More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0917 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0917  cobalamin synthesis protein P47K  100 
 
 
614 aa  1265  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3150  cobalamin synthesis protein P47K  36.63 
 
 
640 aa  363  4e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.179732  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3612  cobalamin synthesis protein, P47K  35.99 
 
 
624 aa  322  1e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0463068 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2135  cobalamin synthesis protein P47K  30.81 
 
 
596 aa  286  7e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1617  G3E family GTPase-like protein  29.65 
 
 
625 aa  231  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000670583  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0508  cobalamin synthesis protein, P47K  29.77 
 
 
648 aa  221  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.560215 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1723  cobalamin synthesis protein P47K  28.64 
 
 
615 aa  221  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  44.02 
 
 
493 aa  135  2e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  35.87 
 
 
323 aa  133  1e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  35.05 
 
 
323 aa  131  4e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  39.01 
 
 
323 aa  129  1e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  35.32 
 
 
323 aa  128  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0182  cobalamin synthesis protein P47K  29.13 
 
 
308 aa  127  4e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  33.44 
 
 
323 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  33.44 
 
 
323 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  35.14 
 
 
320 aa  126  9e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  31.02 
 
 
361 aa  122  1e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40.31 
 
 
345 aa  122  2e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  39.06 
 
 
363 aa  122  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  41.67 
 
 
350 aa  121  3e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  40 
 
 
355 aa  121  5e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  38.83 
 
 
332 aa  120  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  41.67 
 
 
353 aa  120  7e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  32.76 
 
 
335 aa  119  1e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  36.98 
 
 
457 aa  120  1e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  34.55 
 
 
320 aa  119  2e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  34.69 
 
 
328 aa  119  2e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  34.02 
 
 
329 aa  119  2e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  41.08 
 
 
349 aa  119  2e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  36.76 
 
 
460 aa  119  2e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15320  cobalamin synthesis protein P47K  31.73 
 
 
305 aa  119  2e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  34.69 
 
 
328 aa  119  2e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  36.76 
 
 
460 aa  119  2e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14651  G3E family GTPase  28.84 
 
 
338 aa  119  2e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00856478 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  40 
 
 
350 aa  118  4e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2727  cobalamin synthesis protein, P47K  28.47 
 
 
298 aa  117  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.081954  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  37.5 
 
 
393 aa  117  6e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  39.46 
 
 
353 aa  117  7e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5621  cobalamin synthesis protein P47K  33.21 
 
 
325 aa  117  8e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.16465 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  42.7 
 
 
324 aa  116  1e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  38.92 
 
 
320 aa  116  1e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  30 
 
 
404 aa  116  1e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1160  cobalamin synthesis protein, P47K  35.98 
 
 
420 aa  116  1e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  38.19 
 
 
349 aa  116  1e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1188  cobalamin synthesis protein P47K  29.64 
 
 
339 aa  116  1e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.0038044  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  39.47 
 
 
347 aa  115  2e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  30.36 
 
 
313 aa  115  2e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  36.22 
 
 
460 aa  115  2e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  31.46 
 
 
326 aa  115  2e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1786  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.87 
 
 
320 aa  115  2e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.114166  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1743  GTPase  28.87 
 
 
307 aa  115  2e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.180746  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  31.21 
 
 
343 aa  115  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3412  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.67 
 
 
307 aa  115  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  8.23465e-05 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1925  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.87 
 
 
307 aa  115  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000812691  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2009  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.67 
 
 
318 aa  114  4e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  38.38 
 
 
365 aa  114  4e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1930  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.67 
 
 
307 aa  114  4e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1961  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.87 
 
 
307 aa  114  4e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78714e-14 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4617  cobalamin synthesis protein, P47K  28.16 
 
 
327 aa  114  4e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.483497  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  36.76 
 
 
449 aa  114  6e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1765  GTPase  28.52 
 
 
307 aa  114  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.15215  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  36.76 
 
 
449 aa  114  7e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  37.5 
 
 
452 aa  114  7e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  36.76 
 
 
449 aa  113  8e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1485  cobalamin synthesis protein P47K  28.52 
 
 
310 aa  114  8e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0861962  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  37.84 
 
 
367 aa  113  9e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  38.92 
 
 
369 aa  113  1e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  39.44 
 
 
358 aa  112  1e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2030  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  28.87 
 
 
305 aa  113  1e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167135  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  38.92 
 
 
355 aa  113  1e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0956  hypothetical protein  34.18 
 
 
380 aa  113  1e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.582353  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0786  cobalamin biosynthesis protein CobW  30.28 
 
 
334 aa  113  1e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  37.84 
 
 
360 aa  112  2e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.84 
 
 
374 aa  112  2e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  38.92 
 
 
364 aa  112  2e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  32.25 
 
 
316 aa  112  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1800  cobalamin synthesis protein P47K  28.52 
 
 
328 aa  112  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.739911  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0739  cobalamin biosynthesis CobW  30.28 
 
 
335 aa  111  4e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0782025  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40980  Cobalamin synthesis protein  33.22 
 
 
323 aa  111  4e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0072  cobalamin synthesis protein P47K  36.56 
 
 
362 aa  111  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  41.9 
 
 
324 aa  110  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4878  putative GTP-binding protein YjiA  30.11 
 
 
318 aa  109  1e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5864  putative GTP-binding protein YjiA  30.11 
 
 
318 aa  109  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04184  hypothetical protein  30.11 
 
 
318 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60920  hypothetical protein  30.16 
 
 
334 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3714  putative GTP-binding protein YjiA  30.11 
 
 
318 aa  109  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  32.48 
 
 
379 aa  109  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04218  predicted GTPase  30.11 
 
 
318 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3717  cobalamin synthesis protein/P47K  36.27 
 
 
379 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4892  putative GTP-binding protein YjiA  30.11 
 
 
318 aa  109  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1948  cobalamin synthesis protein/P47K  34.42 
 
 
349 aa  110  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.871457  normal  0.448238 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4944  putative GTP-binding protein YjiA  30.11 
 
 
318 aa  109  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3645  cobalamin synthesis protein P47K  30.11 
 
 
318 aa  109  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4572  putative GTP-binding protein YjiA  30.11 
 
 
318 aa  109  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0580  putative GTP-binding protein YjiA  29.24 
 
 
320 aa  109  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  39.79 
 
 
337 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  29.68 
 
 
341 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0637  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  30.28 
 
 
335 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0708  cobalamin synthesis protein P47K  34.56 
 
 
362 aa  108  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  38.55 
 
 
322 aa  108  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>