291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0415 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0415  UspA domain protein  100 
 
 		 296 aa  621  1e-177  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.189257 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2342  UspA domain protein  53.85 
 
 		 304 aa  315  8e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0871  UspA domain protein  39.8 
 
 		 304 aa  228  6e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.225808  normal  0.70038 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2256  UspA domain-containing protein  41.14 
 
 		 308 aa  225  7e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  38.74 
 
 		 308 aa  217  2e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2552  UspA domain protein  38.8 
 
 		 305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  38.13 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0574  UspA domain protein  36.79 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  31.28 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  34.87 
 
 		 149 aa  82  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2941  hypothetical protein  25.76 
 
 		 296 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  30 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  27.23 
 
 		 288 aa  76.3  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  26.67 
 
 		 415 aa  75.1  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  33.55 
 
 		 149 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  28.51 
 
 		 283 aa  74.3  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  28.18 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  27.09 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  25.9 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  24.91 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  26.07 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  30.2 
 
 		 148 aa  69.3  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  27.05 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  23.57 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  26.69 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  29.3 
 
 		 280 aa  68.9  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  26.91 
 
 		 307 aa  68.9  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01350  universal stress protein  23.97 
 
 		 276 aa  68.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0267  UspA domain-containing protein  26.2 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  25.16 
 
 		 297 aa  68.9  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  30.26 
 
 		 147 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5764  hypothetical protein  25.48 
 
 		 271 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  30.07 
 
 		 151 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  29.61 
 
 		 151 aa  67  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3936  UspA domain protein  29.53 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.961196 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  26.67 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3830  universal stress family protein  26.67 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0606263 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  26.62 
 
 		 300 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1678  hypothetical protein  26.79 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0818  UspA domain-containing protein  31.54 
 
 		 151 aa  63.5  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.128659 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  29.53 
 
 		 147 aa  63.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  28 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  29.53 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  29.41 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0806  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0105953  normal  0.0334639 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  24.09 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1762  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  27.45 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  25.08 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  28.67 
 
 		 148 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  25.52 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66460  hypothetical protein  23.95 
 
 		 271 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  28.86 
 
 		 147 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  28.29 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  25.17 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  27.52 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  25.24 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  28 
 
 		 138 aa  58.5  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2551  UspA domain-containing protein  24.56 
 
 		 278 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000359822  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  27.09 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  25 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3038  hypothetical protein  30 
 
 		 147 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000975242  normal  0.515565 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  27.7 
 
 		 145 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  27.52 
 
 		 145 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  27.14 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  24.09 
 
 		 288 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3172  UspA domain protein  25.36 
 
 		 314 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356146  normal  0.679089 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  28.67 
 
 		 156 aa  57  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  24 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  25 
 
 		 289 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  27.45 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  26.99 
 
 		 289 aa  55.8  0.0000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  27.31 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2620  UspA domain protein  30.07 
 
 		 143 aa  55.8  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2145  UspA domain protein  27.84 
 
 		 295 aa  55.5  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  25.49 
 
 		 156 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  27.14 
 
 		 158 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4249  UspA domain protein  30.56 
 
 		 133 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0812  UspA domain protein  29.05 
 
 		 153 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.198754  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0761  universal stress protein UspA  29.05 
 
 		 153 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2569  UspA domain protein  26.64 
 
 		 291 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  25.5 
 
 		 150 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  28 
 
 		 138 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0554  UspA domain-containing protein  23.21 
 
 		 265 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000788361 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  28.78 
 
 		 143 aa  53.9  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  21.88 
 
 		 275 aa  53.9  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  25.36 
 
 		 152 aa  53.5  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  25.87 
 
 		 208 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  25.98 
 
 		 286 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  21.35 
 
 		 274 aa  53.9  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  25 
 
 		 159 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  27.5 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  29.26 
 
 		 291 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0953  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 143 aa  52.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  32.35 
 
 		 159 aa  52.8  0.000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  25.98 
 
 		 286 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  24.31 
 
 		 148 aa  52.4  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1567  universal stress protein  32.24 
 
 		 164 aa  52.4  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.84315  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  23.1 
 
 		 295 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>