223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0561 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0561  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 
524 aa  1066    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.899145  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1062  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  58.01 
 
 
519 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0859035  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3104  N-methylhydantoinase B/acetone carboxylase, alpha subunit  58.19 
 
 
537 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3921  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  54.05 
 
 
534 aa  568  1e-160  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.710611  normal  0.101565 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2708  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  52.41 
 
 
527 aa  525  1e-148  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1968  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  54.14 
 
 
528 aa  521  1e-146  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.302268  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1104  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  50.39 
 
 
511 aa  496  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.723439  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2462  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  51.06 
 
 
515 aa  487  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2411  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  49.13 
 
 
515 aa  483  1e-135  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.381663  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1578  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  48.28 
 
 
541 aa  456  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  45.52 
 
 
575 aa  445  1.0000000000000001e-124  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4192  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.29 
 
 
580 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0037  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  45.66 
 
 
531 aa  432  1e-119  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6188  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  49.04 
 
 
539 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.104121 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2413  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  47.07 
 
 
529 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0408738  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0727  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  44.55 
 
 
513 aa  415  1e-114  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5123  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.29 
 
 
1212 aa  411  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0650369 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1856  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  45.11 
 
 
512 aa  410  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0996976  normal  0.357949 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3534  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.56 
 
 
519 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0275589 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3345  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.78 
 
 
1258 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0277673 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_81320  5-oxoprolinase  42.75 
 
 
1309 aa  408  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1128  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  44.12 
 
 
510 aa  404  1e-111  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1926  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.52 
 
 
515 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1953  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.52 
 
 
515 aa  403  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.766968 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2177  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.34 
 
 
1206 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1376  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  44.07 
 
 
1234 aa  398  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0160979  normal  0.0483498 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1781  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.01 
 
 
1213 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0522024  normal  0.0235598 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2362  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.78 
 
 
1211 aa  392  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.811931 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2093  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.29 
 
 
1190 aa  392  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1517  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.42 
 
 
1220 aa  392  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.987172 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0378  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.92 
 
 
1226 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4976  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.42 
 
 
1210 aa  391  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6440  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  44.38 
 
 
1220 aa  391  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03972  5-oxo-L-prolinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14330)  42.55 
 
 
1274 aa  385  1e-106  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.574079 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2390  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  45.14 
 
 
1229 aa  387  1e-106  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0152868 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10270  5-oxoprolinase oplA  41.94 
 
 
1209 aa  388  1e-106  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0830899 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3807  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.06 
 
 
1206 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0637  hydantoinase/oxoprolinase family protein  41.44 
 
 
1203 aa  384  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4106  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.13 
 
 
1212 aa  382  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.264245  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2245  hydantoinase B/oxoprolinase  41.86 
 
 
518 aa  383  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0004  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.94 
 
 
1218 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.521135 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2569  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.97 
 
 
1382 aa  385  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0414  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.08 
 
 
513 aa  385  1e-105  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0681  hydantoinase/oxoprolinase family protein  41.44 
 
 
1198 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1841  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.93 
 
 
1225 aa  379  1e-104  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.854938  hitchhiker  0.00479666 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1513  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.56 
 
 
1230 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706946  normal  0.501464 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2907  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.81 
 
 
1242 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0182829 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0424  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.5 
 
 
514 aa  380  1e-104  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE05320  5-oxoprolinase, putative  41.03 
 
 
576 aa  378  1e-103  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0999  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.94 
 
 
1228 aa  377  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.291858 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3814  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.27 
 
 
1293 aa  378  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2020  hydantoinase B/oxoprolinase  39.59 
 
 
1218 aa  377  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0734  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  44.04 
 
 
1213 aa  377  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4343  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.05 
 
 
1206 aa  374  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.808871  normal  0.0662323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2407  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.98 
 
 
1205 aa  375  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.743772 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3552  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.48 
 
 
1212 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3967  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.86 
 
 
1212 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0735319 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5799  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.75 
 
 
1203 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0523355 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3290  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.7 
 
 
1217 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1518  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.92 
 
 
1222 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.307655  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1358  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.08 
 
 
1231 aa  369  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1391  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.47 
 
 
517 aa  371  1e-101  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.251897  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12616  predicted protein  40.29 
 
 
1271 aa  369  1e-101  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.747527  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2123  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.11 
 
 
1245 aa  367  1e-100  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.44593 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_42276  predicted protein  43.12 
 
 
1263 aa  368  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3295  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.37 
 
 
1220 aa  368  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4282  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.94 
 
 
1253 aa  366  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0874898  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9149  hydantoin utilization protein  39.62 
 
 
566 aa  365  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.288319  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2968  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.44 
 
 
1229 aa  365  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0467  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.99 
 
 
514 aa  364  2e-99  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.011841  hitchhiker  0.0000000457573 
 
 
-
 
NC_006685  CNC02640  cytoplasm protein, putative  40.51 
 
 
582 aa  363  4e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00578877  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2480  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.01 
 
 
1250 aa  363  6e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.74974  normal  0.020178 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1380  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.01 
 
 
1239 aa  362  9e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1599  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.15 
 
 
1215 aa  360  3e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0219304 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05652  conserved hypothetical protein  39.74 
 
 
1307 aa  355  7.999999999999999e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.620573  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3415  Hydantoinase B/oxoprolinase  37.6 
 
 
578 aa  355  1e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.41537  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3461  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.27 
 
 
1212 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.397296  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2566  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42 
 
 
1185 aa  354  2e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0131  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  41.47 
 
 
517 aa  354  2e-96  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.367473  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2574  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  43.27 
 
 
1216 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.596345 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5284  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  42.69 
 
 
1212 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.415558  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08779  conserved hypothetical protein  41.1 
 
 
1322 aa  350  3e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.772527 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3625  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  44.4 
 
 
1229 aa  350  4e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218534  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0738  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  40.67 
 
 
1279 aa  349  6e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20111  hydantoinase/oxoprolinase:hydantoinase B/oxoprolinase  40.15 
 
 
1224 aa  349  7e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6535  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  38.56 
 
 
582 aa  348  1e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.479598 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2633  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.87 
 
 
577 aa  342  7e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.286418 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4582  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.16 
 
 
577 aa  342  9e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6261  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.33 
 
 
577 aa  330  4e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0857847  normal  0.425917 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5647  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.76 
 
 
582 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.753702  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0476  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.59 
 
 
579 aa  325  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4144  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  36.69 
 
 
601 aa  324  3e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.969544  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9129  hydantoin utilization protein  34.39 
 
 
640 aa  318  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3764  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.17 
 
 
564 aa  305  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29736  5-oxoprolinase  35.75 
 
 
1319 aa  303  7.000000000000001e-81  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.434949  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8319  hydantoin utilization protein  38.24 
 
 
574 aa  300  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.113582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5989  N-methylhydantoinase B (Hydantoin utilization protein B)  36.92 
 
 
577 aa  300  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0982181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3116  Hydantoinase B/oxoprolinase  35.69 
 
 
548 aa  298  2e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.708743  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4696  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  35.31 
 
 
548 aa  296  5e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0372  5-oxoprolinase (ATP-hydrolyzing)  37.05 
 
 
616 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.014712  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>