162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0889 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0889  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  538  9.999999999999999e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.189152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0201  TPR repeat-containing protein  36.07 
 
 		 275 aa  86.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000441439  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0772  tol-pal system protein YbgF  35.98 
 
 		 285 aa  85.9  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0818446 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0641  tol-pal system protein YbgF  33.56 
 
 		 232 aa  85.5  7e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000302592  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3515  tol-pal system protein YbgF  32.58 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000012222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3584  tol-pal system protein YbgF  33.61 
 
 		 283 aa  82.8  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2227  hypothetical protein  35.38 
 
 		 265 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  33.1 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0023  TPR domain-containing protein  35.16 
 
 		 278 aa  79.7  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.165753  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0500  tol-pal system protein YbgF  34.45 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0465  TPR repeat-containing protein  30.38 
 
 		 377 aa  77  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1580  TPR domain-containing protein  36.21 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0635876  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1158  TPR repeat-containing protein  37.17 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.188926  normal  0.17642 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0590  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 		 294 aa  73.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3542  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 271 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000161801  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2020  hypothetical protein  35.9 
 
 		 322 aa  70.5  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2025  hypothetical protein  35.04 
 
 		 322 aa  70.1  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1114  tol-pal system protein YbgF  27.01 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.875403  normal  0.0458265 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2973  TPR domain-containing protein  31.69 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.485874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1096  hypothetical protein  35.25 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.2221  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0568  tol-pal system protein YbgF  36.04 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.124562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0240  hypothetical protein  29.37 
 
 		 278 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3038  TPR domain-containing protein  33.08 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000166415  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0473  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 350 aa  67  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0955872  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2208  Tol-Pal system YbgF  34.55 
 
 		 275 aa  67  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00178877  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  32.5 
 
 		 487 aa  66.2  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  30.41 
 
 		 236 aa  65.5  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2219  tetratricopeptide domain-containing protein  31.62 
 
 		 252 aa  64.7  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85463  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2124  Tol-Pal system YbgF  37.25 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.186495  normal  0.327311 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0263  tol-pal system protein YbgF  33.68 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.067735 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2145  TPR domain-containing protein  25.41 
 
 		 335 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0848355  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  32 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0484  tol-pal system protein YbgF  28.12 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0826  tol-pal system protein YbgF  34.09 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000523116  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1279  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 270 aa  62  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.131544  normal  0.407975 
 
 
-
 
NC_004310  BR1693  hypothetical protein  30.69 
 
 		 488 aa  61.6  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1637  TPR repeat-containing molluscan rhodopsin  30.69 
 
 		 488 aa  61.2  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  27.19 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1237  TPR repeat-containing protein  26.21 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.638629  normal  0.0592665 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3624  tol-pal system protein YbgF  32.54 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0410  hypothetical protein  34.02 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000196847  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4051  hypothetical protein  32.46 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1396  tetratricopeptide TPR_2  24.71 
 
 		 261 aa  58.9  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000108782  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3198  tol-pal system protein YbgF  33.33 
 
 		 329 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0147  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3493  tol-pal system protein YbgF  37.97 
 
 		 328 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.250731  normal  0.0902147 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1158  tol-pal system protein YbgF  29.31 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3169  tetratricopeptide TPR_2  27.93 
 
 		 334 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.36621  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3269  tol-pal system protein YbgF  28.76 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00753149  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0951  tol-pal system protein YbgF  31.85 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.246385  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0537  tol-pal system protein YbgF  28 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1070  hypothetical protein  31.85 
 
 		 271 aa  57.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.387649  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2196  Tol-Pal system YbgF  30.97 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.114347  normal  0.506103 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1221  Tol-Pal system YbgF  31.18 
 
 		 505 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1251  tol-pal system protein YbgF  31.03 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000656344  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01566  tol-pal system protein YbgF, putative  29.82 
 
 		 268 aa  57  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.405212  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51690  hypothetical protein  29.13 
 
 		 274 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128207  hitchhiker  0.000871943 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2625  Tol-Pal system YbgF  36.47 
 
 		 345 aa  55.5  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3085  tol-pal system protein YbgF  29.36 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00002995  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1464  hypothetical protein  26.11 
 
 		 245 aa  55.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000013069  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36620  tol-pal system YbgF-like protein  28.35 
 
 		 273 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3970  hypothetical protein  30 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.178755  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1417  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1855  tetratricopeptide TPR_2  31.03 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3117  tol-pal system protein YbgF  26.12 
 
 		 272 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.35815  normal  0.68716 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2900  tol-pal system protein YbgF  27.78 
 
 		 272 aa  53.5  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000143705  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4534  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 274 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  25.31 
 
 		 262 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  25.31 
 
 		 262 aa  53.5  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0388  tol-pal system protein YbgF  25 
 
 		 325 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.0022084  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  25.31 
 
 		 262 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  25.31 
 
 		 262 aa  53.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2694  tol-pal system protein YbgF  28.81 
 
 		 249 aa  52.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.799703  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1224  hypothetical protein  27.56 
 
 		 268 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.899362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4194  tol-pal system protein YbgF  27.56 
 
 		 268 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.90283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1709  tol-pal system protein YbgF  21.37 
 
 		 267 aa  52.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000149068  decreased coverage  0.0000715536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1315  tol-pal system protein YbgF  36.51 
 
 		 345 aa  52.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1281  tol-pal system protein YbgF  27.59 
 
 		 266 aa  52.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000295525  decreased coverage  0.00000450337 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2954  tol-pal system protein YbgF  26.72 
 
 		 269 aa  52.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000655346  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1253  Tol-Pal system, YbgF  27.56 
 
 		 268 aa  52.4  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0226612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2866  tol-pal system protein YbgF  26.72 
 
 		 269 aa  52.4  0.000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  4.8827e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1399  tol-pal system protein YbgF  26.72 
 
 		 269 aa  52.4  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000306098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2017  tol system periplasmic component  29.31 
 
 		 305 aa  52  0.000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.2216  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0177  tol-pal system protein YbgF  29.31 
 
 		 300 aa  52  0.000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.46859  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1231  hypothetical protein  27.35 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2746  hypothetical protein  33.33 
 
 		 250 aa  51.6  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0753  tol-pal system protein YbgF  22.3 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000204373  normal  0.160376 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3922  putative transmembrane protein  28.87 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.111011  hitchhiker  0.00736661 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0750  tol-pal system protein YbgF  25.95 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000117019  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0900  TPR repeat-containing protein  29.57 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000011862  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1725  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 261 aa  50.8  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.039074 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3991  tol-pal system protein YbgF  26.77 
 
 		 271 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.721689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6876  hypothetical protein  27.06 
 
 		 348 aa  51.2  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.617207  normal  0.0553562 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1979  tol-pal system protein YbgF  30.43 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2457  tol-pal system protein YbgF  26.8 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.184119  normal  0.990213 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2414  hypothetical protein  26.6 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0757  tol-pal system protein YbgF  27.84 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.677323  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3603  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.73 
 
 		 304 aa  49.3  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1697  tetratricopeptide domain-containing protein  27.97 
 
 		 258 aa  49.3  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000538849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>