More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0817 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0817  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 184 aa  375  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0108  transcriptional regulator, XRE family  70 
 
 		 186 aa  270  8.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2318  transcriptional regulator  61.33 
 
 		 188 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00466136  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0992  cupin 2 domain-containing protein  60 
 
 		 186 aa  225  2e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00214756  normal  0.392819 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0002  transcriptional regulator, XRE family  60.11 
 
 		 184 aa  216  2e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.138514 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0552  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 183 aa  177  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0032692  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0495  transcriptional regulator, XRE family  43.72 
 
 		 184 aa  176  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0521  cupin 2 domain-containing protein  40.44 
 
 		 184 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1398  XRE family transcriptional regulator  40.44 
 
 		 184 aa  161  6e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.365461  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0316  cupin 2 domain-containing protein  39.34 
 
 		 184 aa  159  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0609  cupin sensor transcriptional regulator  41.57 
 
 		 184 aa  158  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.176567  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0154  XRE family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 182 aa  157  6e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1243  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 184 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0587  cupin 2 domain-containing protein  39.66 
 
 		 184 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2171  transcriptional regulator  41.34 
 
 		 184 aa  148  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.809699 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1468  transcriptional regulator, XRE family  37.91 
 
 		 182 aa  142  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0100935  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17340  cupin domain-containing protein  36.72 
 
 		 186 aa  134  6.0000000000000005e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1702  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07930  cupin domain-containing protein  33.15 
 
 		 194 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.211936  normal  0.409576 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1709  transcriptional regulator, XRE family  32.04 
 
 		 193 aa  109  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17550  putative transcriptional regulator with cupin domain  31.55 
 
 		 200 aa  96.3  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0466174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1987  transcriptional regulator, XRE family  33.52 
 
 		 187 aa  94  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144245  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2505  XRE family transcriptional regulator  32.6 
 
 		 220 aa  92.8  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0474  XRE family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 192 aa  91.3  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.554508  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3298  Cro/CI family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 187 aa  91.3  8e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1702  transcriptional regulator, XRE family  35.91 
 
 		 218 aa  89  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1154  XRE family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 204 aa  89.4  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0376883  normal  0.48606 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3247  XRE family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 187 aa  87  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000592797 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0165  XRE family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 200 aa  86.3  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0311  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1985  transcriptional regulator, XRE family  30.85 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.127285  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0878  cupin 2 domain-containing protein  29.12 
 
 		 196 aa  86.3  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000206175  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2625  transcriptional regulator, XRE family  30.22 
 
 		 217 aa  86.3  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2819  MerR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 192 aa  85.9  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.142376 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02750  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.549892  normal  0.0746214 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3151  Cupin 2 conserved barrel domain protein  32.34 
 
 		 503 aa  85.5  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0650  XRE family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 187 aa  85.1  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09060  predicted transcriptional regulator  30.94 
 
 		 192 aa  85.1  6e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.391815  normal  0.265834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1879  transcriptional regulator, XRE family  30.11 
 
 		 182 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2247  transcriptional regulator, XRE family  30.48 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3035  XRE family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.348685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2732  XRE family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1309  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5912  XRE family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1819  transcriptional regulator, XRE family  30.27 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.3413 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3125  Cro/CI family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 180 aa  82.4  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.888864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5931  transcriptional regulator, XRE family  28.88 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2946  transcriptional regulator  29.19 
 
 		 197 aa  82  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0437  transcriptional regulator  30.29 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1941  transcriptional regulator  30.65 
 
 		 225 aa  82  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2320  transcriptional regulator, XRE family  30.53 
 
 		 188 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3438  XRE family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 198 aa  81.3  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2591  XRE family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 180 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1889  transcriptional regulator, XRE family  30.53 
 
 		 188 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1871  putative HTH-type transcriptional regulator  32.22 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0589891  normal  0.573197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1139  transcriptional regulator  28.89 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483755  normal  0.0958639 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5748  transcriptional regulator  29.28 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5637  transcriptional regulator, XRE family  29.28 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.76756  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6574  transcriptional regulator, XRE family  29.28 
 
 		 227 aa  79.3  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0448941 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4828  transcriptional regulator, XRE family  30.59 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0464638  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1039  MerR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 192 aa  79  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4562  transcriptional regulator, XRE family  31.18 
 
 		 173 aa  78.6  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0485  transcriptional regulator, XRE family  27.72 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000244144  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3301  XRE family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 234 aa  77.8  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0524  XRE family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000827128  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1110  Phosphate butyryltransferase  30.54 
 
 		 503 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0325  XRE family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5833  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 173 aa  77.4  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4528  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 173 aa  77  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1587  helix-turn-helix domain-containing protein  27.72 
 
 		 192 aa  76.6  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.494606  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4533  transcriptional regulator, XRE family  30 
 
 		 173 aa  75.9  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4811  XRE family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213383 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5444  XRE family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00345676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1444  cupin 2 domain-containing protein  26.34 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6009  XRE family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 219 aa  75.1  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.285081  hitchhiker  0.00726065 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2327  transcriptional regulator, XRE family  27.17 
 
 		 189 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0076  XRE family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1566  transcriptional regulator, XRE family  29.35 
 
 		 202 aa  74.3  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0862847 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5954  transcriptional regulator, XRE family  27.78 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5244  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 		 180 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.664792  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4894  XRE family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 180 aa  73.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0489002 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5615  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 		 180 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.322287  normal  0.0794813 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4613  XRE family transcriptional regulator  28 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.101875  hitchhiker  0.00323798 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0311  cupin 2 domain-containing protein  24.19 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4694  XRE family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 224 aa  72  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.607677 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3263  transcriptional regulator, XRE family  26.74 
 
 		 188 aa  72  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0450  XRE family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0079  Cro/CI family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0556  MerR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0661  MerR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3046  transcriptional regulator  28.49 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1159  putative transcription regulator protein  28.9 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0869  XRE family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 209 aa  70.9  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4986  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0943  XRE family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 182 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5358  putative transcriptional regulator, XRE family  29.03 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.406538  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5265  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2714  XRE family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4897  XRE family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5469  XRE family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0381278  normal  0.011752 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>