21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0757 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0757  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  418  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.321867  normal  0.794251 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1472  hypothetical protein  35 
 
 
266 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1191  hypothetical protein  34.1 
 
 
215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000156419  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2021  hypothetical protein  35.91 
 
 
232 aa  109  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000158905  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3137  hypothetical protein  38.8 
 
 
202 aa  102  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1922  hypothetical protein  29.61 
 
 
220 aa  99  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0722012 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2094  hypothetical protein  31.67 
 
 
186 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0202879  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0895  hypothetical protein  30.1 
 
 
289 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00169761 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3499  hypothetical protein  32.6 
 
 
175 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.128517  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3948  putative CbiL protein  29.41 
 
 
197 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3208  putative CbiL protein  29.57 
 
 
197 aa  65.1  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3140  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CbiM protein  27.18 
 
 
430 aa  62  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00188953  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3435  ABC-type Co2+ transport system permease component-like protein  29.83 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.700435  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1322  hypothetical protein  25.74 
 
 
210 aa  59.7  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1366  hypothetical protein  26.13 
 
 
208 aa  58.5  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1347  hypothetical protein  31.25 
 
 
150 aa  57.8  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0331737  hitchhiker  0.0000160464 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1132  hypothetical protein  33.73 
 
 
148 aa  48.5  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.553572 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1960  hypothetical protein  25 
 
 
210 aa  48.5  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1950  hypothetical protein  24.36 
 
 
212 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3110  hypothetical protein  29.67 
 
 
112 aa  43.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000231374  normal  0.507258 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  29.73 
 
 
926 aa  42  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>