196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0973 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 194 aa  388  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  40.44 
 
 		 184 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0904  2'-5' RNA ligase  35.62 
 
 		 271 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0022796 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  37.57 
 
 		 190 aa  107  9.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  37.16 
 
 		 184 aa  106  2e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  27.03 
 
 		 189 aa  104  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  37.5 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  32.07 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  37.64 
 
 		 179 aa  101  5e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  31.77 
 
 		 194 aa  99.8  2e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  35.48 
 
 		 179 aa  97.4  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  29.67 
 
 		 180 aa  95.9  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  32.07 
 
 		 180 aa  95.1  5e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  32.07 
 
 		 194 aa  95.5  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  32.63 
 
 		 187 aa  93.6  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  34.29 
 
 		 192 aa  92.4  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  35.29 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 184 aa  92  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  32.64 
 
 		 189 aa  91.3  9e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  34.95 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  35.15 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  35.36 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0369  2'-5' RNA ligase  33.56 
 
 		 187 aa  88.6  6e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.863227  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0370  hypothetical protein  36.6 
 
 		 154 aa  87.4  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  27.78 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  27.17 
 
 		 189 aa  86.3  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  27.66 
 
 		 190 aa  86.3  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  37.42 
 
 		 195 aa  85.5  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  32.09 
 
 		 188 aa  84.7  7e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  31.94 
 
 		 185 aa  84.3  9e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  32.34 
 
 		 179 aa  84  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  32.8 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  33.16 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  31.55 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  29.83 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  28.28 
 
 		 187 aa  82.8  0.000000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  28.9 
 
 		 181 aa  82.8  0.000000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  28.34 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1707  2'-5' RNA ligase  34.57 
 
 		 183 aa  80.5  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.553995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  31.49 
 
 		 179 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  36.18 
 
 		 194 aa  79.3  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  36.18 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  36.18 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  27.47 
 
 		 174 aa  79  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  28.89 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  27.17 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  30.85 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  31.41 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  30.73 
 
 		 189 aa  77.4  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  31.71 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  27.37 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  28.19 
 
 		 185 aa  76.3  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3649  2',5' RNA ligase  31.49 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  28.02 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5313  2',5' RNA ligase  37.5 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.421801  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  26.63 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  27.13 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2282  2'-5' RNA ligase  27.72 
 
 		 188 aa  74.3  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216572  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  31.41 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  27.37 
 
 		 189 aa  73.6  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1790  2'-5' RNA ligase  30.22 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  23.63 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  33.51 
 
 		 195 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  39.16 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  23.76 
 
 		 174 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  27.27 
 
 		 171 aa  72  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  33.54 
 
 		 192 aa  71.6  0.000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0196  2',5' RNA ligase  29.83 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2163  2'-5' RNA ligase  28.73 
 
 		 178 aa  70.9  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.705282  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  30.36 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3287  2'-5' RNA ligase  35.6 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.246816 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  36.18 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0547  2',5' RNA ligase  29.83 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0451393  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  33.09 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3730  2'-5' RNA ligase  29.32 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2391  2'-5' RNA ligase  31.94 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  41.35 
 
 		 180 aa  67.4  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  25.13 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  28.36 
 
 		 184 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4053  2'-5' RNA ligase  28.42 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5848  2'-5' RNA ligase  35.14 
 
 		 176 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3072  2'-5' RNA ligase  28.42 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0189  2'-5' RNA ligase  29.51 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0810981  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0390  putative 2'-5' RNA ligase  31.15 
 
 		 179 aa  65.9  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.117956  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  28.3 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1055  2'-5' RNA ligase  30.81 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.2761  normal  0.204579 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  25.77 
 
 		 183 aa  65.5  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  30.56 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  23.33 
 
 		 183 aa  64.7  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0283  2',5' RNA ligase  28.57 
 
 		 188 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0277228 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0111  2'-5' RNA ligase  35.03 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  23.68 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  23.94 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  23.94 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  23.94 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  23.94 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4176  2'-5' RNA ligase  29.53 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0620865  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0850  2'-5' RNA ligase  30.81 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.275669 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  21.98 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>