More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0361 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_0361  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  100 
 
 
272 aa  559  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1898  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  54.96 
 
 
265 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00288837  normal  0.0251034 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2032  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  52.03 
 
 
283 aa  267  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000246736  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1750  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  49.62 
 
 
263 aa  249  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.497689  normal  0.0213906 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1474  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  49.06 
 
 
268 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1469  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  48.68 
 
 
268 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1505  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  48.68 
 
 
268 aa  238  8e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2878  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  48.68 
 
 
268 aa  238  8e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000434249 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2973  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  47.47 
 
 
278 aa  236  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2587  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  47.47 
 
 
285 aa  235  5.0000000000000005e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0638  sulfite synthesis pathway protein  47.19 
 
 
261 aa  232  5e-60  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.162626  normal  0.297476 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2617  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  45.62 
 
 
268 aa  227  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2791  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  44.53 
 
 
268 aa  224  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2684  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  45.15 
 
 
268 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  unclonable  0.0000412314 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13123  CysQ protein  43.07 
 
 
268 aa  222  6e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.124683  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2343  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  50.38 
 
 
269 aa  221  9e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.847006  normal  0.982736 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1427  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  44.69 
 
 
264 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.839377  normal  0.0817385 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0646  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  44.11 
 
 
251 aa  220  1.9999999999999999e-56  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1370  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  44 
 
 
273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.616067  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2232  cysQ protein  48.25 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.283489  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1440  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  44.98 
 
 
262 aa  219  5e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.022159  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1215  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  45.63 
 
 
265 aa  218  7e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1655  cysQ protein  45.08 
 
 
253 aa  217  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1320  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  44.7 
 
 
266 aa  216  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2983  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  46.18 
 
 
272 aa  215  5e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2058  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  49.06 
 
 
274 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2419  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  45.39 
 
 
284 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1649  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  44.94 
 
 
262 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2373  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  46.24 
 
 
274 aa  211  1e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000809688 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0525  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  43.96 
 
 
273 aa  209  4e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3079  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  46.56 
 
 
267 aa  209  4e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.955512  normal  0.146512 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2932  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  47.88 
 
 
276 aa  209  6e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5057  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  44.89 
 
 
287 aa  208  8e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2611  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  46.07 
 
 
271 aa  206  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3622  thioredoxin  45.19 
 
 
271 aa  206  5e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359858 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1246  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  46.51 
 
 
273 aa  203  3e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.757598  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01649  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  44.27 
 
 
266 aa  196  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.643804  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1501  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  46.27 
 
 
267 aa  196  5.000000000000001e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0817  adenosine-3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  47.49 
 
 
246 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2417  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  45.95 
 
 
277 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.620864  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0159  sulfite synthesis pathway protein  43.19 
 
 
272 aa  195  8.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02715  putative PAP (3,5 adenosine diphosphate) 3 phosphatase  44.32 
 
 
263 aa  194  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.453176  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05500  3(2),5-bisphosphate nucleotidase  44.14 
 
 
274 aa  192  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0489757  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4949  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  42.07 
 
 
275 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.19378  hitchhiker  0.0000193333 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0140  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  43.19 
 
 
266 aa  192  6e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0286  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  45.59 
 
 
272 aa  191  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0261  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  44.06 
 
 
266 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.014346 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2172  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  43.98 
 
 
269 aa  190  2.9999999999999997e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.244558  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0276  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  44.06 
 
 
272 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4717  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  41.11 
 
 
270 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.957777  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1404  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  43.12 
 
 
266 aa  187  1e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.19036  normal  0.16729 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4345  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  41.26 
 
 
270 aa  187  1e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0764752  normal  0.270175 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5401  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  42.91 
 
 
269 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0394  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  41.13 
 
 
272 aa  186  3e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.861992  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2300  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  41.41 
 
 
265 aa  186  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.237358  normal  0.187754 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4940  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  40.44 
 
 
280 aa  185  6e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0020  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  44.44 
 
 
286 aa  183  3e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0134954  normal  0.230148 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3574  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  41.41 
 
 
265 aa  183  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0645111  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0130  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  42.01 
 
 
270 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.835537 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0285  3(2),5 -bisphosphate nucleotidase  41.33 
 
 
275 aa  179  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.736808  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0157  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  40.15 
 
 
269 aa  179  4e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00114057  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2651  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  39.16 
 
 
255 aa  179  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0131852  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1672  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  44.49 
 
 
282 aa  178  8e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0715  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  42.03 
 
 
277 aa  178  8e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0819  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  42.59 
 
 
274 aa  178  9e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0215  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  41.47 
 
 
265 aa  176  5e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4187  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  41.85 
 
 
270 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0013  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  39.3 
 
 
265 aa  175  6e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0129118  normal  0.641907 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0170  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  42.22 
 
 
270 aa  175  7e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68370  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  41.73 
 
 
273 aa  175  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00165193  normal  0.391986 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0172  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  41.85 
 
 
270 aa  175  8e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.126779 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0165  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  42.22 
 
 
270 aa  175  8e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.462598 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0170  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  42.22 
 
 
270 aa  175  8e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0125589  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0191  cysQ protein  42.22 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5915  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  41.73 
 
 
270 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0118  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  40.67 
 
 
269 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3548  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  41.7 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2753  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  40.46 
 
 
264 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.983862  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0168  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  41.48 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0784  adenosine-3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  47.31 
 
 
246 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.186913  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001881  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  38.55 
 
 
275 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0712  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  39.93 
 
 
271 aa  171  1e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2295  cysQ protein  41.3 
 
 
275 aa  171  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3630  adenosine-3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  45.95 
 
 
246 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1161  3'-phosphadenosine 5'-phosphosulfate 3'-phosphatase  40.84 
 
 
264 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.89318  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2822  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  40.84 
 
 
264 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.89166  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1396  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  43.31 
 
 
256 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0294905  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3775  adenosine-3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  45.95 
 
 
246 aa  170  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3957  adenosine-3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  45.95 
 
 
246 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3421  adenosine-3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  44.74 
 
 
246 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1466  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  39.93 
 
 
271 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0137  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  38.2 
 
 
278 aa  169  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00612  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  38.18 
 
 
275 aa  169  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2912  protein CysQ  40.38 
 
 
272 aa  169  5e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3778  3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  45.56 
 
 
246 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04086  PAPS (adenosine 3'-phosphate 5'-phosphosulfate) 3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  45.17 
 
 
246 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.95878  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04049  hypothetical protein  45.17 
 
 
246 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4694  adenosine-3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  45.17 
 
 
246 aa  167  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3792  adenosine-3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  45.17 
 
 
246 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4468  adenosine-3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase  45.17 
 
 
246 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>