17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0371 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0371  hypothetical protein  100 
 
 
172 aa  356  9e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000232238  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0954  hypothetical protein  97.67 
 
 
466 aa  350  4e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000201555  hitchhiker  0.0000000572086 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0398  hypothetical protein  96.51 
 
 
466 aa  345  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000077648  normal  0.524896 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0372  hypothetical protein  96.51 
 
 
466 aa  345  2e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000191651  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2521  hypothetical protein  95.93 
 
 
371 aa  341  2.9999999999999997e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2196  hypothetical protein  28 
 
 
381 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.455714  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4374  hypothetical protein  27.74 
 
 
514 aa  55.5  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.200864  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2978  hypothetical protein  27.22 
 
 
514 aa  53.9  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0724494  hitchhiker  0.00212324 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1074  hypothetical protein  27.22 
 
 
514 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.729157 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5027  hypothetical protein  27.61 
 
 
278 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3568  hypothetical protein  27.61 
 
 
278 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.150276 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0422  hypothetical protein  27.61 
 
 
278 aa  53.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.393573  normal  0.377886 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5443  hypothetical protein  32.39 
 
 
259 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.310016  normal  0.682845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2821  hypothetical protein  27.74 
 
 
398 aa  52.8  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3030  hypothetical protein  26.67 
 
 
500 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5466  hypothetical protein  31.11 
 
 
207 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.769852  normal  0.714572 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0034  hypothetical protein  30.3 
 
 
173 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>