204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0962 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0962  integrase family protein  100 
 
 
371 aa  768  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  5.86623e-11  decreased coverage  3.58592e-10 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1687  integrase family protein  42.42 
 
 
355 aa  229  5e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0620  hypothetical protein  40.22 
 
 
281 aa  188  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0137294  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1491  integrase family protein  40 
 
 
273 aa  155  7e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.10711  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2734  integrase family protein  33.83 
 
 
364 aa  133  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  1.51395e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2906  integrase family protein  28.41 
 
 
357 aa  114  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0825768  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  35.22 
 
 
400 aa  74.3  3e-12  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  36.62 
 
 
398 aa  73.6  5e-12  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  24.12 
 
 
467 aa  70.9  3e-11  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  35.66 
 
 
417 aa  68.2  2e-10  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  28.83 
 
 
412 aa  68.2  2e-10  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  24.2 
 
 
399 aa  67  5e-10  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  24.84 
 
 
399 aa  65.5  1e-09  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  33.33 
 
 
415 aa  64.3  3e-09  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  1.58235e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  25.48 
 
 
400 aa  63.9  5e-09  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  23.6 
 
 
400 aa  63.5  6e-09  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  24.51 
 
 
401 aa  63.5  6e-09  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  25.86 
 
 
444 aa  63.2  8e-09  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  29.22 
 
 
367 aa  61.6  2e-08  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  28.57 
 
 
397 aa  61.2  3e-08  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  22.78 
 
 
399 aa  60.1  5e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  29.73 
 
 
409 aa  60.1  6e-08  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  30.28 
 
 
404 aa  59.7  7e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  24.84 
 
 
401 aa  59.7  8e-08  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  4.88668e-10  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  24.84 
 
 
401 aa  59.7  8e-08  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  29.2 
 
 
159 aa  59.3  1e-07  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  33.54 
 
 
337 aa  59.3  1e-07  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  22.06 
 
 
415 aa  58.5  2e-07  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  22.06 
 
 
415 aa  58.5  2e-07  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  22.06 
 
 
399 aa  58.5  2e-07  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2414  phage integrase family protein  27.9 
 
 
358 aa  57.8  3e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  21.76 
 
 
399 aa  57.4  4e-07  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  31.43 
 
 
301 aa  57.4  4e-07  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  22.86 
 
 
400 aa  57.4  4e-07  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  22.86 
 
 
400 aa  57.4  4e-07  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  25.48 
 
 
402 aa  57  5e-07  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  4.73566e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  23.57 
 
 
337 aa  56.6  6e-07  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  27.66 
 
 
424 aa  56.6  6e-07  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  28.47 
 
 
172 aa  57  6e-07  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2723  integrase family protein  29.78 
 
 
313 aa  56.6  6e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  31.76 
 
 
376 aa  56.6  8e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  1.92232e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2126  integrase family protein  25 
 
 
395 aa  56.2  8e-07  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  26.15 
 
 
393 aa  55.8  1e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  24.44 
 
 
413 aa  55.8  1e-06  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  31.69 
 
 
334 aa  55.8  1e-06  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  25.83 
 
 
411 aa  55.8  1e-06  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  29.11 
 
 
275 aa  55.8  1e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1227  integrase family protein  25 
 
 
305 aa  55.5  1e-06  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.842173  decreased coverage  0.000216705 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  26.07 
 
 
391 aa  55.8  1e-06  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  22.26 
 
 
400 aa  55.5  1e-06  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  23.72 
 
 
387 aa  55.1  2e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2236  integrase family protein  31.43 
 
 
340 aa  54.7  3e-06  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0483412  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  25.99 
 
 
390 aa  54.7  3e-06  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30 
 
 
376 aa  54.3  3e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  30 
 
 
376 aa  54.3  3e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  27.57 
 
 
404 aa  53.9  4e-06  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2145  integrase  27.27 
 
 
393 aa  54.3  4e-06  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  29.5 
 
 
384 aa  53.9  4e-06  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  25.54 
 
 
387 aa  53.9  5e-06  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  26.7 
 
 
354 aa  53.9  5e-06  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  26.7 
 
 
354 aa  53.9  5e-06  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  30.27 
 
 
376 aa  53.1  7e-06  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  24.78 
 
 
414 aa  53.1  7e-06  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  2.30336e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  30.88 
 
 
381 aa  53.1  7e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  27.52 
 
 
294 aa  53.1  8e-06  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  26.21 
 
 
378 aa  52.8  9e-06  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  24.85 
 
 
348 aa  52.8  9e-06  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0989  integrase family protein  22.58 
 
 
355 aa  52.8  9e-06  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000138199  hitchhiker  3.68709e-15 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  25 
 
 
389 aa  52.8  9e-06  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  25.47 
 
 
391 aa  52  1e-05  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  25.08 
 
 
392 aa  52.4  1e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  27.51 
 
 
349 aa  52.8  1e-05  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  31.13 
 
 
444 aa  52.8  1e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  23.83 
 
 
383 aa  52  2e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.32895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  29.28 
 
 
392 aa  52  2e-05  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  3.97895e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  26.42 
 
 
276 aa  51.6  2e-05  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  28.78 
 
 
222 aa  51.6  2e-05  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03170  site-specific recombinase XerD  26.92 
 
 
307 aa  52  2e-05  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  2.20198e-09 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5939  phage integrase family protein  28.74 
 
 
395 aa  51.6  2e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  22.96 
 
 
412 aa  52  2e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  27.56 
 
 
429 aa  51.2  3e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  27.46 
 
 
421 aa  51.2  3e-05  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  26.2 
 
 
387 aa  51.2  3e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  8.19042e-09 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  26.32 
 
 
278 aa  50.8  3e-05  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  22.84 
 
 
379 aa  50.8  4e-05  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  28.29 
 
 
406 aa  50.4  4e-05  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  25.82 
 
 
386 aa  50.4  5e-05  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4760  integrase family protein  27.54 
 
 
354 aa  50.1  6e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  27.59 
 
 
384 aa  50.1  7e-05  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1956  Integrase  27.98 
 
 
312 aa  49.7  8e-05  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  21.43 
 
 
387 aa  49.7  9e-05  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3952  integrase family protein  26.74 
 
 
310 aa  49.7  9e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  21.43 
 
 
387 aa  49.7  9e-05  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3278  phage integrase family site specific recombinase  32.28 
 
 
146 aa  49.3  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  26.8 
 
 
384 aa  49.3  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  26.67 
 
 
353 aa  49.3  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2782  phage integrase family protein  28.24 
 
 
356 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507501  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  24.35 
 
 
387 aa  49.3  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2147  phage integrase family protein  29.85 
 
 
367 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  25.11 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>