More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1096 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 160 aa  321  3e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  62.07 
 
 		 171 aa  187  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  53.69 
 
 		 167 aa  169  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  52.26 
 
 		 167 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  58.71 
 
 		 168 aa  161  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  51.35 
 
 		 168 aa  158  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  47.95 
 
 		 147 aa  143  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  45.95 
 
 		 148 aa  140  6e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  45.89 
 
 		 147 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  45.83 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  45.21 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  50 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  48.61 
 
 		 147 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  47.26 
 
 		 148 aa  136  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  47.06 
 
 		 151 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  45.83 
 
 		 148 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  47.22 
 
 		 149 aa  131  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  45.83 
 
 		 149 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  45.83 
 
 		 149 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  46.9 
 
 		 147 aa  127  7.000000000000001e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  45.07 
 
 		 151 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  49.66 
 
 		 149 aa  126  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00744  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.73532  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  41.67 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  44.14 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  47.95 
 
 		 149 aa  125  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  51.03 
 
 		 149 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  43.66 
 
 		 151 aa  125  3e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3185  ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 148 aa  125  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3121  ribosomal protein L9  42.14 
 
 		 193 aa  124  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  44.59 
 
 		 149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  43.36 
 
 		 148 aa  124  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  43.92 
 
 		 149 aa  123  9e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  43.97 
 
 		 151 aa  123  1e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  43.75 
 
 		 159 aa  123  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  44.83 
 
 		 148 aa  122  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  42.96 
 
 		 151 aa  121  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  41.83 
 
 		 151 aa  119  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  45.07 
 
 		 147 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  46.62 
 
 		 149 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  44.83 
 
 		 148 aa  118  3e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  43.45 
 
 		 150 aa  118  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  41.67 
 
 		 146 aa  117  7e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 153 aa  117  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0397  hypothetical protein  40.43 
 
 		 149 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  38.19 
 
 		 148 aa  116  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5418  50S ribosomal protein L9  39.87 
 
 		 190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1642  50S ribosomal protein L9  39.13 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0557513  normal  0.0367892 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2131  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.103333  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 148 aa  115  3e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2050  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.889408  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4414  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 190 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  40.97 
 
 		 147 aa  114  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2587  50S ribosomal protein L9  43.38 
 
 		 150 aa  114  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.800649 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0007  50S ribosomal protein L9  42.65 
 
 		 151 aa  114  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3939  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.190537 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4307  50S ribosomal protein L9  40 
 
 		 190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  42.76 
 
 		 148 aa  113  8.999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 189 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1414  50S ribosomal protein L9  42.38 
 
 		 199 aa  113  1.0000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  39.33 
 
 		 194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3558  50S ribosomal protein L9  39.86 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.882223 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  36.54 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0586  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 150 aa  111  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.482938  hitchhiker  3.77539e-17 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07670  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 148 aa  111  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.957501  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000131124  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3541  50S ribosomal protein L9  47.26 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2458  50S ribosomal protein L9P  41.1 
 
 		 149 aa  110  7.000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174518 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  37.33 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2102  50S ribosomal protein L9P  42.07 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1381  ribosomal protein L9  45.21 
 
 		 150 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  43.75 
 
 		 149 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1547  50S ribosomal protein L9  41.96 
 
 		 149 aa  108  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3281  50S ribosomal protein L9  42.38 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.134585  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2593  50S ribosomal protein L9  41.79 
 
 		 189 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0267673 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  40.13 
 
 		 204 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2332  ribosomal protein L9  36.71 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.640711  hitchhiker  0.00706783 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1510  ribosomal protein L9  40 
 
 		 186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0418  ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.291311  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1436  50S ribosomal protein L9  42.66 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03776  50S ribosomal protein L9  41.61 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1219  50S ribosomal protein L9P  40.69 
 
 		 148 aa  107  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.405746 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  38.67 
 
 		 189 aa  107  6e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3490  50S ribosomal protein L9  36.67 
 
 		 195 aa  107  6e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0654  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0648  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000594391 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1210  50S ribosomal protein L9  38 
 
 		 209 aa  107  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0873917  normal  0.750153 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2212  50S ribosomal protein L9  44.44 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  42.18 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0681  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3636  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3781  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  38.67 
 
 		 209 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  34.75 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0222  ribosomal protein L9  40 
 
 		 151 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1361  ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 150 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0210  ribosomal protein L9  40 
 
 		 172 aa  105  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000722973  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0083  50S ribosomal protein L9  37.82 
 
 		 202 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.584189  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>