More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0965 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0965  seryl-tRNA synthetase  100 
 
 		 426 aa  880    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000308686  hitchhiker  0.0000000659657 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2740  seryl-tRNA synthetase  67.85 
 
 		 424 aa  615  1e-175  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2224  seryl-tRNA synthetase  67.14 
 
 		 425 aa  609  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0196  seryl-tRNA synthetase  66.75 
 
 		 427 aa  588  1e-167  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2626  seryl-tRNA synthetase  64.24 
 
 		 427 aa  587  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1424  seryl-tRNA synthetase  61.37 
 
 		 423 aa  542  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.188091 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0108  seryl-tRNA synthetase  59.1 
 
 		 422 aa  535  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2307  seryl-tRNA synthetase  59.53 
 
 		 424 aa  535  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0287  seryl-tRNA synthetase  60.19 
 
 		 422 aa  532  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736944  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4339  seryl-tRNA synthetase  59.72 
 
 		 423 aa  532  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.619806  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0089  seryl-tRNA synthetase  58.87 
 
 		 422 aa  531  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000355791 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0021  seryl-tRNA synthetase  59.15 
 
 		 427 aa  526  1e-148  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.410192  hitchhiker  0.00000214163 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0037  seryl-tRNA synthetase  59.48 
 
 		 422 aa  521  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2745  seryl-tRNA synthetase  59.95 
 
 		 425 aa  521  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3236  seryl-tRNA synthetase  59.34 
 
 		 423 aa  523  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0012  seryl-tRNA synthetase  59.9 
 
 		 424 aa  520  1e-146  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0616  seryl-tRNA synthetase  59.72 
 
 		 422 aa  520  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0308191  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0013  seryl-tRNA synthetase  58.95 
 
 		 424 aa  514  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000183486  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3528  seryl-tRNA synthetase  60.19 
 
 		 423 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0011  seryl-tRNA synthetase  59.1 
 
 		 427 aa  512  1e-144  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0824317  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0015  seryl-tRNA synthetase  58.95 
 
 		 424 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0013  seryl-tRNA synthetase  58.95 
 
 		 424 aa  513  1e-144  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15266  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0013  seryl-tRNA synthetase  58.95 
 
 		 424 aa  514  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00217945  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21060  seryl-tRNA synthetase  57.55 
 
 		 422 aa  513  1e-144  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0014  seryl-tRNA synthetase  58.16 
 
 		 424 aa  513  1e-144  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000307933  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0016  seryl-tRNA synthetase  58.71 
 
 		 424 aa  513  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00101457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0016  seryl-tRNA synthetase  58.95 
 
 		 424 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0012  seryl-tRNA synthetase  58.95 
 
 		 424 aa  513  1e-144  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000751386  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5302  seryl-tRNA synthetase  58.71 
 
 		 424 aa  512  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000149119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0015  seryl-tRNA synthetase  57.68 
 
 		 424 aa  514  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00255283  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0018  seryl-tRNA synthetase  58.95 
 
 		 424 aa  513  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0391  seryl-tRNA synthetase  58.51 
 
 		 432 aa  514  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.405433  normal  0.944422 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0012  seryl-tRNA synthetase  58.47 
 
 		 424 aa  511  1e-143  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0448744  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0022  seryl-tRNA synthetase  57.66 
 
 		 422 aa  509  1e-143  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0008  seryl-tRNA synthetase  58.51 
 
 		 421 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00944776  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0013  seryl-tRNA synthetase  59.34 
 
 		 424 aa  503  1e-141  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2756  seryl-tRNA synthetase  58.1 
 
 		 424 aa  503  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.019051  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0013  seryl-tRNA synthetase  58.35 
 
 		 425 aa  503  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0010  Serine--tRNA ligase  56.5 
 
 		 427 aa  499  1e-140  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0427717  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2031  seryl-tRNA synthetase  55.45 
 
 		 423 aa  497  1e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.19968  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0326  seryl-tRNA synthetase  58.87 
 
 		 423 aa  493  9.999999999999999e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  4.81003e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2381  seryl-tRNA synthetase  53.79 
 
 		 423 aa  488  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0872  seryl-tRNA synthetase  56.12 
 
 		 420 aa  491  1e-137  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000202567  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1006  seryl-tRNA synthetase  54.95 
 
 		 427 aa  491  1e-137  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.224003  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0014  seryl-tRNA synthetase  54.72 
 
 		 426 aa  484  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192456  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0013  seryl-tRNA synthetase  54.61 
 
 		 422 aa  484  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1229  seryl-tRNA synthetase  55.27 
 
 		 427 aa  479  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1770  seryl-tRNA synthetase  55.92 
 
 		 423 aa  478  1e-134  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1392  seryl-tRNA synthetase  56.09 
 
 		 425 aa  481  1e-134  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1073  seryl-tRNA synthetase  55.01 
 
 		 430 aa  481  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.441533 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0550  seryl-tRNA synthetase  55.92 
 
 		 421 aa  477  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0012144  hitchhiker  0.0000582933 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2594  seryl-tRNA synthetase  54.25 
 
 		 434 aa  475  1e-133  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.365068  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0380  seryl-tRNA synthetase  55.92 
 
 		 421 aa  477  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.241897  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0028  seryl-tRNA synthetase  56.01 
 
 		 423 aa  476  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000346844  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1776  seryl-tRNA synthetase  54.29 
 
 		 428 aa  474  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0781762  hitchhiker  0.00882047 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28180  seryl-tRNA synthetase  57.08 
 
 		 426 aa  472  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.044076  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1539  seryl-tRNA synthetase  54.55 
 
 		 428 aa  472  1e-132  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000020455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2131  seryl-tRNA synthetase  54.1 
 
 		 428 aa  474  1e-132  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0131347  normal  0.0177706 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0695  seryl-tRNA synthetase  53.44 
 
 		 435 aa  473  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1699  seryl-tRNA synthetase  56.21 
 
 		 424 aa  473  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.849075 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0368  seryl-tRNA synthetase  54.69 
 
 		 425 aa  471  1e-132  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2337  seryl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 438 aa  470  1.0000000000000001e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.252974 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2020  seryl-tRNA synthetase  54.8 
 
 		 428 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000521115  hitchhiker  0.00090554 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2479  seryl-tRNA synthetase  54.33 
 
 		 428 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  0.00000482447 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2315  seryl-tRNA synthetase  55.9 
 
 		 425 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00701941  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2145  seryl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 438 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.119162  normal  0.699626 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1036  seryl-tRNA synthetase  53.54 
 
 		 427 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2229  seryl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 428 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0252643  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0014  seryl-tRNA synthetase  55.37 
 
 		 425 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0014  seryl-tRNA synthetase  55.37 
 
 		 425 aa  468  9.999999999999999e-131  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0253  seryl-tRNA synthetase  53.52 
 
 		 425 aa  465  9.999999999999999e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1799  seryl-tRNA synthetase  52.69 
 
 		 428 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0591455  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0851  seryl-tRNA synthetase  53.5 
 
 		 433 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.165217  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2545  seryl-tRNA synthetase  53.19 
 
 		 428 aa  462  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2211  seryl-tRNA synthetase  54.65 
 
 		 428 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000908788  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0885  seryl-tRNA synthetase  55.19 
 
 		 427 aa  464  1e-129  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2310  seryl-tRNA synthetase  54.88 
 
 		 428 aa  461  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2551  seryl-tRNA synthetase  53.42 
 
 		 438 aa  463  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2319  seryl-tRNA synthetase  54.65 
 
 		 428 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000145216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0876  seryl-tRNA synthetase  56.07 
 
 		 469 aa  464  1e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.213441  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2160  seryl-tRNA synthetase  54.42 
 
 		 428 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0336189  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0180  seryl-tRNA synthetase  49.56 
 
 		 456 aa  461  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.420284  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1195  seryl-tRNA synthetase  53.46 
 
 		 417 aa  463  1e-129  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.877064  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1404  seryl-tRNA synthetase  55 
 
 		 425 aa  462  1e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0506465  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2342  seryl-tRNA synthetase  55.87 
 
 		 442 aa  463  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.261311  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1833  seryl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 426 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000844174 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1967  seryl-tRNA synthetase  55.12 
 
 		 428 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000578776  normal  0.974041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2009  seryl-tRNA synthetase  55.12 
 
 		 428 aa  462  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000634653  hitchhiker  0.000399612 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1666  seryl-tRNA synthetase  56.05 
 
 		 428 aa  464  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.746595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2054  seryl-tRNA synthetase  55.12 
 
 		 428 aa  462  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00569868  hitchhiker  0.000126187 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4000  seryl-tRNA synthetase  55.48 
 
 		 426 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.279963  hitchhiker  0.00302148 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0356  seryl-tRNA synthetase  53.88 
 
 		 425 aa  459  9.999999999999999e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3345  seryl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 426 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0468703  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3175  seryl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 426 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.499903  normal  0.106811 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4082  seryl-tRNA synthetase  53.5 
 
 		 433 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.159254  normal  0.389584 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2384  seryl-tRNA synthetase  54.76 
 
 		 426 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617953 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3404  seryl-tRNA synthetase  54.78 
 
 		 426 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.25013 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1547  seryl-tRNA synthetase  54.37 
 
 		 424 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0839  seryl-tRNA synthetase  53.5 
 
 		 433 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118464  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3605  seryl-tRNA synthetase  55.01 
 
 		 426 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>