169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0903 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0903  zinc transporter ZupT  100 
 
 
298 aa  594  1e-169  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.373127  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1320  zinc transporter ZupT  71.19 
 
 
298 aa  416  9.999999999999999e-116  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00680166  hitchhiker  0.00681091 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0206  zinc transporter ZupT  70.57 
 
 
300 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0874805  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2825  zinc transporter ZupT  69.33 
 
 
298 aa  393  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0856  zinc transporter ZupT  67.01 
 
 
289 aa  372  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000612212  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3555  zinc transporter ZupT  58.5 
 
 
271 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.0000000000223536  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2971  zinc transporter ZupT  54.79 
 
 
277 aa  291  9e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  52.01 
 
 
268 aa  286  4e-76  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07430  zinc/iron permease  48.43 
 
 
272 aa  282  5.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0717  zinc transporter ZupT  52.54 
 
 
279 aa  261  8e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0000000126072  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0290  zinc transporter ZupT  50.84 
 
 
291 aa  260  2e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0313  zinc transporter ZupT  50.34 
 
 
291 aa  259  3e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0920658  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0908  zinc transporter ZupT  49.29 
 
 
266 aa  257  2e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.855869  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1174  zinc/iron permease  47.95 
 
 
281 aa  257  2e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.371558  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1152  zinc transporter ZupT  47.52 
 
 
266 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1456  zinc transporter ZupT  48.21 
 
 
267 aa  242  6e-63  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.556549  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0448  zinc/iron permease  44.93 
 
 
265 aa  226  2e-58  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000257065  hitchhiker  0.0000000301064 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1483  zinc/iron permease  45.61 
 
 
270 aa  227  2e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.287328  normal  0.134401 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22030  predicted divalent heavy-metal cations transporter  43.21 
 
 
275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.895881  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2676  zinc transporter ZupT  41.16 
 
 
269 aa  215  8e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.264874 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2670  zinc transporter ZupT  39.86 
 
 
258 aa  190  2.9999999999999997e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000324662  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_52343  iron permease 1  42.37 
 
 
265 aa  176  3e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0298528  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_22166  predicted protein  38.18 
 
 
280 aa  174  9.999999999999999e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00107582  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42358  ZIP family transporter: zinc ion  40.14 
 
 
269 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.505528 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15590  predicted divalent heavy-metal cations transporter  38.31 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0273955  n/a   
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38445  predicted protein  52.2 
 
 
390 aa  152  5e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.261739  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0568  zinc transporter ZupT  35.34 
 
 
252 aa  150  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.181834  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  34.41 
 
 
255 aa  145  7.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  33.1 
 
 
253 aa  138  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  33.45 
 
 
257 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  33.45 
 
 
257 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  33.45 
 
 
257 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  33.45 
 
 
257 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  33.45 
 
 
257 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02912  zinc transporter ZupT  33.1 
 
 
257 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0661  zinc/iron permease  33.1 
 
 
257 aa  133  3e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4353  zinc transporter ZupT  33.1 
 
 
257 aa  133  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00000140214  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02862  hypothetical protein  33.1 
 
 
257 aa  133  3e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3217  zinc transporter ZupT  33.1 
 
 
257 aa  133  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.5422e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3504  zinc transporter ZupT  33.1 
 
 
257 aa  133  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000224726  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0658  zinc transporter ZupT  33.1 
 
 
257 aa  133  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.46164 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3337  zinc transporter ZupT  33.1 
 
 
257 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.991489  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  32.07 
 
 
257 aa  132  7.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26405  predicted protein  49.01 
 
 
188 aa  126  5e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0159507  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12811  ZIP family transporter: zinc ion  27.97 
 
 
232 aa  102  5e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0345434  normal  0.714203 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  30.07 
 
 
251 aa  99  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0036  zinc/iron permease  30.74 
 
 
247 aa  93.6  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0208  zinc/iron permease  29.15 
 
 
269 aa  91.3  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.478364  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1761  zinc/iron permease  25.68 
 
 
269 aa  88.6  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.209568  normal  0.0390334 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  29.29 
 
 
270 aa  87  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0830  zinc/iron permease  31.65 
 
 
271 aa  86.3  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2417  ZIP zinc transporter family protein  28.21 
 
 
279 aa  85.9  7e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  29.57 
 
 
271 aa  85.5  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5198  zinc/iron permease  28.37 
 
 
286 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  28.47 
 
 
305 aa  84.3  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6528  predicted protein  39.06 
 
 
125 aa  84.3  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.8441  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  28.52 
 
 
239 aa  84.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1051  zinc/iron permease  27.59 
 
 
246 aa  83.6  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1497  zinc/iron permease  25.62 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.265438  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  31.12 
 
 
271 aa  82.8  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0414  zinc/iron permease  23.99 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1916  zinc/iron permease  29.76 
 
 
270 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2912  zinc/iron permease  29.33 
 
 
264 aa  80.9  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1779  zinc/iron permease  29.32 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  27.33 
 
 
272 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  30.03 
 
 
271 aa  80.5  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  28.18 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01521  zinc transporter ZupT  62.5 
 
 
77 aa  80.5  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  28.37 
 
 
244 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0781  zinc/iron permease  28 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.910074  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  27.7 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1139  hypothetical protein  34.29 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.854966  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  28.22 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  25.18 
 
 
247 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  28.52 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  28.52 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1977  hypothetical protein  29.6 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  25.86 
 
 
271 aa  75.5  0.0000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0870  zinc/iron permease  27.89 
 
 
290 aa  75.5  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  27.76 
 
 
268 aa  74.7  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  30.11 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  29.47 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  29.47 
 
 
245 aa  73.6  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1038  zinc/iron permease  28.21 
 
 
254 aa  73.6  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.350201  normal  0.90903 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2509  zinc/iron permease  26.6 
 
 
259 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  29.18 
 
 
304 aa  72.8  0.000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65571  vacuolar Zn-iron permease  33.58 
 
 
499 aa  73.2  0.000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.870397 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0854  zinc/iron permease  27.76 
 
 
243 aa  72.4  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2663  zinc/iron permease  29.68 
 
 
300 aa  72.4  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0744572  normal  0.129144 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  28.41 
 
 
246 aa  72  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  29.59 
 
 
262 aa  71.6  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1728  ZIP zinc transporter family protein  28.05 
 
 
277 aa  70.5  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0265073  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  26.09 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  27.34 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  26.09 
 
 
308 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2925  GufA protein  24.41 
 
 
273 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0386986  hitchhiker  0.00221874 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0095  zinc/iron permease  30.66 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.983105  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  24.38 
 
 
264 aa  68.2  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  28.88 
 
 
312 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  26.24 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>