82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0419 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0419  Formate dehydrogenase  100 
 
 		 382 aa  786    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2346  Formate dehydrogenase  53 
 
 		 380 aa  414  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0822  formate dehydrogenase  51.19 
 
 		 379 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.411512 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1330  formate dehydrogenase  37.67 
 
 		 370 aa  281  1e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.342648  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0980  Formate dehydrogenase  30.25 
 
 		 355 aa  194  1e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000894314  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0542  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  25.4 
 
 		 387 aa  139  8.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.428653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0296  formate dehydrogenase, beta subunit (F420)  24.87 
 
 		 387 aa  138  2e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.510341  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1377  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  25.13 
 
 		 387 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00118672  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0607  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  23.94 
 
 		 387 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1144  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  25.41 
 
 		 375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.592396  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1138  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  24.86 
 
 		 375 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0924  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  25.86 
 
 		 417 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000000725534 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0195  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  26.55 
 
 		 417 aa  124  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0550447  decreased coverage  0.000288361 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0577  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  25.36 
 
 		 413 aa  122  8e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.32789 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1623  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  25.91 
 
 		 421 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0813  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  24.05 
 
 		 375 aa  120  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0577  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  23.73 
 
 		 374 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1832  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  25.26 
 
 		 425 aa  119  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000318663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1537  formate dehydrogenase, beta subunit (F420)  23.78 
 
 		 375 aa  119  9e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0761099  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1378  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  24.55 
 
 		 412 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1044  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  25.32 
 
 		 412 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0606051  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2020  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  24.03 
 
 		 414 aa  113  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1814  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  24.87 
 
 		 414 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1058  hypothetical protein  24.57 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.550841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0088  heterodisulfide reductase subunit  24.59 
 
 		 309 aa  107  5e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80358  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0462  formate dehydrogenase, beta subunit (F420)  23.6 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.522633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0028  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.78 
 
 		 314 aa  104  3e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3428  heterodisulfide reductase subunit  25.41 
 
 		 305 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0027  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.82 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1279  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  26.01 
 
 		 317 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.290847 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1562  formate dehydrogenase, beta subunit (F420)  25.45 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2022  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  22.83 
 
 		 383 aa  95.5  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.307444  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0567  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.33 
 
 		 328 aa  94  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2660  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  23.73 
 
 		 339 aa  93.6  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.403976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1380  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  24.48 
 
 		 383 aa  88.6  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0400  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  33.33 
 
 		 300 aa  86.7  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0852  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit domain protein  24.84 
 
 		 318 aa  86.3  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1797  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.05 
 
 		 268 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.812757  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1031  hydrogenase, iron-sulfur binding protein, putative  36.36 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1355  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  21.31 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.420984  normal  0.358131 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3237  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit-like  23.06 
 
 		 392 aa  83.2  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0217745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0146  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.14 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0139  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  25.14 
 
 		 314 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0866  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22.74 
 
 		 308 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0147  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.94 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3585  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.94 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1331  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.36 
 
 		 318 aa  81.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1972  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.33 
 
 		 316 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1111  hydrogenase, iron-sulfur binding protein, putative  31.65 
 
 		 276 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.346236 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17790  4Fe-4S protein  34.25 
 
 		 284 aa  78.6  0.0000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1198  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.94 
 
 		 277 aa  77.4  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.94097  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1211  hydrogenase, iron-sulfur cluster-binding subunit, putative  31.97 
 
 		 323 aa  77  0.0000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0814  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  22.32 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000592821 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0829  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  22.39 
 
 		 494 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.330153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2313  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.84 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0194  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  26.84 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2101  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  25.17 
 
 		 482 aa  74.7  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.212274  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2147  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.58 
 
 		 261 aa  73.9  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1258  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.42 
 
 		 276 aa  73.6  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1304  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.48 
 
 		 276 aa  72.8  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0325  methyl-viologen-reducing hydrogenase delta subunit  22.67 
 
 		 501 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.393409 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3528  hydrogenase, iron-sulfur cluster-binding subunit, putative  30.08 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3419  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  27.78 
 
 		 352 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3482  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.78 
 
 		 352 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0532647 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3430  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.78 
 
 		 352 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.259101  normal  0.252658 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1330  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  24.4 
 
 		 344 aa  50.8  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3529  hydrogenase, putative  26.56 
 
 		 362 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4500  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.35 
 
 		 395 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0568  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  22.92 
 
 		 342 aa  45.8  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1015  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.42 
 
 		 389 aa  46.2  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00582823 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04360  Soluble hydrogenase, alpha or beta chain  25.29 
 
 		 382 aa  45.4  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157479  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1134  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  22.1 
 
 		 375 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0260075  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2586  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  26.53 
 
 		 379 aa  44.7  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0083  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  22 
 
 		 339 aa  44.3  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.249908  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1260  hypothetical protein  24.59 
 
 		 373 aa  44.3  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.62411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1212  hydrogenase, putative  27.48 
 
 		 359 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2664  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  21.93 
 
 		 391 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1971  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  21.99 
 
 		 350 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2246  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.41 
 
 		 325 aa  43.5  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0736  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  27.66 
 
 		 857 aa  43.5  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.200511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1125  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.61 
 
 		 327 aa  42.7  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07500  aldo/keto reductase  56 
 
 		 376 aa  42.7  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>