55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0909 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0909  Cupin 2 conserved barrel domain protein  100 
 
 		 137 aa  276  6e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02199  hypothetical protein  55.8 
 
 		 139 aa  150  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0868  Cupin 2 conserved barrel domain protein  54.01 
 
 		 142 aa  147  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1250  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.07 
 
 		 193 aa  142  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00015051 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1726  Cupin 2 conserved barrel domain protein  62.39 
 
 		 150 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.680674  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0300  Cupin 2 conserved barrel domain protein  59.63 
 
 		 152 aa  137  4.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0895835 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16011  hypothetical protein  45.13 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3175  cupin 2 domain-containing protein  44.44 
 
 		 135 aa  103  9e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2224  hypothetical protein  45.65 
 
 		 166 aa  101  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1610  cupin 2, barrel  43.2 
 
 		 143 aa  97.8  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000344419 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2532  Cupin 2 conserved barrel domain protein  42.99 
 
 		 178 aa  87.8  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1978  cupin 2 domain-containing protein  39.01 
 
 		 144 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1831  Cupin 2 conserved barrel domain protein  37.4 
 
 		 149 aa  84.7  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137972  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3293  cupin 2 domain-containing protein  36.43 
 
 		 141 aa  84.3  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.661006 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1314  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.56 
 
 		 166 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000442476  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1350  cupin 2 domain-containing protein  35.77 
 
 		 147 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.687777  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0623  cupin 2 domain-containing protein  35.38 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.339889  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2380  Cupin 2 conserved barrel domain protein  35.77 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3656  cupin 2, barrel  36.09 
 
 		 148 aa  72  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.110053  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0594  hypothetical protein  35.66 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13891  hypothetical protein  35.66 
 
 		 143 aa  70.5  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3496  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.88 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2628  cupin 2 domain-containing protein  38.89 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.074736  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1506  hypothetical protein  29.13 
 
 		 141 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10991  double-stranded beta-helix domain-containing protein  34.91 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00650  hypothetical protein  33.64 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0053  hypothetical protein  33.64 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1204  hypothetical protein  30.77 
 
 		 156 aa  54.7  0.0000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.259392  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12421  hypothetical protein  25.93 
 
 		 141 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1633  hypothetical protein  29.1 
 
 		 141 aa  51.2  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_13991  hypothetical protein  26.4 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4530  cupin 2 domain-containing protein  29.55 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.812738  normal  0.896938 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0597  hypothetical protein  25.6 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.403415  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2157  cupin 2, barrel  33.72 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0974853 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2205  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.82 
 
 		 141 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2654  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.3 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.810725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5450  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.03 
 
 		 137 aa  47.4  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341388 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0998  hypothetical protein  38.89 
 
 		 142 aa  47  0.00009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1491  cupin:protein of unknown function DUF861  32.1 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2329  Cupin 2 conserved barrel domain protein  28.3 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0016638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16041  hypothetical protein  24.04 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3906  cupin 2 domain-containing protein  32.98 
 
 		 133 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000227782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1605  cupin 2, barrel  33.33 
 
 		 127 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.843392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4460  Cupin 2 conserved barrel domain protein  30.15 
 
 		 140 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0766179  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4123  hypothetical protein  27.45 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.685288  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2440  hypothetical protein  25 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0542121  normal  0.878166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5381  Cupin 2 conserved barrel domain protein  25.37 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1578  cupin region  31.91 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.489903  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2932  Cupin 2 conserved barrel domain protein  27.91 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6639  cupin 2 domain-containing protein  30.21 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0292958  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3737  cupin 2 domain-containing protein  29.79 
 
 		 135 aa  40.8  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.107824  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5430  Cupin 2 conserved barrel domain protein  31.71 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5795  cupin 2 domain-containing protein  30.85 
 
 		 135 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.732811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5578  cupin 2 domain-containing protein  31.91 
 
 		 134 aa  40  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1767  cupin 2, barrel  28.09 
 
 		 127 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0773162  normal  0.597439 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>