 aa  403  1e-111  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1325  primary replicative DNA helicase  46.4 
 
 		 454 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2970  replicative DNA helicase  44.06 
 
 		 444 aa  402  1e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4175  replicative DNA helicase  43.38 
 
 		 457 aa  404  1e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.767502  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03924  replicative DNA helicase  47.75 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.53441  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1311  replicative DNA helicase  49.1 
 
 		 473 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2565  replicative DNA helicase  48.19 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.76517  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3976  replicative DNA helicase  47.75 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.40263 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28971  DnaB replicative helicase  47.83 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4513  replicative DNA helicase  47.75 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0330  DnaB helicase  47.26 
 
 		 450 aa  400  9.999999999999999e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.850269  normal  0.345432 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0538  replicative DNA helicase  47.17 
 
 		 465 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.294706 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5170  replicative DNA helicase  48.42 
 
 		 460 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03884  hypothetical protein  47.75 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.543473  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4292  replicative DNA helicase  47.52 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5554  replicative DNA helicase  47.75 
 
 		 471 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3756  replicative DNA helicase  43.38 
 
 		 442 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00600051  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3212  primary replicative DNA helicase  48.19 
 
 		 472 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6209  replicative DNA helicase  48.42 
 
 		 460 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.985308  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002337  replicative DNA helicase  47.87 
 
 		 466 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000292135  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0741  replicative DNA helicase  48.42 
 
 		 468 aa  400  9.999999999999999e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2648  replicative DNA helicase  44.06 
 
 		 439 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2826  replicative DNA helicase  48.98 
 
 		 473 aa  401  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1870  replicative DNA helicase  48.42 
 
 		 460 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.826495  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4543  replicative DNA helicase  47.75 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1530  primary replicative DNA helicase  47.52 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000128037  normal  0.452968 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4604  replicative DNA helicase  47.75 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1232  primary replicative DNA helicase  47.29 
 
 		 473 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0177324 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21441  DnaB replicative helicase  46.8 
 
 		 472 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>