More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0713 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0713  methyltransferase small  100 
 
 		 249 aa  495  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.54079 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0705  methyltransferase small  54.29 
 
 		 268 aa  229  3e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.566489  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3501  hypothetical protein  52.19 
 
 		 275 aa  201  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  37.56 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2227  SAM-dependent methyltransferase  37.95 
 
 		 249 aa  135  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000281055  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0543  methyltransferase small  36.28 
 
 		 241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179324  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1759  hypothetical protein  41.94 
 
 		 398 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0059  methyltransferase small  32.71 
 
 		 248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0440874  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0045  SAM-dependent methyltransferases  35.48 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000698926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3911  methyltransferase type 11  33.49 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0212  methyltransferase small  28.69 
 
 		 247 aa  122  5e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3774  methyltransferase small  35.4 
 
 		 256 aa  122  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2484  hypothetical protein  50.64 
 
 		 438 aa  122  7e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1417  methyltransferase small  37.27 
 
 		 268 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.399028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3437  methyltransferase small  35.98 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0010281  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0266  hypothetical protein  32.41 
 
 		 249 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00284579  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0275  hypothetical protein  33.8 
 
 		 249 aa  116  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.343318  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0125  hypothetical protein  32.87 
 
 		 241 aa  115  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0637  hypothetical protein  35.89 
 
 		 258 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.973634  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1309  methyltransferase small  32 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0107892  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2876  putative RNA methylase:methyltransferase small  34.84 
 
 		 255 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0219603  hitchhiker  0.0000945883 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3500  methyltransferase small  38.32 
 
 		 266 aa  112  6e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.3587600000000004e-33 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1649  methyltransferase small  30.96 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0111  methyltransferase small  35.78 
 
 		 211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2743  methyltransferase small  35.65 
 
 		 245 aa  108  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.85396  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2102  methyltransferase small  29.09 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000596088  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1198  Methyltransferase type 11  32.13 
 
 		 248 aa  107  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5277  hypothetical protein  33.18 
 
 		 246 aa  107  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0237  methyltransferase type 11  35.5 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0239  methyltransferase type 11  35.5 
 
 		 216 aa  105  8e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0030  methyltransferase small  31.48 
 
 		 249 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2404  methyltransferase small  35.71 
 
 		 253 aa  105  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.773816 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2469  methyltransferase small  35.27 
 
 		 271 aa  105  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0748  N-6 adenine-specific DNA methylase  35.27 
 
 		 253 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0039  hypothetical protein  32.24 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0162  Methyltransferase type 11  30.09 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000119856  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0508  hypothetical protein  29.78 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0521  hypothetical protein  29.78 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37562  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0147  methyltransferase small domain-containing protein  30.22 
 
 		 235 aa  102  5e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0686995  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0724  O-methyltransferase  33.48 
 
 		 260 aa  100  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0330  O-methyltransferase-like protein  30.85 
 
 		 217 aa  100  2e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0032  hypothetical protein  32.24 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0039  hypothetical protein  32.24 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0033  hypothetical protein  32.24 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0030  methyltransferase  32.24 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0030  methyltransferase  32.24 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0028  methyltransferase small  30.77 
 
 		 249 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0031  hypothetical protein  32.24 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0043  hypothetical protein  32.24 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1949  UDP-MurNac-pentapeptide presynthetase  31.56 
 
 		 237 aa  100  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000302465  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0029  methyltransferase  31.13 
 
 		 246 aa  99.8  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1321  methyltransferase small  24.34 
 
 		 235 aa  99  6e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0974  O-methyltransferase  27.75 
 
 		 330 aa  99  6e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0397708  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3425  methyltransferase small  37.44 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3106  methyltransferase small  37 
 
 		 250 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.179696 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0029  hypothetical protein  30.84 
 
 		 246 aa  96.7  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5345  methyltransferase small  34.72 
 
 		 252 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1706  methyltransferase small  29.27 
 
 		 228 aa  95.1  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0151999  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1216  methyltransferase small  36.32 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.937877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1234  methyltransferase small  34.17 
 
 		 259 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0023  hypothetical protein  30.82 
 
 		 335 aa  92  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0309  DNA methylase  25.23 
 
 		 262 aa  91.3  1e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1201  O-methyltransferase  30.88 
 
 		 254 aa  91.3  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.528983  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0637  methyltransferase small  27.35 
 
 		 231 aa  89.7  4e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.947307  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1113  methyltransferase small  36.6 
 
 		 257 aa  89.4  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0516  hypothetical protein  26.58 
 
 		 233 aa  89  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.537562  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3740  methyltransferase small  31.42 
 
 		 262 aa  89  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl674  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  25.58 
 
 		 240 aa  88.6  9e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1439  hypothetical protein  26.24 
 
 		 233 aa  87  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0590  methyltransferase small  24.89 
 
 		 237 aa  85.5  7e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0779  hypothetical protein  24.89 
 
 		 254 aa  85.5  8e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.621531  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0603  hypothetical protein  25.56 
 
 		 233 aa  85.1  9e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0681  O-methyltransferase-like protein  31.53 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000217038  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3299  methyltransferase small  34.8 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.36754  normal  0.847529 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf216  predicted O-methyltransferase  25.12 
 
 		 263 aa  84  0.000000000000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.000714743  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0012  N-6 adenine-specific DNA methylases, putative  25.36 
 
 		 220 aa  84  0.000000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1524  hypothetical protein  27.19 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.930165  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0171  O-methyltransferase-like protein  27.83 
 
 		 240 aa  82.8  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000916058  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3070  methyltransferase type 11  34.25 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2351  hypothetical protein  35.75 
 
 		 257 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.114107 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0728  methyltransferase small  25.89 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121453  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1154  methyltransferase small  26.46 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1318  methyltransferase small  27.23 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0489  methyltransferase small  34.01 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2029  methyltransferase small  33.81 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.958184  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2444  hypothetical protein  25.69 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0923  conserved hypothetical protein, possible methylase  23.32 
 
 		 230 aa  77.4  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1090  methyltransferase small  37.89 
 
 		 265 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3214  methyltransferase small  32.41 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.0042849  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1375  methyltransferase small  38.22 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1585  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  32.03 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.123528  normal  0.907026 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1196  methyltransferase small  26.29 
 
 		 248 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000329272  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0948  hypothetical protein  27.27 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  31.88 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3602  hypothetical protein  27.71 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.924537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1127  methyltransferase family protein  27.71 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0453  HemK family modification methylase  31.3 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1434  O-methyltransferase-like protein  29.95 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1180  methyltransferase small  27.27 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4352  methyltransferase small  33.8 
 
 		 253 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.165994  hitchhiker  0.00950666 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>