More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0658 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  100 
 
 		 169 aa  338  2.9999999999999998e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  55.41 
 
 		 166 aa  171  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0932  CheW protein  53.47 
 
 		 165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0978481 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  53.38 
 
 		 164 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  49.01 
 
 		 163 aa  160  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  50.34 
 
 		 157 aa  159  2e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  50.34 
 
 		 164 aa  158  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  52.08 
 
 		 164 aa  158  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  52.9 
 
 		 194 aa  157  9e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  52.9 
 
 		 194 aa  157  9e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  50 
 
 		 164 aa  156  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  53.25 
 
 		 194 aa  156  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0646  putative CheW protein  50.99 
 
 		 185 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0808526  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  50.7 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  45 
 
 		 178 aa  152  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  48.3 
 
 		 169 aa  153  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0903  CheW protein  45.56 
 
 		 185 aa  152  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1144  CheW-like protein  52.52 
 
 		 184 aa  149  2e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.990234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  47.26 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0602  CheW protein  51.35 
 
 		 194 aa  149  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  48.92 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  48.63 
 
 		 167 aa  149  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1208  CheW protein  48.34 
 
 		 179 aa  148  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0917816 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0627  CheW protein  50 
 
 		 194 aa  147  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0636  CheW protein  50 
 
 		 192 aa  147  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  43.23 
 
 		 185 aa  145  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  48.92 
 
 		 187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  49.64 
 
 		 175 aa  145  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  44.52 
 
 		 185 aa  144  8.000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  43.84 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  42.31 
 
 		 181 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  46.31 
 
 		 161 aa  142  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  45.64 
 
 		 171 aa  142  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1319  CheW protein  47.52 
 
 		 179 aa  142  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.783186  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  47.02 
 
 		 163 aa  142  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  47.86 
 
 		 161 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04752  chemotaxis protein  44.94 
 
 		 171 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  41.78 
 
 		 164 aa  138  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0911  chemotaxis protein CheW  45.27 
 
 		 179 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  45.27 
 
 		 179 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  46.34 
 
 		 163 aa  136  1e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2360  putative CheW protein  43.05 
 
 		 173 aa  135  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.210142  normal  0.140243 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  46.62 
 
 		 163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3800  CheW protein  43.23 
 
 		 176 aa  134  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  44 
 
 		 169 aa  134  7.000000000000001e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  46.04 
 
 		 185 aa  133  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1566  putative CheW protein  41.83 
 
 		 169 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.173837  normal  0.497426 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  46.15 
 
 		 160 aa  131  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  45.33 
 
 		 205 aa  132  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0546  chemotaxis signal transduction protein, CheW-like  46.48 
 
 		 171 aa  130  6e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  4.32366e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2324  purine-binding chemotaxis protein CheW  43.24 
 
 		 178 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  42 
 
 		 183 aa  130  7.999999999999999e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  44.06 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1198  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  45.45 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  47.62 
 
 		 158 aa  128  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  43.36 
 
 		 174 aa  127  5.0000000000000004e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  42.11 
 
 		 163 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  45.81 
 
 		 194 aa  128  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  39.22 
 
 		 167 aa  127  7.000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  45.21 
 
 		 159 aa  127  7.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  48.2 
 
 		 147 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  40.25 
 
 		 171 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0995  chemotaxis signal transduction protein, purine binding protein, CheW-like  45.21 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000995513  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  41.72 
 
 		 164 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  39.62 
 
 		 177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  39.62 
 
 		 171 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  39.62 
 
 		 177 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  44.52 
 
 		 165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  42.94 
 
 		 165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  44.22 
 
 		 162 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1524  CheW protein  43.24 
 
 		 187 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0532774 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  42 
 
 		 156 aa  126  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  39.62 
 
 		 171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  42.66 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  42.66 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  42.66 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  42.66 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  41.25 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  42.66 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  41.25 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  41.77 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  41.25 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2003  chemotaxis protein CheW  41.25 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  42.66 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  41.25 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  41.25 
 
 		 170 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  42.66 
 
 		 175 aa  125  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0727  CheW-like protein  41.29 
 
 		 166 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.263488  normal  0.810613 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  43.54 
 
 		 163 aa  124  5e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  41.96 
 
 		 175 aa  124  5e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  47.52 
 
 		 168 aa  124  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  42.66 
 
 		 163 aa  124  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  43.24 
 
 		 162 aa  124  7e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  38.99 
 
 		 171 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  39.29 
 
 		 160 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  41.96 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  41.96 
 
 		 163 aa  123  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1129  chemotaxis protein CheW  41.94 
 
 		 158 aa  123  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127298  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  45.32 
 
 		 154 aa  123  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2175  putative CheW protein  41.5 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.207597  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>