30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0372 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0398  hypothetical protein  100 
 
 
466 aa  976  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  7.7648e-11  normal  0.524896 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0372  hypothetical protein  100 
 
 
466 aa  976  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  1.91651e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2521  hypothetical protein  98.9 
 
 
371 aa  752  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0954  hypothetical protein  95.92 
 
 
466 aa  936  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  2.01555e-10  hitchhiker  5.72086e-08 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0374  hypothetical protein  93.07 
 
 
293 aa  535  1e-151  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  7.78981e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0371  hypothetical protein  96.51 
 
 
172 aa  345  1e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  2.32238e-08  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2518  hypothetical protein  90.57 
 
 
115 aa  206  7e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.871393 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0422  hypothetical protein  26.58 
 
 
278 aa  70.1  9e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.393573  normal  0.377886 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5027  hypothetical protein  26.58 
 
 
278 aa  70.1  9e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5443  hypothetical protein  26.25 
 
 
259 aa  70.1  9e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.310016  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3568  hypothetical protein  26.58 
 
 
278 aa  70.1  9e-11  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.150276 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4374  hypothetical protein  22.2 
 
 
514 aa  67.4  5e-10  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.200864  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1074  hypothetical protein  22.65 
 
 
514 aa  67.4  5e-10  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.729157 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2196  hypothetical protein  28 
 
 
381 aa  62.8  1e-08  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.455714  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0921  hypothetical protein  22.71 
 
 
476 aa  57.4  6e-07  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  5.81224e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2232  hypothetical protein  22.71 
 
 
476 aa  57.4  6e-07  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00123188  unclonable  9.89665e-09 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0034  hypothetical protein  28.26 
 
 
173 aa  57  8e-07  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3030  hypothetical protein  27.33 
 
 
500 aa  54.3  5e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2821  hypothetical protein  26.51 
 
 
398 aa  50.8  6e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2978  hypothetical protein  28.67 
 
 
514 aa  50.4  7e-05  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0724494  hitchhiker  0.00212324 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5466  hypothetical protein  29.93 
 
 
207 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.769852  normal  0.714572 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09340  hypothetical protein  23.62 
 
 
459 aa  47  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.216212  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07130  hypothetical protein  23.62 
 
 
459 aa  47  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08430  hypothetical protein  23.62 
 
 
459 aa  47  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22880  hypothetical protein  23.62 
 
 
459 aa  47  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12010  hypothetical protein  23.62 
 
 
459 aa  47  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0722624  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09850  hypothetical protein  23.62 
 
 
459 aa  47  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08580  hypothetical protein  23.91 
 
 
459 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08590  hypothetical protein  22.34 
 
 
434 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08860  hypothetical protein  23.31 
 
 
459 aa  44.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.84305e-14  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>