More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1021 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  100 
 
 		 346 aa  704    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  45.39 
 
 		 331 aa  303  4.0000000000000003e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  46 
 
 		 337 aa  299  5e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  47.95 
 
 		 303 aa  290  2e-77  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  43.97 
 
 		 331 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  39.2 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  42.9 
 
 		 326 aa  263  4e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0749  cation diffusion facilitator family transporter  43.23 
 
 		 338 aa  248  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  38.59 
 
 		 327 aa  245  6.999999999999999e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2581  cation diffusion facilitator family transporter  47.37 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1143  cation efflux protein  37.65 
 
 		 331 aa  236  4e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.344034  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  45.18 
 
 		 302 aa  234  2.0000000000000002e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  44.1 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  42.81 
 
 		 308 aa  222  7e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  43.66 
 
 		 296 aa  222  9e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  39.13 
 
 		 320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  40.67 
 
 		 305 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  40.53 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  38.49 
 
 		 313 aa  212  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  41.98 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  41.33 
 
 		 315 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  42.01 
 
 		 302 aa  209  7e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  44.71 
 
 		 319 aa  207  3e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  44.71 
 
 		 319 aa  206  3e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  44.81 
 
 		 376 aa  206  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  45.45 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  46.57 
 
 		 293 aa  202  6e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  42.59 
 
 		 293 aa  202  7e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  36.54 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  35.71 
 
 		 311 aa  201  9.999999999999999e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1256  cation diffusion facilitator family transporter  46.99 
 
 		 303 aa  200  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.513971  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  38.93 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  42.8 
 
 		 306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  42.05 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  42.76 
 
 		 317 aa  196  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  41.86 
 
 		 328 aa  196  6e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  41.24 
 
 		 295 aa  196  7e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  42.28 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  42.42 
 
 		 316 aa  194  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  42.61 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  42.69 
 
 		 315 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  41.43 
 
 		 295 aa  193  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  41.43 
 
 		 295 aa  193  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  41.7 
 
 		 314 aa  192  6e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  42.31 
 
 		 315 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  44.76 
 
 		 296 aa  191  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  38.98 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  40.96 
 
 		 305 aa  189  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4099  cation diffusion facilitator family transporter  43.95 
 
 		 304 aa  189  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  41.48 
 
 		 312 aa  188  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  40.75 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  42.86 
 
 		 300 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  41.39 
 
 		 295 aa  186  5e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  40.96 
 
 		 304 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  42.46 
 
 		 339 aa  183  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  35.67 
 
 		 311 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  40.75 
 
 		 302 aa  183  5.0000000000000004e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  40.75 
 
 		 302 aa  183  5.0000000000000004e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0729  cation diffusion facilitator family transporter  42.86 
 
 		 304 aa  182  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  36.07 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  41.79 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  38.85 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  40.21 
 
 		 285 aa  176  6e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  42.05 
 
 		 315 aa  176  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  40.98 
 
 		 305 aa  175  9.999999999999999e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  34.53 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  43.3 
 
 		 332 aa  172  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0724  cation diffusion facilitator family transporter  34.54 
 
 		 315 aa  169  8e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152803  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0607  cation diffusion facilitator family transporter  40.21 
 
 		 309 aa  168  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212656  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  38.08 
 
 		 304 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  34.45 
 
 		 307 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0463  cation efflux transporter  38.03 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  37.28 
 
 		 327 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2400  cation diffusion facilitator family transporter  33.77 
 
 		 307 aa  162  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2384  cation diffusion facilitator family transporter  39.08 
 
 		 295 aa  159  8e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.336168 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  32.62 
 
 		 285 aa  158  1e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  31.91 
 
 		 309 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  34.81 
 
 		 307 aa  152  7e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  37.86 
 
 		 295 aa  152  7e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2115  cation diffusion facilitator family transporter  38.38 
 
 		 295 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.922775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1509  putative transport system permease protein  28.67 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073133  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0446  cation diffusion facilitator family transporter  33.01 
 
 		 328 aa  150  4e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.48861  normal  0.265047 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  32.13 
 
 		 328 aa  146  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  34.12 
 
 		 310 aa  144  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1582  cation diffusion facilitator family transporter  27.17 
 
 		 299 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0084  pantothenate metabolism flavoprotein  28.42 
 
 		 311 aa  127  2.0000000000000002e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00694286  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2871  cation efflux protein  31.71 
 
 		 317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  30.82 
 
 		 312 aa  125  9e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0710  cation diffusion facilitator family transporter  30.87 
 
 		 476 aa  125  1e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1171  cation efflux family protein  26.43 
 
 		 295 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2262  ferrous iron efflux protein F  31.73 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000896639  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1026  cation efflux family protein  25.98 
 
 		 295 aa  123  5e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0972  cation efflux family protein  25.98 
 
 		 295 aa  123  5e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  30.4 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  30.04 
 
 		 300 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  30.04 
 
 		 300 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  30.04 
 
 		 300 aa  122  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0087  ferrous iron efflux protein F  32.48 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4127  ferrous iron efflux protein F  32.48 
 
 		 300 aa  122  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  32.23 
 
 		 300 aa  121  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>