145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0501 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0501  MltA domain protein  100 
 
 
412 aa  837    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2733  transglycosylase, putative  50.78 
 
 
412 aa  369  1e-101  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.927679  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2097  MltA domain-containing protein  52.87 
 
 
401 aa  347  3e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.166602  normal  0.237745 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0295  MltA domain protein  53.78 
 
 
381 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1420  MltA domain protein  46.79 
 
 
384 aa  292  7e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0606  MltA domain protein  41.37 
 
 
358 aa  264  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.964162  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2017  MltA  47.86 
 
 
440 aa  230  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00129045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3831  MltA domain-containing protein  44.27 
 
 
412 aa  218  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.328531  normal  0.104319 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0365  MltA domain-containing protein  38.24 
 
 
514 aa  204  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.914991  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2049  MltA domain-containing protein  46.27 
 
 
396 aa  203  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.422873  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4845  MltA domain protein  43.7 
 
 
475 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.603998  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0053  membrane-bound lytic murein transglycosylase  42.68 
 
 
399 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3704  MltA:3D  41.52 
 
 
405 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.472718 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2232  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  43.22 
 
 
400 aa  196  5.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.490009  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0055  MltA domain-containing protein  41.9 
 
 
405 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158061 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0069  MltA domain protein  46.21 
 
 
395 aa  195  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1975  hypothetical protein  32.95 
 
 
398 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1970  hypothetical protein  32.95 
 
 
396 aa  194  3e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2677  MltA domain-containing protein  40.6 
 
 
341 aa  192  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.345131 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0057  MltA domain protein  45.08 
 
 
395 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2635  MltA  42.91 
 
 
421 aa  190  4e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1240  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  42.34 
 
 
341 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1025  transglycosylase, putative  43.28 
 
 
399 aa  189  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0119  MltA domain protein  40.48 
 
 
386 aa  189  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0707409 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0880  MltA:3D  42.91 
 
 
403 aa  188  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2901  MltA domain-containing protein  42.34 
 
 
341 aa  188  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.249493  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0484  MltA domain-containing protein  40.22 
 
 
416 aa  187  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5273  MltA  39.39 
 
 
402 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542778  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0287  MltA domain protein  41.04 
 
 
405 aa  183  6e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.797874  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1211  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  32.95 
 
 
404 aa  182  7e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.632654  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0494  MltA domain-containing protein  41.82 
 
 
383 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3112  MltA domain-containing protein  42.44 
 
 
382 aa  179  5.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.830708 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2144  MltA domain protein  38.43 
 
 
356 aa  179  5.999999999999999e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3662  MltA domain protein  36.99 
 
 
418 aa  178  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48520  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  39.93 
 
 
385 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000207292  normal  0.163378 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4166  putative membrane-bound lytic murein transglycolase A  40.75 
 
 
386 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0583  MltA  39.65 
 
 
407 aa  178  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0658317  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4971  MltA domain protein  38.98 
 
 
392 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4844  MltA domain-containing protein  38.26 
 
 
392 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2411  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5020  MltA domain-containing protein  38.64 
 
 
383 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.946608 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0300  MltA  39.13 
 
 
542 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1995  transglycosylase-related protein  38.75 
 
 
362 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2075  transglycosylase-related protein  38.75 
 
 
369 aa  174  3.9999999999999995e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4085  MltA domain-containing protein  33.33 
 
 
395 aa  173  3.9999999999999995e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000353348  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2446  MltA  39.33 
 
 
397 aa  171  2e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3444  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  39.55 
 
 
342 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0190  MltA  39.18 
 
 
338 aa  171  3e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.386735  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2981  MltA domain-containing protein  40.7 
 
 
413 aa  171  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3607  murein degrading transglycosylase protein  36.39 
 
 
398 aa  170  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0108  membrane-bound lytic murein transglycosylase  36.73 
 
 
502 aa  170  5e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0364059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0118  MltA  37.09 
 
 
500 aa  170  5e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0425257  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3486  MltA  38.54 
 
 
368 aa  169  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.843085  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2854  MltA  37.31 
 
 
352 aa  169  8e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351784  normal  0.348654 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0845  MltA domain-containing protein  38.06 
 
 
365 aa  168  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0155  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  35.89 
 
 
543 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.622204 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3714  MltA domain-containing protein  40.88 
 
 
398 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.551112 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1285  MltA  37.22 
 
 
386 aa  164  3e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3217  MltA domain-containing protein  38.6 
 
 
372 aa  163  5.0000000000000005e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2694  MltA domain-containing protein  37.36 
 
 
410 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.914156  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0465  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  37 
 
 
374 aa  160  4e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0010  membrane-bound lytic murein transglycosylase  36.33 
 
 
381 aa  160  4e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3277  MltA  39.18 
 
 
374 aa  160  5e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.717533  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0936  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  38.83 
 
 
425 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.988318  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3551  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  38.83 
 
 
425 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.383635  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3578  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  38.83 
 
 
425 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1906  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  38.83 
 
 
425 aa  160  5e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.569775  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3491  MltA domain protein  37.36 
 
 
374 aa  160  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00102732  decreased coverage  0.0000391078 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2905  membrane-bound lytic murein transglycosylase A, putative  38.1 
 
 
433 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.622173  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0538  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A  38.83 
 
 
372 aa  159  7e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0177949  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3943  MltA domain protein  34.58 
 
 
372 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3570  membrane-bound lytic murein transglycosylase A  38.83 
 
 
382 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.494486  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3173  MltA  37.22 
 
 
382 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.647325  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2856  MltA domain-containing protein  37.36 
 
 
410 aa  157  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.720718 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0306  MltA domain protein  37.86 
 
 
497 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2876  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase A transmembrane protein  39.1 
 
 
380 aa  154  2e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.268076  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3018  MltA  36.09 
 
 
393 aa  154  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.707687  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3625  membrane-bound lytic murein transglycosylase  37.36 
 
 
410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.475479  normal  0.908257 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0443  MltA domain-containing protein  37.36 
 
 
410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0538  MltA domain-containing protein  37.36 
 
 
410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0510  MltA domain-containing protein  37.36 
 
 
410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.916574 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0468  MltA domain-containing protein  37.36 
 
 
374 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0646444  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0165  MltA domain protein  35.44 
 
 
376 aa  153  5.9999999999999996e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0420  MltA  36.86 
 
 
492 aa  152  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4269  MltA domain protein  38.01 
 
 
372 aa  152  8.999999999999999e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0401  membrane-bound lytic murein transglycosylase  37.23 
 
 
506 aa  152  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1254  murein transglycosylase A  35.36 
 
 
363 aa  152  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000109222  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0151  MltA domain-containing protein  34.39 
 
 
375 aa  152  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.585633  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2567  MltA  37 
 
 
409 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3118  MltA domain protein  38.35 
 
 
380 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.212465  normal  0.0576054 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1247  MltA domain-containing protein  36.94 
 
 
354 aa  151  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2753  MltA domain protein  38.35 
 
 
384 aa  150  3e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.0054451  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0139  MltA domain-containing protein  33.82 
 
 
400 aa  149  6e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0999  MltA domain protein  40.15 
 
 
407 aa  149  7e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4828  MltA domain-containing protein  38.63 
 
 
435 aa  149  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.368727  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1561  MltA domain-containing protein  39.35 
 
 
387 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.758822 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1680  MltA domain protein  39.13 
 
 
383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4013  MltA domain-containing protein  37.91 
 
 
402 aa  145  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1358  MltA domain protein  32.2 
 
 
386 aa  145  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1840  MltA domain protein  39.41 
 
 
418 aa  144  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290365  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3363  MltA domain protein  37.91 
 
 
380 aa  145  2e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.894208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>