More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0781 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
456 aa  923    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1503  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.95 
 
 
419 aa  513  1e-144  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.690049  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1215  gamma-glutamyl phosphate reductase  66.11 
 
 
419 aa  487  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.235553 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1633  gamma-glutamyl phosphate reductase  62.44 
 
 
419 aa  484  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.565136  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0441  gamma-glutamyl phosphate reductase  61.81 
 
 
423 aa  484  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0612  gamma-glutamyl phosphate reductase  65.9 
 
 
436 aa  474  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00642668 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.38 
 
 
418 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  54 
 
 
418 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.87 
 
 
418 aa  451  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.64 
 
 
416 aa  451  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.16 
 
 
418 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.84 
 
 
418 aa  443  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.35 
 
 
434 aa  441  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.41 
 
 
419 aa  435  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.84 
 
 
418 aa  435  1e-120  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.84 
 
 
418 aa  432  1e-120  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.8 
 
 
418 aa  430  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.86 
 
 
418 aa  429  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.59 
 
 
418 aa  427  1e-118  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.03 
 
 
414 aa  426  1e-118  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.33 
 
 
418 aa  425  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.3 
 
 
418 aa  424  1e-117  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.89 
 
 
415 aa  422  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.46 
 
 
415 aa  419  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
421 aa  420  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0151  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.33 
 
 
420 aa  419  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.4 
 
 
415 aa  419  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1079  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.27 
 
 
417 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.53 
 
 
423 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.43 
 
 
427 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4268  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.62 
 
 
416 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0762  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.94 
 
 
415 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2671  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.19 
 
 
417 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.15 
 
 
426 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
418 aa  413  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.15 
 
 
426 aa  412  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4145  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.65 
 
 
413 aa  414  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.53 
 
 
446 aa  413  1e-114  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3942  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  51.92 
 
 
415 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4057  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  51.92 
 
 
415 aa  413  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
423 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.54 
 
 
419 aa  409  1e-113  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4833  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.41 
 
 
418 aa  411  1e-113  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2720  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.71 
 
 
423 aa  410  1e-113  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.857443  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.29 
 
 
423 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0431  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.56 
 
 
448 aa  411  1e-113  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.139217 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.41 
 
 
435 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3849  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  51.66 
 
 
415 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  55.74 
 
 
425 aa  408  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
423 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.93 
 
 
418 aa  410  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.41 
 
 
423 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0081  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.62 
 
 
415 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.41 
 
 
423 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0963  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.93 
 
 
437 aa  406  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0723541  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.41 
 
 
435 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3377  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
423 aa  402  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4018  hitchhiker  0.00000000120564 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.7 
 
 
423 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2831  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.37 
 
 
426 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.20532  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.7 
 
 
458 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2442  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.17 
 
 
426 aa  404  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
411 aa  405  1e-111  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4584  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.22 
 
 
436 aa  404  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.792503 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0579  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
423 aa  403  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.7 
 
 
458 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00342  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.3 
 
 
414 aa  403  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0175641  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0403  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.14 
 
 
420 aa  404  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.500866 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.3 
 
 
419 aa  403  1e-111  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.7 
 
 
458 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0425  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.65 
 
 
437 aa  403  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.7 
 
 
458 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.7 
 
 
458 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.04 
 
 
424 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.46 
 
 
423 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0269  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.08 
 
 
429 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303722  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2970  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.61 
 
 
426 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.92 
 
 
424 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3015  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.61 
 
 
415 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  47.71 
 
 
423 aa  399  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.2 
 
 
425 aa  397  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.63 
 
 
418 aa  396  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0217  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.44 
 
 
416 aa  395  1e-109  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
425 aa  396  1e-109  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1214  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.11 
 
 
423 aa  394  1e-108  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.56 
 
 
429 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3751  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.14 
 
 
430 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.634786 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2741  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.79 
 
 
426 aa  389  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.723813 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0454  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.37 
 
 
418 aa  391  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4545  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.77 
 
 
426 aa  389  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0482  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.16 
 
 
429 aa  389  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13569  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0615  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.37 
 
 
418 aa  391  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.663423  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.75 
 
 
421 aa  390  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2158  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.63 
 
 
419 aa  389  1e-107  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4285  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.67 
 
 
415 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.62 
 
 
421 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.03 
 
 
415 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0115  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.67 
 
 
415 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4238  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.67 
 
 
415 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3913  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.06 
 
 
426 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.35 
 
 
421 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>