124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0375 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0375  putative transposase  100 
 
 
160 aa  320  7e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000100064  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2535  putative transposase  99.38 
 
 
160 aa  317  3.9999999999999996e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000152425  normal  0.735712 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4452  transposase IS3/IS911 family protein  38.1 
 
 
165 aa  98.2  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000855993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2064  hypothetical protein  37.86 
 
 
148 aa  95.9  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000338924  decreased coverage  0.0000208115 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0695  transposition helper protein  39.24 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0719  transposition helper protein  39.24 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1074  transposition helper protein  39.24 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1104  transposition helper protein  39.24 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.185893  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1518  transposition helper protein  39.24 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0440245  normal  0.353489 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1906  transposition helper protein  39.24 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.126399  hitchhiker  0.00245638 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2136  transposition helper protein  39.24 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.737465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2426  transposition helper protein  39.24 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2774  transposition helper protein  39.24 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.499987  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2874  transposition helper protein  39.24 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3342  transposition helper protein  39.24 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3661  transposition helper protein  39.24 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.690061  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3764  transposition helper protein  39.24 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.988067  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3793  transposition helper protein  39.24 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4358  transposition helper protein  39.24 
 
 
157 aa  92.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0370  transposase IS3/IS911 family protein  36.25 
 
 
157 aa  90.5  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.312687 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3000  transposition helper protein  37.34 
 
 
157 aa  90.1  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2501  hypothetical protein  44.22 
 
 
171 aa  88.6  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2307  transposition helper protein  37.24 
 
 
145 aa  88.2  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01717  hypothetical protein  35.42 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02044  hypothetical protein  35.42 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02797  hypothetical protein  35.42 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02881  hypothetical protein  35.42 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04733  hypothetical protein  35.42 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04944  hypothetical protein  35.42 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05295  hypothetical protein  35.42 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05475  hypothetical protein  35.42 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05743  hypothetical protein  35.42 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05754  hypothetical protein  35.42 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06030  hypothetical protein  35.42 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06490  hypothetical protein  35.42 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06979  hypothetical protein  35.42 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07081  hypothetical protein  35.42 
 
 
145 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1540  transposase IS3/IS911 family protein  33.74 
 
 
174 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3820  transposase IS3/IS911 family protein  33.74 
 
 
174 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00160807  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01834  transposase IS3/IS911 family protein  38.04 
 
 
163 aa  84.7  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02619  transposase IS3/IS911 family protein  38.04 
 
 
163 aa  84.7  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02258  transposase IS3/IS911 family protein  38.04 
 
 
163 aa  84.7  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01832  transposase IS3/IS911 family protein  38.04 
 
 
163 aa  84.7  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3415  transposase IS3/IS911 family protein  36.84 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2336  hypothetical protein  36.94 
 
 
163 aa  79  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3412  transposase IS3/IS911 family protein  37.86 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2567  transposase IS3/IS911 family protein  37.86 
 
 
160 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1534  transposase IS3/IS911 family protein  33.11 
 
 
162 aa  79  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.200633  normal  0.785426 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1740  putative transposase  38.16 
 
 
161 aa  78.2  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.704353 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3393  transposase IS3/IS911 family protein  36.18 
 
 
167 aa  77.8  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4442  transposase IS3/IS911 family protein  36.08 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380307  normal  0.586119 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0253  transposase IS3/IS911 family protein  36.08 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0454  transposase IS3/IS911 family protein  36.08 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1096  transposase IS3/IS911 family protein  36.08 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1142  transposase IS3/IS911 family protein  36.08 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.646634  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1258  transposase IS3/IS911 family protein  36.08 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1264  transposase IS3/IS911 family protein  36.08 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1931  transposase IS3/IS911 family protein  36.08 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2048  transposase IS3/IS911 family protein  36.08 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2090  transposase IS3/IS911 family protein  36.08 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2333  transposase IS3/IS911 family protein  36.08 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2585  transposase IS3/IS911 family protein  36.08 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.664533  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2625  transposase IS3/IS911 family protein  36.08 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3062  transposase IS3/IS911 family protein  36.08 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3544  transposase IS3/IS911 family protein  36.08 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3682  transposase IS3/IS911 family protein  36.08 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4310  transposase IS3/IS911 family protein  36.08 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4319  transposase IS3/IS911 family protein  36.08 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2330  hypothetical protein  36.31 
 
 
163 aa  77  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.508693 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3797  transposition helper protein  38.35 
 
 
125 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.754875  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0129  hypothetical protein  38.12 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0729  hypothetical protein  38.12 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0817  hypothetical protein  38.12 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1253  hypothetical protein  38.12 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1941  hypothetical protein  38.12 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3142  hypothetical protein  38.12 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.457423  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4351  hypothetical protein  38.12 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2067  hypothetical protein  36.71 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2169  hypothetical protein  36.71 
 
 
166 aa  74.7  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1099  transposase IS3/IS911 family protein  40.58 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00548564  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0646  transposase IS3/IS911 family protein  40.58 
 
 
161 aa  73.9  0.0000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.000318322  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1476  hypothetical protein  36.71 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0317  hypothetical protein  35.42 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1239  hypothetical protein  35.42 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2203  hypothetical protein  35.42 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0499137  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3026  hypothetical protein  35.42 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3317  hypothetical protein  35.42 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3927  hypothetical protein  35.42 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4344  hypothetical protein  35.42 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4366  hypothetical protein  35.42 
 
 
177 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3125  transposase IS3/IS911 family protein  37.67 
 
 
165 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000279784  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0730  hypothetical protein  35.25 
 
 
166 aa  72.4  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2149  putative transposase  39.86 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.150452  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2023  transposase IS3/IS911 family protein  36.65 
 
 
166 aa  70.5  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2336  transposase IS3/IS911 family protein  36.88 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2393  ISAfe5, transposase orfA  38.3 
 
 
151 aa  68.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4152  transposition helper protein  41.49 
 
 
94 aa  68.2  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1035  transposase IS3/IS911 family protein  34.15 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3129  transposase IS3/IS911 family protein  34.15 
 
 
163 aa  67.8  0.00000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4150  transposase IS3/IS911 family protein  33.54 
 
 
163 aa  67  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>