More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0799 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00746  excinuclease ABC subunit B  57.01 
 
 		 673 aa  766    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000144798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2863  excinuclease ABC, B subunit  57.01 
 
 		 673 aa  766    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294362  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0441  excinuclease ABC subunit B  58.28 
 
 		 668 aa  776    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3262  excinuclease ABC subunit B  63.22 
 
 		 664 aa  865    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1974  excinuclease ABC subunit B  59.82 
 
 		 671 aa  794    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.238105  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0426  excinuclease ABC subunit B  58.49 
 
 		 661 aa  781    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2201  excinuclease ABC subunit B  58.1 
 
 		 664 aa  760    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1011  excinuclease ABC subunit B  57.29 
 
 		 696 aa  771    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.771852  normal  0.613992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5272  excinuclease ABC subunit B  59.82 
 
 		 658 aa  795    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2887  excinuclease ABC subunit B  54.2 
 
 		 673 aa  754    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.149884  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1464  excinuclease ABC subunit B  58.86 
 
 		 663 aa  793    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1512  excinuclease ABC subunit B  57.66 
 
 		 940 aa  761    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2506  excinuclease ABC subunit B  57.66 
 
 		 673 aa  798    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2164  excinuclease ABC, B subunit  59.97 
 
 		 671 aa  807    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5016  excinuclease ABC subunit B  60.03 
 
 		 658 aa  802    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4845  excinuclease ABC subunit B  60.03 
 
 		 658 aa  802    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4860  excinuclease ABC subunit B  60.03 
 
 		 658 aa  802    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0880  excinuclease ABC subunit B  57.29 
 
 		 696 aa  778    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0086  excinuclease ABC subunit B  55.41 
 
 		 663 aa  760    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0074  excinuclease ABC subunit B  55.41 
 
 		 663 aa  759    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1974  excinuclease ABC subunit B  59.67 
 
 		 671 aa  805    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.292507 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0744  excinuclease ABC subunit B  55.56 
 
 		 703 aa  745    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2003  excinuclease ABC subunit B  58.44 
 
 		 690 aa  781    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.138887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1196  excinuclease ABC subunit B  57.98 
 
 		 701 aa  784    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1247  excinuclease ABC subunit B  54.57 
 
 		 678 aa  751    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.118971  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1051  excinuclease ABC subunit B  57.73 
 
 		 695 aa  785    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1568  excinuclease ABC subunit B  57.62 
 
 		 675 aa  782    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2495  excinuclease ABC subunit B  56.34 
 
 		 1032 aa  743    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.75553 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4680  excinuclease ABC subunit B  55.67 
 
 		 665 aa  765    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1920  excinuclease ABC subunit B  57.29 
 
 		 707 aa  779    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1139  excinuclease ABC subunit B  57.23 
 
 		 687 aa  754    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0652505  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1875  excinuclease ABC subunit B  60.57 
 
 		 671 aa  803    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0099  excinuclease ABC subunit B  63.08 
 
 		 667 aa  843    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5538  excinuclease ABC subunit B  57.14 
 
 		 707 aa  773    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0077  excinuclease ABC subunit B  54.68 
 
 		 679 aa  745    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.5939  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0080  excinuclease ABC subunit B  55.13 
 
 		 702 aa  752    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.935466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3219  excinuclease ABC subunit B  62.28 
 
 		 665 aa  855    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0533109  hitchhiker  0.000839421 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2096  excinuclease ABC subunit B  68.15 
 
 		 682 aa  947    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.587064  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1754  excinuclease ABC subunit B  57.54 
 
 		 678 aa  788    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5396  excinuclease ABC subunit B  60.03 
 
 		 658 aa  802    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1741  excinuclease ABC subunit B  54.37 
 
 		 679 aa  755    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0563  excinuclease ABC subunit B  57.79 
 
 		 666 aa  794    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.733421  normal  0.043063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1361  excinuclease ABC subunit B  58.28 
 
 		 695 aa  789    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1133  excinuclease ABC subunit B  57.36 
 
 		 733 aa  767    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0668171  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0251  excinuclease ABC subunit B  60.3 
 
 		 663 aa  809    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2036  excinuclease ABC subunit B  57.45 
 
 		 696 aa  782    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1275  excinuclease ABC subunit B  62.9 
 
 		 699 aa  837    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.668  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1626  excinuclease ABC subunit B  56.5 
 
 		 714 aa  770    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4146  excinuclease ABC subunit B  56.73 
 
 		 1017 aa  746    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.919849  normal  0.885523 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2175  excinuclease ABC subunit B  57.03 
 
 		 710 aa  763    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00395254  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1753  excinuclease ABC subunit B  57.42 
 
 		 666 aa  781    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4137  excinuclease ABC subunit B  56.19 
 
 		 1053 aa  737    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1320  excinuclease ABC subunit B  57.27 
 
 		 679 aa  778    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.350926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2176  excinuclease ABC subunit B  56.95 
 
 		 706 aa  764    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00882926  normal  0.14877 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3153  excinuclease ABC subunit B  56.33 
 
 		 701 aa  764    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414181 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1797  excinuclease ABC subunit B  56.25 
 
 		 676 aa  766    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000373442  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3987  excinuclease ABC subunit B  56.43 
 
 		 1047 aa  741    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.584236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1833  excinuclease ABC subunit B  57.46 
 
 		 676 aa  783    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0737  excinuclease ABC subunit B  55.35 
 
 		 662 aa  742    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1019  excinuclease ABC subunit B  57.98 
 
 		 697 aa  791    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231406  normal  0.390908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1782  excinuclease ABC subunit B  59.2 
 
 		 662 aa  789    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.753339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1890  excinuclease ABC subunit B  56.32 
 
 		 676 aa  763    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.570377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0144  excinuclease ABC subunit B  56.32 
 
 		 730 aa  753    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00842263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0275  excinuclease ABC subunit B  56.81 
 
 		 728 aa  743    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5867  excinuclease ABC subunit B  56.38 
 
 		 707 aa  764    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3001  excinuclease ABC subunit B  55.9 
 
 		 719 aa  773    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2021  excinuclease ABC subunit B  59.46 
 
 		 625 aa  745    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39565  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2963  excinuclease ABC subunit B  57.34 
 
 		 669 aa  784    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000919416  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2132  excinuclease ABC subunit B  57.49 
 
 		 928 aa  748    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0300  excinuclease ABC subunit B  56.8 
 
 		 659 aa  775    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0295  excinuclease ABC subunit B  57.01 
 
 		 659 aa  779    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.837943  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1617  excinuclease ABC subunit B  57.77 
 
 		 677 aa  793    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2678  excinuclease ABC subunit B  54.12 
 
 		 677 aa  754    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.292307 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2061  excinuclease ABC subunit B  57.66 
 
 		 673 aa  798    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000836148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1914  excinuclease ABC subunit B  57.81 
 
 		 673 aa  798    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00112158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1088  excinuclease ABC subunit B  58.95 
 
 		 675 aa  788    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2170  excinuclease ABC subunit B  55.86 
 
 		 673 aa  762    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00276805  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0251  excinuclease ABC subunit B  59.85 
 
 		 665 aa  794    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00546906  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2160  excinuclease ABC subunit B  54.67 
 
 		 721 aa  740    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2248  excinuclease ABC subunit B  56.53 
 
 		 696 aa  766    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23510  excinuclease ABC subunit B  60.15 
 
 		 670 aa  803    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672603 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0583  excinuclease ABC subunit B  55.64 
 
 		 692 aa  776    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0372  excinuclease ABC subunit B  56.69 
 
 		 673 aa  770    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1318  excinuclease ABC subunit B  56.41 
 
 		 671 aa  789    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000791691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0392  excinuclease ABC subunit B  56.11 
 
 		 669 aa  785    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1457  excinuclease ABC subunit B  57.71 
 
 		 668 aa  799    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.174778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2070  excinuclease ABC subunit B  57.02 
 
 		 693 aa  785    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.12882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2210  excinuclease ABC subunit B  56.38 
 
 		 707 aa  764    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0801  excinuclease ABC subunit B  60.3 
 
 		 691 aa  817    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.177675 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0699  excinuclease ABC subunit B  57.66 
 
 		 675 aa  778    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.301254  normal  0.648791 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2166  excinuclease ABC subunit B  57.66 
 
 		 673 aa  797    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000274119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1106  excinuclease ABC subunit B  56.04 
 
 		 705 aa  775    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.442429  normal  0.317752 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3485  excinuclease ABC subunit B  58.67 
 
 		 701 aa  820    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2837  excinuclease ABC subunit B  54.65 
 
 		 706 aa  766    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1828  excinuclease ABC subunit B  57.78 
 
 		 672 aa  779    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00277406  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3047  excinuclease ABC subunit B  55.9 
 
 		 719 aa  773    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.741685 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1082  excinuclease ABC subunit B  55.82 
 
 		 670 aa  774    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00208033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3350  excinuclease ABC subunit B  55.8 
 
 		 722 aa  766    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0910729  normal  0.613367 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1033  excinuclease ABC subunit B  57.12 
 
 		 685 aa  774    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.568445  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1529  excinuclease ABC subunit B  70.94 
 
 		 677 aa  976    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.521978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>