More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0953 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  100 
 
 
265 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1428  arsenite S-adenosylmethyltransferase  63.22 
 
 
268 aa  332  3e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0251  arsenite S-adenosylmethyltransferase  61.8 
 
 
272 aa  324  8.000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0762  arsenite S-adenosylmethyltransferase  61.92 
 
 
266 aa  322  5e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000040613  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2791  arsenite S-adenosylmethyltransferase  61.09 
 
 
266 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1246  Methyltransferase type 11  55.19 
 
 
288 aa  289  3e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.476258 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2552  Methyltransferase type 11  54.51 
 
 
263 aa  289  3e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.318811 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  55.69 
 
 
267 aa  286  2.9999999999999996e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0266  methyltransferase type 11  59.38 
 
 
279 aa  269  2.9999999999999997e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608985  normal  0.806838 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3046  Methyltransferase type 11  50.17 
 
 
295 aa  250  2e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  45.9 
 
 
267 aa  242  3.9999999999999997e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1926  Methyltransferase type 11  48.03 
 
 
281 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1429  methyltransferase type 11  48.25 
 
 
262 aa  242  5e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  52.44 
 
 
280 aa  237  1e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  52.63 
 
 
277 aa  236  3e-61  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  51.34 
 
 
277 aa  232  5e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1714  arsenite S-adenosylmethyltransferase  54.42 
 
 
248 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.019439  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  50.58 
 
 
265 aa  218  8.999999999999998e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2959  methyltransferase type 11  50.44 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.896455  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  44.89 
 
 
283 aa  207  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  48.64 
 
 
271 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04625  arsenic methyltransferase Cyt19, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G15020)  42.91 
 
 
282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  43.13 
 
 
276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1201  arsenite S-adenosylmethyltransferase  46.26 
 
 
270 aa  198  7.999999999999999e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  41.92 
 
 
298 aa  194  2e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  46.49 
 
 
237 aa  194  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00700  conserved hypothetical protein  43.75 
 
 
239 aa  192  3e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1514  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.4 
 
 
280 aa  192  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.732855  normal  0.394631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6112  arsenite S-adenosylmethyltransferase  38.04 
 
 
279 aa  188  7e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0591  Methyltransferase type 11  45.23 
 
 
263 aa  183  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.812194 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2312  methyltransferase type 11  43.7 
 
 
276 aa  178  7e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0499  Methyltransferase type 11  52.41 
 
 
264 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000709402  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0104  Methyltransferase type 11  47.39 
 
 
260 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3743  methyltransferase type 11  50.23 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.347192  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2645  methyltransferase type 11  45.05 
 
 
262 aa  171  9e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.75506  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3346  Methyltransferase type 11  42.75 
 
 
265 aa  171  9e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.408224  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2089  putative methyltransferase  47.55 
 
 
1014 aa  170  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0627261  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1224  methyltransferase type 11  45.76 
 
 
282 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.158383  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3376  Methyltransferase type 11  46.72 
 
 
256 aa  166  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0407493  hitchhiker  0.00438973 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  50.59 
 
 
246 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  43.86 
 
 
280 aa  165  9e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1027  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 
258 aa  161  8.000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1196  Methyltransferase type 11  44.66 
 
 
259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  41.04 
 
 
355 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0923  Methyltransferase type 11  40.95 
 
 
1039 aa  152  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0110  methyltransferase type 11  46.12 
 
 
274 aa  152  8e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  39.65 
 
 
350 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0228  Methyltransferase type 11  42.93 
 
 
1002 aa  149  4e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  42.33 
 
 
1000 aa  145  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  40.09 
 
 
1005 aa  145  6e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3423  Methyltransferase type 11  42.44 
 
 
241 aa  145  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.248602  normal  0.101773 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  41.03 
 
 
409 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3308  methyltransferase type 11  40.99 
 
 
239 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.358181  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04351  putative methyltransferase  36.67 
 
 
264 aa  144  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_25654  predicted protein  47.26 
 
 
200 aa  144  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1710  methyltransferase type 11  40.98 
 
 
262 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_39627  predicted protein  36.91 
 
 
410 aa  144  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  41.85 
 
 
411 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1636  methyltransferase type 11  37.08 
 
 
261 aa  143  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.431948  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04771  putative methyltransferase  35.83 
 
 
264 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04661  putative methyltransferase  36.25 
 
 
264 aa  142  6e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_28006  predicted protein  39.22 
 
 
418 aa  136  4e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.122244 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0411  hypothetical protein  35.83 
 
 
264 aa  135  6.0000000000000005e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0624483  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0896  Methyltransferase type 11  43.18 
 
 
350 aa  135  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0677  methyltransferase-like  36.84 
 
 
266 aa  132  6e-30  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08531  putative methyltransferase  36.03 
 
 
267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0301  methyltransferase type 11  36.6 
 
 
380 aa  128  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3171  methyltransferase type 11  50.72 
 
 
204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4114  Methyltransferase type 11  34.33 
 
 
365 aa  125  7e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.199074  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1984  methyltransferase-like  35.83 
 
 
270 aa  125  9e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4075  Methyltransferase type 11  34.33 
 
 
365 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1612  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.48 
 
 
356 aa  123  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1418  methyltransferase type 11  38.03 
 
 
379 aa  123  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.685062  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04141  putative methyltransferase  35.55 
 
 
241 aa  123  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  34.8 
 
 
355 aa  119  7e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3557  Methyltransferase type 11  38.5 
 
 
369 aa  118  7.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0826435  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2318  methyltransferase type 11  37.71 
 
 
349 aa  118  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.399773  normal  0.0108051 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.84 
 
 
346 aa  117  3e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  43.18 
 
 
209 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2227  Methyltransferase type 11  35.68 
 
 
396 aa  116  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372982 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3607  Methyltransferase type 11  34.06 
 
 
307 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.289928  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  37.5 
 
 
216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1914  Methyltransferase type 11  36.46 
 
 
324 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3620  hypothetical protein  33.48 
 
 
346 aa  112  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.615774  normal  0.159076 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1991  methyltransferase type 11  34.27 
 
 
411 aa  108  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2550  methyltransferase type 11  38.51 
 
 
348 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.00904798  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05015  hypothetical protein  30.29 
 
 
322 aa  95.9  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3797  hypothetical protein  35.75 
 
 
350 aa  94.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 
415 aa  94  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0388  type 11 methyltransferase  30.43 
 
 
322 aa  91.7  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  36.42 
 
 
271 aa  89  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  35.14 
 
 
261 aa  88.6  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  36.09 
 
 
271 aa  88.6  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4641  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.29 
 
 
296 aa  86.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  46.73 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  46.73 
 
 
251 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  31.67 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.04 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1087  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  39.84 
 
 
248 aa  82  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0234174  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>